234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_0709 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_0781  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  99.79 
 
 		 474 aa  968    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002666  galactose permease  72.3 
 
 		 462 aa  685    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0709  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  100 
 
 		 474 aa  971    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0195  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  100 
 
 		 474 aa  971    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0477575 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1395  hypothetical protein  31.72 
 
 		 443 aa  193  5e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00525698 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4954  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  28.23 
 
 		 463 aa  191  2.9999999999999997e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0843133  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3708  sugar:cation symporter family protein  29.33 
 
 		 442 aa  189  1e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3175  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  32.29 
 
 		 442 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0664881  normal  0.904255 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1215  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  32.29 
 
 		 441 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.525269  normal  0.0570071 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1315  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  32.13 
 
 		 442 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1130  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  32.07 
 
 		 441 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1182  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  32.07 
 
 		 441 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.020658  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0764  sugar glycoside-pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  28.92 
 
 		 454 aa  183  7e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00819234  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0748  sodium:glactoside symporter family protein  28.89 
 
 		 454 aa  181  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.329176  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0657  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  29.39 
 
 		 465 aa  181  2.9999999999999997e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.242235  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3732  sugar:cation symporter family protein  29.59 
 
 		 443 aa  177  3e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.170381  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4645  melibiose:sodium symporter  30.92 
 
 		 476 aa  176  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.752392  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3697  sugar:cation symporter family protein  26.34 
 
 		 467 aa  175  9.999999999999999e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.455392  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4563  melibiose:sodium symporter  30.92 
 
 		 476 aa  176  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4694  melibiose:sodium symporter  30.92 
 
 		 476 aa  176  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.772252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4645  melibiose:sodium symporter  30.92 
 
 		 476 aa  176  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4554  melibiose:sodium symporter  30.92 
 
 		 476 aa  176  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4227  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  30.07 
 
 		 473 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2284  putative cation symporter  28.35 
 
 		 461 aa  174  2.9999999999999996e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974122 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4405  glucuronide carrier protein  29.85 
 
 		 473 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.196167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1614  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  28.63 
 
 		 448 aa  172  1e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0329184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2608  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  31.7 
 
 		 442 aa  171  2e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3907  melibiose:sodium symporter  31.87 
 
 		 473 aa  171  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4674  melibiose:sodium symporter  31.87 
 
 		 473 aa  171  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4361  melibiose:sodium symporter  31.87 
 
 		 473 aa  171  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4586  melibiose:sodium symporter  31.3 
 
 		 481 aa  171  3e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5634  melibiose:sodium symporter  31.3 
 
 		 481 aa  169  8e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03991  melibiose:sodium symporter  30.96 
 
 		 469 aa  169  8e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4014  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  30.35 
 
 		 466 aa  169  8e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.85917  normal  0.255078 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03952  hypothetical protein  30.96 
 
 		 469 aa  169  8e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3872  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  31.31 
 
 		 469 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1146  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  31.1 
 
 		 442 aa  166  9e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1401  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  29.77 
 
 		 444 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.738999  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0162  Na+/galactoside symporter  28.15 
 
 		 468 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5398  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  27.63 
 
 		 471 aa  164  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.243683  normal  0.179969 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0162  Na+/galactoside symporter  27.92 
 
 		 468 aa  164  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0170  Na+/galactoside symporter  27.92 
 
 		 468 aa  164  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.671323  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0163  Na+/galactoside symporter  27.92 
 
 		 468 aa  164  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03515  predicted transporter  28.22 
 
 		 460 aa  163  6e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.371706  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03467  hypothetical protein  28.22 
 
 		 460 aa  163  6e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.333065  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0167  Na+/galactoside symporter  27.92 
 
 		 468 aa  163  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.774115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4108  putative transporter  27.62 
 
 		 479 aa  163  8.000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3868  putative transporter  27.67 
 
 		 479 aa  162  9e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4161  putative transporter  27.67 
 
 		 479 aa  162  9e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4261  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter family protein  28.83 
 
 		 467 aa  160  4e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4110  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  28.6 
 
 		 467 aa  160  5e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4000  putative transporter  28 
 
 		 460 aa  160  5e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.947516  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0048  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  28.16 
 
 		 460 aa  160  6e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0054  putative transporter  28.16 
 
 		 460 aa  160  6e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.320086 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5322  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter family protein  28.29 
 
 		 467 aa  160  7e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.357419 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03761  predicted transporter  29.09 
 
 		 467 aa  159  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03710  hypothetical protein  29.09 
 
 		 467 aa  159  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4248  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  28.19 
 
 		 472 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4399  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter family protein  28.07 
 
 		 467 aa  157  3e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4339  putative permease  27.96 
 
 		 474 aa  156  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4293  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  27.96 
 
 		 472 aa  156  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0966548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1583  glucuronide transporter  29.8 
 
 		 457 aa  156  7e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3985  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  26.94 
 
 		 476 aa  156  7e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.439786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4406  inner membrane symporter YihP  28.69 
 
 		 460 aa  156  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0907861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2992  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  27.41 
 
 		 472 aa  156  9e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5323  sugar transporter family protein  28.48 
 
 		 461 aa  155  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.333242 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4228  inner membrane symporter YihP  28.69 
 
 		 460 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4109  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  28.92 
 
 		 461 aa  155  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2155  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  26.88 
 
 		 471 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00011339  normal  0.022313 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0070  putative transporter  28.77 
 
 		 464 aa  155  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.602143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3957  putative transporter  27.75 
 
 		 460 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4262  sugar transporter family protein  28.92 
 
 		 461 aa  155  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4400  sugar transporter family protein  28.92 
 
 		 468 aa  155  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3967  putative transporter  28.06 
 
 		 460 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.286007  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4076  putative transporter  28.06 
 
 		 460 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.591118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4030  putative transporter  28.06 
 
 		 460 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5030  putative transporter  27.72 
 
 		 460 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03762  predicted transporter  28.7 
 
 		 468 aa  153  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03711  hypothetical protein  28.7 
 
 		 468 aa  153  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1994  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.26 
 
 		 481 aa  153  7e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00859833  hitchhiker  0.00113965 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2081  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.56 
 
 		 481 aa  152  1e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0834729  hitchhiker  0.000000228967 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3314  glucuronide transporter  29.12 
 
 		 457 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0789  glucuronide transporter  28.98 
 
 		 469 aa  152  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1824  glucuronide transporter  29.35 
 
 		 457 aa  152  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01585  glucuronide transporter  29.35 
 
 		 457 aa  152  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1981  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.56 
 
 		 481 aa  151  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00156524  hitchhiker  0.000367008 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2327  glucuronide transporter  29.35 
 
 		 457 aa  152  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01575  hypothetical protein  29.35 
 
 		 457 aa  152  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.845658  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0456  putative symporter YagG  27.07 
 
 		 459 aa  151  3e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0319555 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2026  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  29.28 
 
 		 457 aa  150  7e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.232812  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4249  inner membrane symporter YihP  27.13 
 
 		 460 aa  149  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4294  inner membrane symporter YihP  27.13 
 
 		 460 aa  149  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.357729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1691  glucuronide transporter  29.12 
 
 		 457 aa  150  7e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4340  inner membrane symporter YihP  27.13 
 
 		 460 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2052  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.16 
 
 		 471 aa  148  3e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1269  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  27.68 
 
 		 465 aa  147  4.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.727469  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3335  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  27.88 
 
 		 460 aa  146  6e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736057  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0071  melibiose:sodium symporter  27.27 
 
 		 448 aa  145  1e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00245996  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0776  Zinc finger-domain-containing protein  25.9 
 
 		 447 aa  145  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0781581 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0733  sodium:glactoside symporter family protein  29.83 
 
 		 465 aa  145  2e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.958172  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>