224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1454 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE1454  sugar transporter  100 
 
 
454 aa  910    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1935  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  69.82 
 
 
461 aa  649    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1367  Na+/xyloside symporter or related transporter  34.61 
 
 
634 aa  266  8e-70  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.316422  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0305  Na+/xyloside symporter or related transporter  33.19 
 
 
479 aa  253  4.0000000000000004e-66  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0574168  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1314  Na+/xyloside symporter related transporter  30.6 
 
 
470 aa  238  1e-61  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.313105  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0880  Na+/xyloside symporter related transporter  31.17 
 
 
640 aa  231  2e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0363049  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0071  melibiose:sodium symporter  30.96 
 
 
448 aa  229  8e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00245996  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2246  Na+/xyloside symporter related transporter  31.67 
 
 
462 aa  224  2e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1065  Na+/lactose symporter related transporter  30.57 
 
 
639 aa  224  2e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5634  melibiose:sodium symporter  31.82 
 
 
481 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03991  melibiose:sodium symporter  31.82 
 
 
469 aa  220  3e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03952  hypothetical protein  31.82 
 
 
469 aa  220  3e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3872  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  31.82 
 
 
469 aa  220  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4586  melibiose:sodium symporter  31.82 
 
 
481 aa  220  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3907  melibiose:sodium symporter  31.82 
 
 
473 aa  220  5e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4361  melibiose:sodium symporter  31.82 
 
 
473 aa  220  5e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4674  melibiose:sodium symporter  31.82 
 
 
473 aa  220  5e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4645  melibiose:sodium symporter  31.43 
 
 
476 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.752392  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4554  melibiose:sodium symporter  31.43 
 
 
476 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4645  melibiose:sodium symporter  31.43 
 
 
476 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4563  melibiose:sodium symporter  31.43 
 
 
476 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4694  melibiose:sodium symporter  31.43 
 
 
476 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.772252  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1086  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  30.66 
 
 
640 aa  215  1.9999999999999998e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1768  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  30.87 
 
 
650 aa  212  1e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000025521  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0728  Na+/xyloside symporter  28.81 
 
 
495 aa  205  1e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0449813  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0764  sugar glycoside-pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  29.28 
 
 
454 aa  183  7e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00819234  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0748  sodium:glactoside symporter family protein  29.28 
 
 
454 aa  183  7e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.329176  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002666  galactose permease  27.04 
 
 
462 aa  153  5e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0733  sodium:glactoside symporter family protein  27.72 
 
 
465 aa  151  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.958172  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3708  sugar:cation symporter family protein  26.86 
 
 
442 aa  144  3e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3732  sugar:cation symporter family protein  25.99 
 
 
443 aa  143  7e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.170381  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1395  hypothetical protein  28.17 
 
 
443 aa  142  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00525698 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03761  predicted transporter  23.26 
 
 
467 aa  138  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03710  hypothetical protein  23.26 
 
 
467 aa  138  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5322  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter family protein  22.63 
 
 
467 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.357419 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4110  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  23.18 
 
 
467 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4399  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter family protein  23.18 
 
 
467 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1315  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.54 
 
 
442 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4261  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter family protein  22.64 
 
 
467 aa  132  9e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0195  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.85 
 
 
474 aa  132  1.0000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0477575 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0709  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.85 
 
 
474 aa  132  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0781  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.85 
 
 
474 aa  132  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2993  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.14 
 
 
475 aa  129  7.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.624539  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4262  sugar transporter family protein  23.97 
 
 
461 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0789  glucuronide transporter  25.49 
 
 
469 aa  128  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4339  putative permease  23.08 
 
 
474 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4228  inner membrane symporter YihP  24.78 
 
 
460 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4954  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.92 
 
 
463 aa  128  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0843133  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4400  sugar transporter family protein  23.97 
 
 
468 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4406  inner membrane symporter YihP  24.57 
 
 
460 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0907861  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4293  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  23.08 
 
 
472 aa  128  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0966548  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4248  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  23.08 
 
 
472 aa  128  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4109  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  23.75 
 
 
461 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5323  sugar transporter family protein  23.75 
 
 
461 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.333242 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2992  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.36 
 
 
472 aa  127  6e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03762  predicted transporter  23.53 
 
 
468 aa  125  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3957  putative transporter  24.4 
 
 
460 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0162  Na+/galactoside symporter  26.11 
 
 
468 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03711  hypothetical protein  23.53 
 
 
468 aa  125  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4030  putative transporter  24.73 
 
 
460 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3967  putative transporter  24.73 
 
 
460 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.286007  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4076  putative transporter  24.73 
 
 
460 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.591118  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0167  Na+/galactoside symporter  26.11 
 
 
468 aa  124  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.774115  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0170  Na+/galactoside symporter  26.11 
 
 
468 aa  124  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.671323  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0163  Na+/galactoside symporter  26.11 
 
 
468 aa  124  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0162  Na+/galactoside symporter  26.11 
 
 
468 aa  124  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4405  glucuronide carrier protein  23.01 
 
 
473 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.196167  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1146  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  28.37 
 
 
442 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4227  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  22.64 
 
 
473 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1401  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.29 
 
 
444 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.738999  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0657  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.78 
 
 
465 aa  122  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.242235  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1614  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.05 
 
 
448 aa  122  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0329184  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3175  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  25.27 
 
 
442 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0664881  normal  0.904255 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1130  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.44 
 
 
441 aa  121  3e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4014  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.61 
 
 
466 aa  120  3.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.85917  normal  0.255078 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0070  putative transporter  23.35 
 
 
464 aa  120  6e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.602143  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0456  putative symporter YagG  26.65 
 
 
459 aa  120  6e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0319555 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1215  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.44 
 
 
441 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.525269  normal  0.0570071 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2284  putative cation symporter  24.56 
 
 
461 aa  119  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974122 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2327  glucuronide transporter  22.47 
 
 
457 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1583  glucuronide transporter  21.85 
 
 
457 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0048  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  22.52 
 
 
460 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0054  putative transporter  22.52 
 
 
460 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.320086 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4000  putative transporter  22.52 
 
 
460 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.947516  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4108  putative transporter  22.52 
 
 
479 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3868  putative transporter  22.52 
 
 
479 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4161  putative transporter  22.52 
 
 
479 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4294  inner membrane symporter YihP  22.41 
 
 
460 aa  118  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.357729  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4249  inner membrane symporter YihP  22.41 
 
 
460 aa  118  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4340  inner membrane symporter YihP  22.41 
 
 
460 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1824  glucuronide transporter  22.25 
 
 
457 aa  118  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01585  glucuronide transporter  22.25 
 
 
457 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2608  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.83 
 
 
442 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01575  hypothetical protein  22.25 
 
 
457 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.845658  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03515  predicted transporter  22.52 
 
 
460 aa  117  5e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.371706  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03467  hypothetical protein  22.52 
 
 
460 aa  117  5e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.333065  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3314  glucuronide transporter  22.02 
 
 
457 aa  117  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2026  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  22.03 
 
 
457 aa  116  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.232812  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1691  glucuronide transporter  22.03 
 
 
457 aa  116  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03388  hypothetical protein  26.89 
 
 
466 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>