247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1619 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1619  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  100 
 
 		 436 aa  831    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1387  major facilitator superfamily transport protein  47.53 
 
 		 468 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0294045  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1702  Na+/melibiose symporter and related transporter protein  41.36 
 
 		 445 aa  268  1e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.574642  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0726  major facilitator transporter  41.87 
 
 		 468 aa  256  7e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1070  major facilitator transporter  38.14 
 
 		 471 aa  242  9e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3120  major facilitator transporter  33.56 
 
 		 472 aa  222  9.999999999999999e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.448872  normal  0.243798 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2105  sodium:galactoside symporter family protein  31.97 
 
 		 443 aa  215  9.999999999999999e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.366774  normal  0.477059 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0353  major facilitator transporter  33.41 
 
 		 464 aa  212  7.999999999999999e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.939472  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2613  sodium:galactoside symporter family protein  33.79 
 
 		 453 aa  201  3e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.777957  normal  0.0752663 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0575  major facilitator transporter  33.48 
 
 		 461 aa  196  7e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2611  major facilitator transporter  32.51 
 
 		 480 aa  195  1e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.803344  normal  0.0185611 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0269  major facilitator transporter  30.92 
 
 		 506 aa  184  3e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1893  major facilitator superfamily MFS_1  34.79 
 
 		 440 aa  182  9.000000000000001e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0494  major facilitator transporter  38.18 
 
 		 407 aa  173  5.999999999999999e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.520669 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1586  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  34.61 
 
 		 453 aa  154  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1919  major facilitator transporter  31.25 
 
 		 461 aa  149  9e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1057  putative symporter protein  36.46 
 
 		 514 aa  145  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.872646  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1453  major facilitator superfamily transporter  35.33 
 
 		 452 aa  142  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.722152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2614  major facilitator transporter  32.51 
 
 		 463 aa  139  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.106443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0232  sodium:galactoside symporter family protein  34.15 
 
 		 435 aa  127  3e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.626751 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6100  sodium:galactoside symporter family protein  31.36 
 
 		 431 aa  124  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0503744  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0466  sodium:galactoside symporter family protein  32.22 
 
 		 428 aa  116  7.999999999999999e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2966  major facilitator superfamily transporter  31.96 
 
 		 439 aa  114  5e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.274258 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2906  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  27.27 
 
 		 460 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2393  major facilitator superfamily transporter  32.15 
 
 		 439 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3190  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  27.27 
 
 		 460 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.712372 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2335  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  28.49 
 
 		 476 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1406  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  27.82 
 
 		 471 aa  107  6e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.455319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0571  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  28.14 
 
 		 457 aa  106  8e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.74034  normal  0.0218606 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5882  sodium:galactoside symporter family protein  31.73 
 
 		 445 aa  104  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0255  major facilitator transporter  32.62 
 
 		 449 aa  104  4e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1545  major facilitator transporter  30.91 
 
 		 457 aa  102  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3996  major facilitator transporter  26.22 
 
 		 443 aa  100  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.14105  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0679  major facilitator transporter  23.28 
 
 		 439 aa  99.4  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000876885  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3387  major facilitator superfamily MFS_1  25.8 
 
 		 475 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0724765 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3697  sugar:cation symporter family protein  24.36 
 
 		 467 aa  98.6  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.455392  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0290  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.3 
 
 		 472 aa  98.6  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000222424  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3583  galactoside symporter  26.74 
 
 		 475 aa  98.2  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.012026 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2664  hypothetical protein  27.77 
 
 		 486 aa  97.4  5e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3149  major facilitator superfamily MFS_1  29.11 
 
 		 460 aa  96.7  8e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3858  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.87 
 
 		 469 aa  95.5  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.784369  normal  0.0678057 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2315  hypothetical protein  25.81 
 
 		 511 aa  93.6  6e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.276879  normal  0.0219591 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0248  major facilitator transporter  27 
 
 		 486 aa  93.2  8e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.135747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1344  major facilitator transporter  25 
 
 		 454 aa  92.8  1e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2697  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  27.66 
 
 		 465 aa  90.9  4e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.296513 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0764  sugar glycoside-pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  21.15 
 
 		 454 aa  90.5  5e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00819234  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15091  GPH family sugar transporter  28.91 
 
 		 448 aa  89.7  9e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0748  sodium:glactoside symporter family protein  21.15 
 
 		 454 aa  88.6  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.329176  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0576  GPH family sugar transporter  27.59 
 
 		 455 aa  88.2  3e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2284  putative cation symporter  23.31 
 
 		 461 aa  88.2  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974122 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4367  major facilitator transporter  26.28 
 
 		 493 aa  87.8  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0410  sodium:galactoside symporter family protein  30.7 
 
 		 405 aa  87.8  4e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0469682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1401  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  23.83 
 
 		 444 aa  87  6e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.738999  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3738  hypothetical protein  24.83 
 
 		 467 aa  86.7  7e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00183877  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1527  Na+/xyloside symporter  28.61 
 
 		 444 aa  86.7  7e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4018  sodium:galactoside symporter family protein  28.67 
 
 		 409 aa  85.5  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.698144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0517  major facilitator transporter  28.35 
 
 		 471 aa  84.3  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5398  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  22.3 
 
 		 471 aa  84.3  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.243683  normal  0.179969 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0657  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.19 
 
 		 465 aa  84  0.000000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.242235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2993  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.79 
 
 		 475 aa  83.6  0.000000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.624539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1831  major facilitator transporter  28.63 
 
 		 430 aa  83.6  0.000000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.612991  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3732  sugar:cation symporter family protein  22.22 
 
 		 443 aa  83.2  0.000000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.170381  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0369  putative sodium:galactoside symporter family protein  28.67 
 
 		 412 aa  81.6  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0456  putative symporter YagG  23.33 
 
 		 459 aa  82.4  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0319555 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02748  cation symporter  27.13 
 
 		 462 aa  81.6  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1421  GPH family sugar transporter  28.54 
 
 		 448 aa  81.6  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1315  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  23.11 
 
 		 442 aa  80.9  0.00000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5276  major facilitator transporter  32.36 
 
 		 505 aa  80.5  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000299294 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2992  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.35 
 
 		 472 aa  80.5  0.00000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15231  GPH family sugar transporter  27.12 
 
 		 448 aa  79.7  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3335  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  23.79 
 
 		 460 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736057  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4014  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  22.12 
 
 		 466 aa  79  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.85917  normal  0.255078 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4221  major facilitator transporter  24.45 
 
 		 472 aa  79.7  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.218171  normal  0.657626 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14841  GPH family sugar transporter  26.52 
 
 		 449 aa  78.2  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1215  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.23 
 
 		 441 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.525269  normal  0.0570071 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2505  putative symporter YagG  22.58 
 
 		 442 aa  77.4  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1446  Na+/melibiose symporter and related transporters-like protein  27.8 
 
 		 448 aa  77.4  0.0000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.493361  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3708  sugar:cation symporter family protein  23.18 
 
 		 442 aa  76.6  0.0000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06480  Na+/melibiose symporter-like transporter  26.25 
 
 		 460 aa  76.3  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.610657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0733  sodium:glactoside symporter family protein  22.01 
 
 		 465 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.958172  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3985  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  23.06 
 
 		 476 aa  75.9  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.439786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3175  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  23.58 
 
 		 442 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0664881  normal  0.904255 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0894  putative GPH family sugar transporter  25.94 
 
 		 451 aa  75.5  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.351001  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2095  GPH family sugar transporter  27.21 
 
 		 442 aa  75.1  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0997  Na+/melibiose symporter and related transporters-like  27.67 
 
 		 475 aa  75.9  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.281913  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1647  major facilitator superfamily MFS_1  28.33 
 
 		 495 aa  75.1  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.187163  hitchhiker  0.001175 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1130  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  23.58 
 
 		 441 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2941  hypothetical protein  22.42 
 
 		 488 aa  75.1  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000189164  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3075  Na+/melibiose symporter and related transporters-like protein  27.31 
 
 		 482 aa  74.3  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.818183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2853  sugar transporter  25 
 
 		 485 aa  74.7  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.563006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1146  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  23.4 
 
 		 442 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1182  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  22.78 
 
 		 441 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.020658  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17501  GPH family sugar transporter  25.94 
 
 		 467 aa  74.3  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.276796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2608  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.45 
 
 		 442 aa  73.2  0.000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0388  major facilitator transporter  24.3 
 
 		 497 aa  73.2  0.000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.991466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2049  Na+/melibiose symporter and related transporters-like protein  26.54 
 
 		 469 aa  72.4  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal  0.648168 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0459  major facilitator transporter  26.07 
 
 		 481 aa  72  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3565  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  27.1 
 
 		 447 aa  72  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.117988  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4954  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  22.54 
 
 		 463 aa  72.4  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0843133  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1395  hypothetical protein  23.69 
 
 		 443 aa  71.6  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00525698 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>