246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8054 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8054  Na+/melibiose symporter and related transporter- like protein  100 
 
 		 460 aa  899    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0444125  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2816  major facilitator superfamily protein  56.83 
 
 		 459 aa  489  1e-137  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3996  major facilitator transporter  42.49 
 
 		 443 aa  318  2e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.14105  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0388  major facilitator transporter  46.07 
 
 		 497 aa  304  2.0000000000000002e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.991466  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0272  major facilitator superfamily MFS_1  45.58 
 
 		 474 aa  302  7.000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0459  major facilitator transporter  45.16 
 
 		 481 aa  278  2e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3770  major facilitator superfamily MFS_1  47.28 
 
 		 420 aa  253  7e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00377745  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22670  Na+/melibiose symporter-like transporter  40.34 
 
 		 453 aa  246  8e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3372  major facilitator superfamily MFS_1  39.76 
 
 		 457 aa  244  1.9999999999999999e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0546081  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1647  major facilitator superfamily MFS_1  35.92 
 
 		 495 aa  234  3e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.187163  hitchhiker  0.001175 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3962  major facilitator superfamily MFS_1  41.2 
 
 		 455 aa  223  6e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3419  Na+/melibiose symporter and related transporter- like protein  38.81 
 
 		 456 aa  196  9e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.860481 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1406  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  29.07 
 
 		 471 aa  169  7e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.455319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3190  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  27.8 
 
 		 460 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.712372 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0571  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  29.03 
 
 		 457 aa  152  1e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.74034  normal  0.0218606 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2906  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  27.8 
 
 		 460 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3858  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  28.18 
 
 		 469 aa  151  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.784369  normal  0.0678057 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3583  galactoside symporter  27.48 
 
 		 475 aa  149  7e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.012026 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2335  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  27.95 
 
 		 476 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2191  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  28.6 
 
 		 445 aa  133  6e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2697  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  29.13 
 
 		 465 aa  132  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.296513 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1071  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  28.05 
 
 		 445 aa  129  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3387  major facilitator superfamily MFS_1  26.13 
 
 		 475 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0724765 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2622  sugar transporter, glycoside-pentoside-hexuronide  28.02 
 
 		 479 aa  124  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.455215  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0290  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  22.4 
 
 		 472 aa  118  1.9999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000222424  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5398  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  26.17 
 
 		 471 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.243683  normal  0.179969 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0576  GPH family sugar transporter  28.5 
 
 		 455 aa  115  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4221  major facilitator transporter  25.33 
 
 		 472 aa  113  7.000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.218171  normal  0.657626 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1614  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.17 
 
 		 448 aa  107  5e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0329184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4108  putative transporter  25.85 
 
 		 479 aa  105  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4954  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.67 
 
 		 463 aa  105  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0843133  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1269  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.13 
 
 		 465 aa  106  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.727469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2719  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.99 
 
 		 443 aa  104  3e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0761738  normal  0.0687051 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0048  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  25.62 
 
 		 460 aa  103  4e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0054  putative transporter  25.62 
 
 		 460 aa  103  4e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.320086 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4161  putative transporter  25.62 
 
 		 479 aa  104  4e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3868  putative transporter  25.62 
 
 		 479 aa  104  4e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3957  putative transporter  24.59 
 
 		 460 aa  104  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4000  putative transporter  25.62 
 
 		 460 aa  104  4e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.947516  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03515  predicted transporter  25.62 
 
 		 460 aa  103  5e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.371706  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3335  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  25.67 
 
 		 460 aa  103  5e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736057  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03467  hypothetical protein  25.62 
 
 		 460 aa  103  5e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.333065  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3967  putative transporter  24.59 
 
 		 460 aa  103  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.286007  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4030  putative transporter  24.59 
 
 		 460 aa  103  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4076  putative transporter  24.59 
 
 		 460 aa  103  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.591118  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3872  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  23.73 
 
 		 469 aa  103  9e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2095  GPH family sugar transporter  26.89 
 
 		 442 aa  102  1e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4645  melibiose:sodium symporter  23.27 
 
 		 476 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4645  melibiose:sodium symporter  23.27 
 
 		 476 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.752392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4554  melibiose:sodium symporter  23.27 
 
 		 476 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0456  putative symporter YagG  25.68 
 
 		 459 aa  102  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0319555 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4586  melibiose:sodium symporter  24.35 
 
 		 481 aa  102  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4563  melibiose:sodium symporter  23.27 
 
 		 476 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4694  melibiose:sodium symporter  23.27 
 
 		 476 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.772252  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03991  melibiose:sodium symporter  23.73 
 
 		 469 aa  101  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5634  melibiose:sodium symporter  24.35 
 
 		 481 aa  101  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03952  hypothetical protein  23.73 
 
 		 469 aa  101  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0657  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.42 
 
 		 465 aa  101  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.242235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5030  putative transporter  25.62 
 
 		 460 aa  101  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3907  melibiose:sodium symporter  23.73 
 
 		 473 aa  101  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4361  melibiose:sodium symporter  23.73 
 
 		 473 aa  101  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4674  melibiose:sodium symporter  23.73 
 
 		 473 aa  101  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0353  major facilitator transporter  29.16 
 
 		 464 aa  100  4e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.939472  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0733  sodium:glactoside symporter family protein  22.42 
 
 		 465 aa  100  5e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.958172  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002666  galactose permease  25.49 
 
 		 462 aa  100  7e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13771  GPH family sugar transporter  25.84 
 
 		 472 aa  100  7e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.66133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1144  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.75 
 
 		 468 aa  99.8  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3985  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  24.52 
 
 		 476 aa  97.8  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.439786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0070  putative transporter  25.06 
 
 		 464 aa  97.8  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.602143  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3708  sugar:cation symporter family protein  25.78 
 
 		 442 aa  95.5  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03762  predicted transporter  24.01 
 
 		 468 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03711  hypothetical protein  24.01 
 
 		 468 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5276  major facilitator transporter  28.43 
 
 		 505 aa  94.7  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000299294 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3697  sugar:cation symporter family protein  21.68 
 
 		 467 aa  94.4  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.455392  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2664  hypothetical protein  25.71 
 
 		 486 aa  94.4  4e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03437  putative permease  29.55 
 
 		 466 aa  94  6e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4014  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.12 
 
 		 466 aa  94  6e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.85917  normal  0.255078 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03388  hypothetical protein  29.55 
 
 		 466 aa  94  6e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0195  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.66 
 
 		 474 aa  93.6  6e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0477575 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0709  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.66 
 
 		 474 aa  93.6  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0781  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.66 
 
 		 474 aa  93.6  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3908  sugar glycoside-pentoside-hexuronide family protein  29.55 
 
 		 466 aa  93.6  7e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.845629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0162  Na+/galactoside symporter  24.79 
 
 		 468 aa  93.2  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2372  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  25.06 
 
 		 457 aa  93.2  9e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.100315  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4109  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  24.53 
 
 		 461 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4400  sugar transporter family protein  24.19 
 
 		 468 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0167  Na+/galactoside symporter  24.79 
 
 		 468 aa  92.8  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.774115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0163  Na+/galactoside symporter  24.79 
 
 		 468 aa  92.8  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0170  Na+/galactoside symporter  24.79 
 
 		 468 aa  92.8  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.671323  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0162  Na+/galactoside symporter  24.79 
 
 		 468 aa  92.8  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4951  sugar transporter, glycoside-pentoside-hexuronide family  29.55 
 
 		 466 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.841107 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5323  sugar transporter family protein  23.88 
 
 		 461 aa  91.3  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.333242 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0071  melibiose:sodium symporter  22.92 
 
 		 448 aa  91.3  3e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00245996  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0679  major facilitator transporter  24.33 
 
 		 439 aa  91.3  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000876885  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1215  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.28 
 
 		 441 aa  90.9  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.525269  normal  0.0570071 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05681  GPH family sugar transporter  31.8 
 
 		 480 aa  91.3  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4262  sugar transporter family protein  24.29 
 
 		 461 aa  91.3  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2505  putative symporter YagG  22.07 
 
 		 442 aa  90.1  7e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2284  putative cation symporter  23.94 
 
 		 461 aa  89.7  9e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974122 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2049  Na+/melibiose symporter and related transporters-like protein  27.36 
 
 		 469 aa  89.4  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal  0.648168 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>