277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2049 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2049  Na+/melibiose symporter and related transporters-like protein  100 
 
 		 469 aa  941    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal  0.648168 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0685  Na+/melibiose symporter and related transporters-like  39.55 
 
 		 455 aa  311  1e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000328828 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4367  major facilitator transporter  35.15 
 
 		 493 aa  271  2e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3738  hypothetical protein  34.89 
 
 		 467 aa  257  4e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00183877  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2680  major facilitator transporter  32.39 
 
 		 475 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4221  major facilitator transporter  31.92 
 
 		 472 aa  246  4e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.218171  normal  0.657626 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0248  major facilitator transporter  33.61 
 
 		 486 aa  244  3e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.135747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2315  hypothetical protein  30.37 
 
 		 511 aa  214  1.9999999999999998e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.276879  normal  0.0219591 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1077  major facilitator transporter  30.68 
 
 		 429 aa  169  8e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00530736 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3332  major facilitator transporter  30.23 
 
 		 429 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1406  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  28.96 
 
 		 471 aa  160  4e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.455319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3858  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  27.41 
 
 		 469 aa  155  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.784369  normal  0.0678057 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3387  major facilitator superfamily MFS_1  26.8 
 
 		 475 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0724765 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0571  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  29.72 
 
 		 457 aa  140  7e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.74034  normal  0.0218606 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3190  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  25.79 
 
 		 460 aa  136  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.712372 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0290  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.85 
 
 		 472 aa  134  3e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000222424  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2906  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  26.05 
 
 		 460 aa  133  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2335  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  29.53 
 
 		 476 aa  130  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3583  galactoside symporter  27.33 
 
 		 475 aa  126  7e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.012026 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2992  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  27.38 
 
 		 472 aa  121  3e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4954  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.4 
 
 		 463 aa  118  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0843133  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2611  major facilitator transporter  26.56 
 
 		 480 aa  119  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.803344  normal  0.0185611 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1019  major facilitator transporter  25.81 
 
 		 500 aa  112  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3075  Na+/melibiose symporter and related transporters-like protein  25.73 
 
 		 482 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.818183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2664  hypothetical protein  25.79 
 
 		 486 aa  108  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2706  hypothetical protein  26.78 
 
 		 625 aa  107  6e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2613  sodium:galactoside symporter family protein  26.59 
 
 		 453 aa  107  6e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.777957  normal  0.0752663 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2284  putative cation symporter  24.43 
 
 		 461 aa  105  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974122 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1919  major facilitator transporter  27.78 
 
 		 461 aa  104  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3697  sugar:cation symporter family protein  25.81 
 
 		 467 aa  103  5e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.455392  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0353  major facilitator transporter  30.65 
 
 		 464 aa  103  5e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.939472  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5398  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  25.28 
 
 		 471 aa  103  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.243683  normal  0.179969 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2993  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25 
 
 		 475 aa  101  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.624539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2191  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  27.94 
 
 		 445 aa  101  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3120  major facilitator transporter  25.22 
 
 		 472 aa  99.4  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.448872  normal  0.243798 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1071  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  27.61 
 
 		 445 aa  98.2  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02748  cation symporter  26.74 
 
 		 462 aa  97.4  5e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2105  sodium:galactoside symporter family protein  25.74 
 
 		 443 aa  95.9  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.366774  normal  0.477059 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0269  major facilitator transporter  27.58 
 
 		 506 aa  95.5  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41542  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2816  major facilitator superfamily protein  28.61 
 
 		 459 aa  94.4  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3985  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  25.28 
 
 		 476 aa  94  5e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.439786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2614  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 463 aa  92.4  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.106443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2853  sugar transporter  26.15 
 
 		 485 aa  92.4  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.563006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1614  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  23.59 
 
 		 448 aa  92  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0329184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4313  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  23.87 
 
 		 497 aa  90.9  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0453293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1994  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.09 
 
 		 481 aa  89.7  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00859833  hitchhiker  0.00113965 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2081  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  23.97 
 
 		 481 aa  88.6  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0834729  hitchhiker  0.000000228967 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0679  major facilitator transporter  26.71 
 
 		 439 aa  89  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000876885  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4415  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  28.51 
 
 		 552 aa  88.2  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4479  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  28.51 
 
 		 552 aa  88.2  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.176062 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0430  major facilitator transporter  27.88 
 
 		 503 aa  87.8  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0575  major facilitator transporter  27.06 
 
 		 461 aa  88.2  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8054  Na+/melibiose symporter and related transporter- like protein  27.36 
 
 		 460 aa  87.8  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0444125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1387  major facilitator superfamily transport protein  27.1 
 
 		 468 aa  87.8  4e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0294045  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2069  major facilitator superfamily MFS_1  25.97 
 
 		 432 aa  87.4  5e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350858  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0733  sodium:glactoside symporter family protein  22.08 
 
 		 465 aa  87  6e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.958172  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4339  putative permease  24.29 
 
 		 474 aa  87  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4248  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  24.29 
 
 		 472 aa  86.7  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4293  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  24.29 
 
 		 472 aa  87  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0966548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1070  major facilitator transporter  25.99 
 
 		 471 aa  86.3  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2155  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  24.14 
 
 		 471 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00011339  normal  0.022313 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1981  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  23.44 
 
 		 481 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00156524  hitchhiker  0.000367008 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2719  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.71 
 
 		 443 aa  82.4  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0761738  normal  0.0687051 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0200  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  27.55 
 
 		 544 aa  81.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2040  sugar/sodium symporter  23.06 
 
 		 479 aa  81.3  0.00000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0997  Na+/melibiose symporter and related transporters-like  26.14 
 
 		 475 aa  81.3  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.281913  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5323  sugar transporter family protein  25.51 
 
 		 461 aa  80.5  0.00000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.333242 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4109  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  25.72 
 
 		 461 aa  80.1  0.00000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03761  predicted transporter  22.43 
 
 		 467 aa  80.1  0.00000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03762  predicted transporter  26.11 
 
 		 468 aa  80.1  0.00000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03710  hypothetical protein  22.43 
 
 		 467 aa  80.1  0.00000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03711  hypothetical protein  26.11 
 
 		 468 aa  80.1  0.00000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002666  galactose permease  23.61 
 
 		 462 aa  80.1  0.00000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1592  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  23.85 
 
 		 464 aa  79.3  0.0000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00442608  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0657  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.75 
 
 		 465 aa  79.7  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.242235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4694  melibiose:sodium symporter  23.64 
 
 		 476 aa  79  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.772252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4645  melibiose:sodium symporter  23.64 
 
 		 476 aa  79  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5634  melibiose:sodium symporter  23.94 
 
 		 481 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1144  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.69 
 
 		 468 aa  79  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4406  inner membrane symporter YihP  23.99 
 
 		 460 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0907861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4563  melibiose:sodium symporter  23.64 
 
 		 476 aa  79  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4645  melibiose:sodium symporter  23.81 
 
 		 476 aa  79  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.752392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4554  melibiose:sodium symporter  23.64 
 
 		 476 aa  79  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4228  inner membrane symporter YihP  23.99 
 
 		 460 aa  79  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2052  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  23.19 
 
 		 471 aa  79  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4262  sugar transporter family protein  25.31 
 
 		 461 aa  78.2  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3872  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  24.08 
 
 		 469 aa  78.2  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4014  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.61 
 
 		 466 aa  78.2  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.85917  normal  0.255078 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5322  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter family protein  22.81 
 
 		 467 aa  78.2  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.357419 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4400  sugar transporter family protein  25.68 
 
 		 468 aa  77.8  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03991  melibiose:sodium symporter  24.08 
 
 		 469 aa  77.4  0.0000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0776  Zinc finger-domain-containing protein  23.86 
 
 		 447 aa  77.4  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0781581 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13771  GPH family sugar transporter  34.19 
 
 		 472 aa  77.4  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.66133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4586  melibiose:sodium symporter  23.73 
 
 		 481 aa  77.4  0.0000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03952  hypothetical protein  24.08 
 
 		 469 aa  77.4  0.0000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2095  GPH family sugar transporter  34.19 
 
 		 442 aa  77  0.0000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4361  melibiose:sodium symporter  24.08 
 
 		 473 aa  77.4  0.0000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3907  melibiose:sodium symporter  24.08 
 
 		 473 aa  77.4  0.0000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4674  melibiose:sodium symporter  24.08 
 
 		 473 aa  77.4  0.0000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1702  Na+/melibiose symporter and related transporter protein  24.56 
 
 		 445 aa  77  0.0000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.574642  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>