246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_3872 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_5634  melibiose:sodium symporter  99.36 
 
 		 481 aa  942    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03991  melibiose:sodium symporter  99.79 
 
 		 469 aa  944    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3872  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  100 
 
 		 469 aa  946    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4645  melibiose:sodium symporter  84.96 
 
 		 476 aa  820    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4674  melibiose:sodium symporter  99.79 
 
 		 473 aa  944    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4554  melibiose:sodium symporter  84.96 
 
 		 476 aa  820    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4586  melibiose:sodium symporter  99.79 
 
 		 481 aa  944    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4563  melibiose:sodium symporter  84.96 
 
 		 476 aa  820    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3907  melibiose:sodium symporter  99.79 
 
 		 473 aa  944    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4694  melibiose:sodium symporter  84.96 
 
 		 476 aa  820    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.772252  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03952  hypothetical protein  99.79 
 
 		 469 aa  944    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4645  melibiose:sodium symporter  84.75 
 
 		 476 aa  821    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.752392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4361  melibiose:sodium symporter  99.79 
 
 		 473 aa  944    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0071  melibiose:sodium symporter  41.97 
 
 		 448 aa  364  1e-99  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00245996  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1935  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  31.05 
 
 		 461 aa  229  7e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1454  sugar transporter  31.82 
 
 		 454 aa  220  3.9999999999999997e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3708  sugar:cation symporter family protein  30.58 
 
 		 442 aa  187  2e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4000  putative transporter  28.23 
 
 		 460 aa  183  6e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.947516  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0048  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  28.02 
 
 		 460 aa  182  1e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4161  putative transporter  28.02 
 
 		 479 aa  182  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4108  putative transporter  28.02 
 
 		 479 aa  182  1e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0054  putative transporter  28.02 
 
 		 460 aa  182  1e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.320086 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3868  putative transporter  28.02 
 
 		 479 aa  182  1e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5030  putative transporter  28.02 
 
 		 460 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03515  predicted transporter  27.8 
 
 		 460 aa  177  4e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.371706  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03467  hypothetical protein  27.8 
 
 		 460 aa  177  4e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.333065  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1315  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  28.95 
 
 		 442 aa  176  7e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4014  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  29.65 
 
 		 466 aa  176  8e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.85917  normal  0.255078 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4954  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  28.33 
 
 		 463 aa  176  8e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0843133  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3175  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  29.56 
 
 		 442 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0664881  normal  0.904255 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0764  sugar glycoside-pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  27.8 
 
 		 454 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00819234  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1401  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  27.17 
 
 		 444 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.738999  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0456  putative symporter YagG  28.72 
 
 		 459 aa  176  9.999999999999999e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0319555 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1215  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  29.33 
 
 		 441 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.525269  normal  0.0570071 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4076  putative transporter  27.37 
 
 		 460 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.591118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4030  putative transporter  27.37 
 
 		 460 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3967  putative transporter  27.37 
 
 		 460 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.286007  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1130  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  28.89 
 
 		 441 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1182  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  29.11 
 
 		 441 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.020658  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0748  sodium:glactoside symporter family protein  27.8 
 
 		 454 aa  173  5.999999999999999e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.329176  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3335  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  28.23 
 
 		 460 aa  172  1e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736057  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3957  putative transporter  27.74 
 
 		 460 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0657  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  29.2 
 
 		 465 aa  171  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.242235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002666  galactose permease  30.82 
 
 		 462 aa  171  3e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1395  hypothetical protein  26.98 
 
 		 443 aa  171  4e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00525698 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0070  putative transporter  28.08 
 
 		 464 aa  170  6e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.602143  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3732  sugar:cation symporter family protein  28.92 
 
 		 443 aa  168  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.170381  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1614  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  31.88 
 
 		 448 aa  168  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0329184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2608  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  28.95 
 
 		 442 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0195  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  31.31 
 
 		 474 aa  167  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0477575 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0709  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  31.31 
 
 		 474 aa  167  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0781  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  30.73 
 
 		 474 aa  167  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0733  sodium:glactoside symporter family protein  27.85 
 
 		 465 aa  166  6.9999999999999995e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.958172  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1146  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  28.54 
 
 		 442 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2992  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.77 
 
 		 472 aa  162  1e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1406  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  25.05 
 
 		 471 aa  162  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.455319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1193  Na+/xyloside symporter or related transporter  29.86 
 
 		 437 aa  160  3e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.255847  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3350  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  28.18 
 
 		 477 aa  157  3e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0167  Na+/galactoside symporter  26.86 
 
 		 468 aa  156  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.774115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0163  Na+/galactoside symporter  26.91 
 
 		 468 aa  156  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0701  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  27.87 
 
 		 478 aa  156  9e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.657348  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0170  Na+/galactoside symporter  26.86 
 
 		 468 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.671323  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1144  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  28.47 
 
 		 468 aa  155  1e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0162  Na+/galactoside symporter  26.86 
 
 		 468 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2284  putative cation symporter  25.49 
 
 		 461 aa  155  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974122 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5398  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  27.61 
 
 		 471 aa  154  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.243683  normal  0.179969 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0020  xylose-proton symporter  25.95 
 
 		 457 aa  155  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000106497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0936  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  27.08 
 
 		 478 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0162  Na+/galactoside symporter  26.64 
 
 		 468 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4248  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  24.72 
 
 		 472 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4339  putative permease  24.72 
 
 		 474 aa  152  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4293  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  24.72 
 
 		 472 aa  152  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0966548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4524  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  28.12 
 
 		 465 aa  150  5e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3697  sugar:cation symporter family protein  28.19 
 
 		 467 aa  149  9e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.455392  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4261  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter family protein  25.85 
 
 		 467 aa  149  9e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03761  predicted transporter  25.8 
 
 		 467 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5322  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter family protein  26.35 
 
 		 467 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.357419 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1367  Na+/xyloside symporter or related transporter  25.59 
 
 		 634 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.316422  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03710  hypothetical protein  25.8 
 
 		 467 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0046  xylose-proton symporter  26.92 
 
 		 471 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00152296  normal  0.141953 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0047  xylose-proton symporter  26.92 
 
 		 471 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000245314  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0047  xylose-proton symporter  26.92 
 
 		 457 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000774004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3985  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  25.31 
 
 		 476 aa  147  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.439786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0046  xylose-proton symporter  26.92 
 
 		 457 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00338984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3908  sugar glycoside-pentoside-hexuronide family protein  29.85 
 
 		 466 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.845629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4399  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter family protein  26.35 
 
 		 467 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4110  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  26.13 
 
 		 467 aa  147  5e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2052  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.43 
 
 		 471 aa  147  5e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3314  glucuronide transporter  26.65 
 
 		 457 aa  146  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1994  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.05 
 
 		 481 aa  145  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00859833  hitchhiker  0.00113965 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4405  glucuronide carrier protein  27.21 
 
 		 473 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.196167  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03437  putative permease  29.2 
 
 		 466 aa  145  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03388  hypothetical protein  29.2 
 
 		 466 aa  145  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1314  Na+/xyloside symporter related transporter  24.89 
 
 		 470 aa  145  2e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.313105  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4951  sugar transporter, glycoside-pentoside-hexuronide family  29.85 
 
 		 466 aa  145  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.841107 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2081  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.46 
 
 		 481 aa  144  3e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0834729  hitchhiker  0.000000228967 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2993  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.17 
 
 		 475 aa  144  3e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.624539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02748  cation symporter  27.39 
 
 		 462 aa  144  4e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0305  Na+/xyloside symporter or related transporter  26.58 
 
 		 479 aa  144  4e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0574168  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4227  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  27.19 
 
 		 473 aa  143  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>