247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_3907 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03991  melibiose:sodium symporter  100 
 
 		 469 aa  946    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3872  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  99.79 
 
 		 469 aa  944    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5634  melibiose:sodium symporter  99.58 
 
 		 481 aa  952    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4645  melibiose:sodium symporter  85.29 
 
 		 476 aa  830    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4645  melibiose:sodium symporter  85.08 
 
 		 476 aa  830    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.752392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4674  melibiose:sodium symporter  100 
 
 		 473 aa  954    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4563  melibiose:sodium symporter  85.29 
 
 		 476 aa  830    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4554  melibiose:sodium symporter  85.29 
 
 		 476 aa  830    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4361  melibiose:sodium symporter  100 
 
 		 473 aa  954    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03952  hypothetical protein  100 
 
 		 469 aa  946    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4586  melibiose:sodium symporter  100 
 
 		 481 aa  954    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4694  melibiose:sodium symporter  85.29 
 
 		 476 aa  830    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.772252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3907  melibiose:sodium symporter  100 
 
 		 473 aa  954    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0071  melibiose:sodium symporter  41.86 
 
 		 448 aa  366  1e-100  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00245996  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1935  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  31.05 
 
 		 461 aa  231  2e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1454  sugar transporter  31.82 
 
 		 454 aa  220  5e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3708  sugar:cation symporter family protein  30.91 
 
 		 442 aa  192  8e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4108  putative transporter  28.51 
 
 		 479 aa  187  4e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4000  putative transporter  28.36 
 
 		 460 aa  186  5e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.947516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4161  putative transporter  28.51 
 
 		 479 aa  186  6e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3868  putative transporter  28.51 
 
 		 479 aa  186  6e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0048  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  28.14 
 
 		 460 aa  186  8e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0054  putative transporter  28.14 
 
 		 460 aa  186  8e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.320086 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5030  putative transporter  28.51 
 
 		 460 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03515  predicted transporter  27.93 
 
 		 460 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.371706  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3175  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  29.89 
 
 		 442 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0664881  normal  0.904255 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1215  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  29.67 
 
 		 441 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.525269  normal  0.0570071 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03467  hypothetical protein  27.93 
 
 		 460 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.333065  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4954  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  28.57 
 
 		 463 aa  181  4e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0843133  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1130  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  29.45 
 
 		 441 aa  179  8e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1182  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  29.45 
 
 		 441 aa  179  9e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.020658  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4076  putative transporter  27.51 
 
 		 460 aa  179  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.591118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3967  putative transporter  27.51 
 
 		 460 aa  179  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.286007  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1401  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  27.31 
 
 		 444 aa  179  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.738999  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4030  putative transporter  27.51 
 
 		 460 aa  179  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1315  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  29.07 
 
 		 442 aa  178  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4014  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  29.68 
 
 		 466 aa  178  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.85917  normal  0.255078 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0764  sugar glycoside-pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  27.91 
 
 		 454 aa  177  3e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00819234  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0456  putative symporter YagG  28.69 
 
 		 459 aa  177  3e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0319555 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3957  putative transporter  27.87 
 
 		 460 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0748  sodium:glactoside symporter family protein  27.91 
 
 		 454 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.329176  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1395  hypothetical protein  27.13 
 
 		 443 aa  175  1.9999999999999998e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00525698 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0070  putative transporter  28.21 
 
 		 464 aa  174  3.9999999999999995e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.602143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002666  galactose permease  31.05 
 
 		 462 aa  173  5.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3335  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  28.05 
 
 		 460 aa  172  1e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736057  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0657  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  29.04 
 
 		 465 aa  172  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.242235  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3732  sugar:cation symporter family protein  28.82 
 
 		 443 aa  171  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.170381  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0195  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  31.87 
 
 		 474 aa  171  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0477575 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0709  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  31.87 
 
 		 474 aa  171  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0781  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  31.87 
 
 		 474 aa  171  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1146  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  28.67 
 
 		 442 aa  170  5e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1614  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  31.9 
 
 		 448 aa  170  5e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0329184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2608  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  29.07 
 
 		 442 aa  169  7e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0733  sodium:glactoside symporter family protein  27.67 
 
 		 465 aa  167  4e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.958172  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2992  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.98 
 
 		 472 aa  164  4.0000000000000004e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1406  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  25.16 
 
 		 471 aa  163  7e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.455319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1193  Na+/xyloside symporter or related transporter  30.09 
 
 		 437 aa  162  9e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.255847  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1144  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  28.54 
 
 		 468 aa  159  1e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3350  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  28.03 
 
 		 477 aa  159  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0701  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  27.73 
 
 		 478 aa  158  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.657348  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0020  xylose-proton symporter  25.83 
 
 		 457 aa  157  3e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000106497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0167  Na+/galactoside symporter  26.78 
 
 		 468 aa  157  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.774115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0936  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  26.95 
 
 		 478 aa  157  4e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0162  Na+/galactoside symporter  26.84 
 
 		 468 aa  157  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0163  Na+/galactoside symporter  26.84 
 
 		 468 aa  157  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4248  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  24.94 
 
 		 472 aa  157  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4293  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  24.94 
 
 		 472 aa  157  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0966548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0170  Na+/galactoside symporter  26.78 
 
 		 468 aa  157  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.671323  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4339  putative permease  24.94 
 
 		 474 aa  157  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5398  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  27.7 
 
 		 471 aa  155  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.243683  normal  0.179969 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2284  putative cation symporter  25.16 
 
 		 461 aa  155  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974122 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0162  Na+/galactoside symporter  26.57 
 
 		 468 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5322  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter family protein  26.34 
 
 		 467 aa  153  7e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.357419 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4261  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter family protein  25.84 
 
 		 467 aa  152  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03761  predicted transporter  25.63 
 
 		 467 aa  152  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3697  sugar:cation symporter family protein  28.04 
 
 		 467 aa  152  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.455392  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0046  xylose-proton symporter  27.01 
 
 		 471 aa  152  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00152296  normal  0.141953 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0047  xylose-proton symporter  27.01 
 
 		 471 aa  152  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000245314  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0046  xylose-proton symporter  27.01 
 
 		 457 aa  152  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00338984  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03710  hypothetical protein  25.63 
 
 		 467 aa  152  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0047  xylose-proton symporter  27.01 
 
 		 457 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000774004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4399  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter family protein  26.34 
 
 		 467 aa  150  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1367  Na+/xyloside symporter or related transporter  25.53 
 
 		 634 aa  150  4e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.316422  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4110  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  26.12 
 
 		 467 aa  150  5e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4405  glucuronide carrier protein  27.42 
 
 		 473 aa  150  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.196167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3908  sugar glycoside-pentoside-hexuronide family protein  29.68 
 
 		 466 aa  149  8e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.845629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2052  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.32 
 
 		 471 aa  149  8e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1314  Na+/xyloside symporter related transporter  25.1 
 
 		 470 aa  149  1.0000000000000001e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.313105  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4524  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  28.12 
 
 		 465 aa  149  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1994  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.95 
 
 		 481 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00859833  hitchhiker  0.00113965 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3314  glucuronide transporter  26.87 
 
 		 457 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4227  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  27.39 
 
 		 473 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03437  putative permease  29.68 
 
 		 466 aa  147  3e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3985  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  25.15 
 
 		 476 aa  147  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.439786  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03388  hypothetical protein  29.68 
 
 		 466 aa  147  3e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4951  sugar transporter, glycoside-pentoside-hexuronide family  29.68 
 
 		 466 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.841107 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2081  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.36 
 
 		 481 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0834729  hitchhiker  0.000000228967 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2993  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.27 
 
 		 475 aa  147  5e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.624539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0305  Na+/xyloside symporter or related transporter  26.16 
 
 		 479 aa  146  8.000000000000001e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0574168  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4249  inner membrane symporter YihP  26.48 
 
 		 460 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>