249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0936 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0936  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  100 
 
 		 478 aa  971    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0701  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  97.49 
 
 		 478 aa  954    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.657348  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3350  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  84.94 
 
 		 477 aa  845    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0657  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  45.36 
 
 		 465 aa  427  1e-118  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.242235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4014  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  45.92 
 
 		 466 aa  427  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.85917  normal  0.255078 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0167  Na+/galactoside symporter  44.06 
 
 		 468 aa  408  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.774115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0170  Na+/galactoside symporter  44.06 
 
 		 468 aa  408  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.671323  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0162  Na+/galactoside symporter  44.06 
 
 		 468 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0163  Na+/galactoside symporter  44.06 
 
 		 468 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0162  Na+/galactoside symporter  43.63 
 
 		 468 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4161  putative transporter  43.97 
 
 		 479 aa  389  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4000  putative transporter  43.97 
 
 		 460 aa  389  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.947516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3868  putative transporter  43.97 
 
 		 479 aa  389  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0048  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  43.97 
 
 		 460 aa  388  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3732  sugar:cation symporter family protein  42.86 
 
 		 443 aa  385  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.170381  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0054  putative transporter  43.97 
 
 		 460 aa  388  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.320086 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03515  predicted transporter  43.75 
 
 		 460 aa  383  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.371706  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03467  hypothetical protein  43.75 
 
 		 460 aa  383  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.333065  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3957  putative transporter  44.11 
 
 		 460 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5030  putative transporter  43.75 
 
 		 460 aa  384  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4108  putative transporter  43.75 
 
 		 479 aa  385  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0070  putative transporter  44.3 
 
 		 464 aa  383  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.602143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4076  putative transporter  44.11 
 
 		 460 aa  381  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.591118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3967  putative transporter  44.11 
 
 		 460 aa  381  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.286007  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4030  putative transporter  44.11 
 
 		 460 aa  381  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1315  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  42.67 
 
 		 442 aa  377  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1395  hypothetical protein  42.7 
 
 		 443 aa  371  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00525698 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2608  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  42.67 
 
 		 442 aa  365  1e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3708  sugar:cation symporter family protein  39.78 
 
 		 442 aa  364  2e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3175  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  42.27 
 
 		 442 aa  364  2e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0664881  normal  0.904255 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0456  putative symporter YagG  39.78 
 
 		 459 aa  364  2e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0319555 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1130  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  42.54 
 
 		 441 aa  363  3e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1215  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  42.76 
 
 		 441 aa  363  4e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.525269  normal  0.0570071 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3335  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  39.48 
 
 		 460 aa  361  2e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736057  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1182  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  42.32 
 
 		 441 aa  359  6e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.020658  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4394  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  41.24 
 
 		 444 aa  345  8e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0181186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4463  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  41.24 
 
 		 444 aa  345  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4282  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  41.24 
 
 		 444 aa  344  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.368763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4396  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  41.02 
 
 		 444 aa  345  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4311  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  41.02 
 
 		 444 aa  344  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1146  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  41.11 
 
 		 442 aa  342  5.999999999999999e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2505  putative symporter YagG  37.22 
 
 		 442 aa  336  7e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1401  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  40.89 
 
 		 444 aa  331  2e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.738999  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1994  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  36.57 
 
 		 481 aa  325  1e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00859833  hitchhiker  0.00113965 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1981  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  36.57 
 
 		 481 aa  325  1e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00156524  hitchhiker  0.000367008 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2081  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  36.51 
 
 		 481 aa  322  7e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0834729  hitchhiker  0.000000228967 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2155  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  35.96 
 
 		 471 aa  313  4.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00011339  normal  0.022313 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2052  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  35.84 
 
 		 471 aa  310  4e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4954  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  35.33 
 
 		 463 aa  304  2.0000000000000002e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0843133  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3697  sugar:cation symporter family protein  35.23 
 
 		 467 aa  299  6e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.455392  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1391  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  36.87 
 
 		 461 aa  295  1e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1614  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  35.67 
 
 		 448 aa  286  8e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0329184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4524  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  37.77 
 
 		 465 aa  284  3.0000000000000004e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1997  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  34.87 
 
 		 477 aa  284  3.0000000000000004e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2284  putative cation symporter  35.28 
 
 		 461 aa  283  5.000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974122 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2992  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  36.31 
 
 		 472 aa  279  7e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3908  sugar glycoside-pentoside-hexuronide family protein  36.68 
 
 		 466 aa  279  1e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.845629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0776  Zinc finger-domain-containing protein  35.35 
 
 		 447 aa  278  2e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0781581 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03437  putative permease  36.68 
 
 		 466 aa  276  5e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03388  hypothetical protein  36.68 
 
 		 466 aa  276  5e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2993  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  33.69 
 
 		 475 aa  276  8e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.624539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1269  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  35.04 
 
 		 465 aa  276  8e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.727469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3985  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  34.84 
 
 		 476 aa  272  8.000000000000001e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.439786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4951  sugar transporter, glycoside-pentoside-hexuronide family  36.24 
 
 		 466 aa  271  2e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.841107 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03868  transport protein  33 
 
 		 514 aa  270  5e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02748  cation symporter  36.78 
 
 		 462 aa  264  2e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3869  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  32.72 
 
 		 486 aa  263  4.999999999999999e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5398  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  33.33 
 
 		 471 aa  256  9e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.243683  normal  0.179969 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4313  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  33.61 
 
 		 497 aa  247  4e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0453293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0907  Na+/melibiose symporter and related transporters-like  35.96 
 
 		 538 aa  227  4e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000225717  decreased coverage  0.000000181101 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1026  ribosomal protein L9  32.88 
 
 		 522 aa  227  4e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.814155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3275  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  30.99 
 
 		 513 aa  224  2e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3707  sugar:cation symporter family protein  30.1 
 
 		 511 aa  220  6e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2372  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  31.6 
 
 		 457 aa  216  9e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.100315  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1144  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  30.09 
 
 		 468 aa  207  3e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2498  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  30.85 
 
 		 480 aa  194  2e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.358109  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0733  sodium:glactoside symporter family protein  28.6 
 
 		 465 aa  191  4e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.958172  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1193  Na+/xyloside symporter or related transporter  28.38 
 
 		 437 aa  189  7e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.255847  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3565  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  28.1 
 
 		 447 aa  174  1.9999999999999998e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.117988  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2602  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  29.7 
 
 		 475 aa  174  3.9999999999999995e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.178809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0764  sugar glycoside-pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  25.94 
 
 		 454 aa  173  5e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00819234  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0748  sodium:glactoside symporter family protein  25.94 
 
 		 454 aa  173  5e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.329176  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0020  xylose-proton symporter  25.76 
 
 		 457 aa  164  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000106497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1592  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  29.47 
 
 		 464 aa  160  4e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00442608  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0789  glucuronide transporter  29.18 
 
 		 469 aa  160  5e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1245  Na+/xyloside symporter related transporter  27.33 
 
 		 467 aa  160  6e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3907  melibiose:sodium symporter  26.95 
 
 		 473 aa  157  4e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4361  melibiose:sodium symporter  26.95 
 
 		 473 aa  157  4e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4674  melibiose:sodium symporter  26.95 
 
 		 473 aa  157  4e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1406  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  26.98 
 
 		 471 aa  157  5.0000000000000005e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.455319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4586  melibiose:sodium symporter  26.95 
 
 		 481 aa  157  6e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03991  melibiose:sodium symporter  27.08 
 
 		 469 aa  155  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5634  melibiose:sodium symporter  26.65 
 
 		 481 aa  155  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03952  hypothetical protein  27.08 
 
 		 469 aa  155  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3872  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  27.08 
 
 		 469 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1824  glucuronide transporter  28.91 
 
 		 457 aa  152  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1691  glucuronide transporter  28.81 
 
 		 457 aa  150  4e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01585  glucuronide transporter  28.6 
 
 		 457 aa  150  5e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01575  hypothetical protein  28.6 
 
 		 457 aa  150  5e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.845658  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3314  glucuronide transporter  26.72 
 
 		 457 aa  150  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>