296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0353 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0353  major facilitator transporter  100 
 
 
464 aa  925    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.939472  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1387  major facilitator superfamily transport protein  36.8 
 
 
468 aa  264  2e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0294045  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0726  major facilitator transporter  35.81 
 
 
468 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1619  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  34.07 
 
 
436 aa  230  5e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1702  Na+/melibiose symporter and related transporter protein  32.74 
 
 
445 aa  213  4.9999999999999996e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.574642  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3120  major facilitator transporter  29.18 
 
 
472 aa  201  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.448872  normal  0.243798 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1070  major facilitator transporter  31.59 
 
 
471 aa  196  6e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3583  galactoside symporter  29.21 
 
 
475 aa  194  3e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.012026 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2105  sodium:galactoside symporter family protein  26.29 
 
 
443 aa  190  5e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.366774  normal  0.477059 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0269  major facilitator transporter  28.57 
 
 
506 aa  187  5e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41542  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2335  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  28.85 
 
 
476 aa  179  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2613  sodium:galactoside symporter family protein  28.67 
 
 
453 aa  177  4e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.777957  normal  0.0752663 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3858  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  28.57 
 
 
469 aa  173  5.999999999999999e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.784369  normal  0.0678057 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0575  major facilitator transporter  28.54 
 
 
461 aa  170  6e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1406  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  29.34 
 
 
471 aa  168  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.455319  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0571  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  31.6 
 
 
457 aa  164  4.0000000000000004e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.74034  normal  0.0218606 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0290  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  27.56 
 
 
472 aa  163  5.0000000000000005e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000222424  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2906  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  28.16 
 
 
460 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2611  major facilitator transporter  26.88 
 
 
480 aa  162  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.803344  normal  0.0185611 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3190  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  27.92 
 
 
460 aa  159  9e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.712372 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3387  major facilitator superfamily MFS_1  27.84 
 
 
475 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0724765 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1893  major facilitator superfamily MFS_1  31.86 
 
 
440 aa  158  2e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2393  major facilitator superfamily transporter  31.88 
 
 
439 aa  156  6e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1453  major facilitator superfamily transporter  33.57 
 
 
452 aa  154  4e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.722152  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2966  major facilitator superfamily transporter  32.37 
 
 
439 aa  151  3e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.274258 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0494  major facilitator transporter  30.11 
 
 
407 aa  142  9e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.520669 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1146  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  27.8 
 
 
442 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6100  sodium:galactoside symporter family protein  30.27 
 
 
431 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0503744  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2315  hypothetical protein  27.35 
 
 
511 aa  140  7e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.276879  normal  0.0219591 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1315  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  28.86 
 
 
442 aa  140  7e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0232  sodium:galactoside symporter family protein  33.1 
 
 
435 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.626751 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2614  major facilitator transporter  27.93 
 
 
463 aa  134  3.9999999999999996e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.106443  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3732  sugar:cation symporter family protein  29.37 
 
 
443 aa  134  5e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.170381  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2608  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  29.08 
 
 
442 aa  133  6.999999999999999e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02748  cation symporter  28.35 
 
 
462 aa  133  9e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1586  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  29.56 
 
 
453 aa  131  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1401  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  27.51 
 
 
444 aa  131  3e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.738999  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0466  sodium:galactoside symporter family protein  31.21 
 
 
428 aa  131  3e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5882  sodium:galactoside symporter family protein  31.38 
 
 
445 aa  130  4.0000000000000003e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1215  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  28.31 
 
 
441 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.525269  normal  0.0570071 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3697  sugar:cation symporter family protein  28.71 
 
 
467 aa  129  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.455392  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3175  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  27.87 
 
 
442 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0664881  normal  0.904255 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1130  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  28.09 
 
 
441 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3708  sugar:cation symporter family protein  30.17 
 
 
442 aa  127  3e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3314  glucuronide transporter  28.05 
 
 
457 aa  126  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01585  glucuronide transporter  27.97 
 
 
457 aa  126  8.000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01575  hypothetical protein  27.97 
 
 
457 aa  126  8.000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.845658  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1824  glucuronide transporter  27.74 
 
 
457 aa  125  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2719  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  28.41 
 
 
443 aa  125  2e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0761738  normal  0.0687051 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2327  glucuronide transporter  27.74 
 
 
457 aa  124  3e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1182  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  27.7 
 
 
441 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.020658  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1691  glucuronide transporter  27.74 
 
 
457 aa  124  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2049  Na+/melibiose symporter and related transporters-like protein  30.88 
 
 
469 aa  124  4e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal  0.648168 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2992  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.48 
 
 
472 aa  124  5e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1583  glucuronide transporter  27.51 
 
 
457 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1057  putative symporter protein  29.37 
 
 
514 aa  122  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.872646  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3996  major facilitator transporter  29.59 
 
 
443 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.14105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2026  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  27.51 
 
 
457 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.232812  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4405  glucuronide carrier protein  27.08 
 
 
473 aa  120  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.196167  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0248  major facilitator transporter  25.51 
 
 
486 aa  120  6e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.135747  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3738  hypothetical protein  26.8 
 
 
467 aa  119  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00183877  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4227  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  26.61 
 
 
473 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1395  hypothetical protein  26.79 
 
 
443 aa  118  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00525698 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4248  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  27.45 
 
 
472 aa  116  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2697  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  29.7 
 
 
465 aa  116  7.999999999999999e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.296513 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4293  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  27.45 
 
 
472 aa  116  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0966548  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03761  predicted transporter  28.05 
 
 
467 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03710  hypothetical protein  28.05 
 
 
467 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4261  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter family protein  28.02 
 
 
467 aa  116  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1919  major facilitator transporter  27.13 
 
 
461 aa  115  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4339  putative permease  27.5 
 
 
474 aa  116  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0733  sodium:glactoside symporter family protein  24.18 
 
 
465 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.958172  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5322  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter family protein  27.78 
 
 
467 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.357419 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4406  inner membrane symporter YihP  27.85 
 
 
460 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0907861  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3957  putative transporter  25.27 
 
 
460 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4110  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  28.02 
 
 
467 aa  114  3e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4076  putative transporter  25.27 
 
 
460 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.591118  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4228  inner membrane symporter YihP  27.85 
 
 
460 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3967  putative transporter  25.27 
 
 
460 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.286007  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4030  putative transporter  25.27 
 
 
460 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4400  sugar transporter family protein  27.69 
 
 
468 aa  114  3e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4399  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter family protein  27.83 
 
 
467 aa  114  5e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2993  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.16 
 
 
475 aa  112  9e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.624539  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03762  predicted transporter  27.69 
 
 
468 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4109  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  27.69 
 
 
461 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4262  sugar transporter family protein  27.46 
 
 
461 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4014  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  27.25 
 
 
466 aa  112  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.85917  normal  0.255078 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2155  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  27.21 
 
 
471 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00011339  normal  0.022313 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03711  hypothetical protein  27.69 
 
 
468 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4645  melibiose:sodium symporter  25.16 
 
 
476 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4563  melibiose:sodium symporter  25.16 
 
 
476 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4554  melibiose:sodium symporter  25.16 
 
 
476 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5323  sugar transporter family protein  27.63 
 
 
461 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.333242 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4694  melibiose:sodium symporter  25.16 
 
 
476 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.772252  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4221  major facilitator transporter  26.73 
 
 
472 aa  112  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.218171  normal  0.657626 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4340  inner membrane symporter YihP  26.08 
 
 
460 aa  111  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4294  inner membrane symporter YihP  26.08 
 
 
460 aa  111  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.357729  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4645  melibiose:sodium symporter  25.16 
 
 
476 aa  111  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.752392  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4249  inner membrane symporter YihP  26.08 
 
 
460 aa  111  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0679  major facilitator transporter  24.33 
 
 
439 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000876885  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>