More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1086 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_1086  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  100 
 
 
640 aa  1301    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1065  Na+/lactose symporter related transporter  58.81 
 
 
639 aa  790    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0728  Na+/xyloside symporter  52.43 
 
 
495 aa  509  1e-143  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0449813  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1314  Na+/xyloside symporter related transporter  47.44 
 
 
470 aa  451  1e-125  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.313105  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0880  Na+/xyloside symporter related transporter  39.87 
 
 
640 aa  426  1e-118  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0363049  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0305  Na+/xyloside symporter or related transporter  42.98 
 
 
479 aa  417  9.999999999999999e-116  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0574168  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1367  Na+/xyloside symporter or related transporter  37.83 
 
 
634 aa  403  1e-111  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.316422  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1768  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  38.14 
 
 
650 aa  375  1e-102  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000025521  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2246  Na+/xyloside symporter related transporter  42.92 
 
 
462 aa  366  1e-100  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1454  sugar transporter  30.66 
 
 
454 aa  227  5.0000000000000005e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1935  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  27.54 
 
 
461 aa  212  1e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0071  melibiose:sodium symporter  27.25 
 
 
448 aa  130  9.000000000000001e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00245996  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4645  melibiose:sodium symporter  23.73 
 
 
476 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.752392  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4554  melibiose:sodium symporter  23.52 
 
 
476 aa  121  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4563  melibiose:sodium symporter  23.52 
 
 
476 aa  121  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4645  melibiose:sodium symporter  23.52 
 
 
476 aa  121  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4694  melibiose:sodium symporter  23.52 
 
 
476 aa  121  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.772252  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1245  Na+/xyloside symporter related transporter  24.58 
 
 
467 aa  121  4.9999999999999996e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4586  melibiose:sodium symporter  22.39 
 
 
481 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03991  melibiose:sodium symporter  22.44 
 
 
469 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4674  melibiose:sodium symporter  22.39 
 
 
473 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03952  hypothetical protein  22.44 
 
 
469 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3872  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  22.44 
 
 
469 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4361  melibiose:sodium symporter  22.39 
 
 
473 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3907  melibiose:sodium symporter  22.39 
 
 
473 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5634  melibiose:sodium symporter  22.29 
 
 
481 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1710  sucrose PTS, EIIBCA  34.3 
 
 
633 aa  118  3.9999999999999997e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.433436  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0456  putative symporter YagG  26.92 
 
 
459 aa  116  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0319555 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1778  sucrose PTS, EIIBCA  33.49 
 
 
647 aa  115  3e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000018652  hitchhiker  0.000000000675608 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0174  PTS system, glucose-specific IIBC subunit  37.18 
 
 
681 aa  114  8.000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0179  PTS system, glucose-specific IIBC subunit  37.18 
 
 
681 aa  114  8.000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2105  PTS system, glucose subfamily, IIA subunit  33.51 
 
 
724 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.684712  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3335  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  24.66 
 
 
460 aa  111  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736057  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0764  sugar glycoside-pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  23.92 
 
 
454 aa  108  4e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00819234  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0748  sodium:glactoside symporter family protein  23.78 
 
 
454 aa  108  4e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.329176  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1690  PTS system, IIABC components  32.84 
 
 
639 aa  106  1e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.151541  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002666  galactose permease  24.19 
 
 
462 aa  105  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0790  PTS system, beta-glucosides-specific IIABC components  41.38 
 
 
622 aa  102  1e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.933117  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0758  PTS system, beta-glucoside-specific IIABC subunit  34.46 
 
 
653 aa  102  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.573965  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1704  PTS system beta-glucoside-specific transporter subunits IIABC  35 
 
 
636 aa  103  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.13733  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1353  PTS system, beta-glucoside-specific IIABC subunit  33.14 
 
 
613 aa  103  1e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2498  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  24.5 
 
 
480 aa  103  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.358109  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3841  PTS system, glucose subfamily, IIA subunit  43.66 
 
 
165 aa  102  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000588614  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1459  PTS system, glucose-specific IIBC subunit  39.69 
 
 
658 aa  102  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0104386  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0709  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.21 
 
 
474 aa  101  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0398  sucrose PTS, EIIBCA  37.24 
 
 
654 aa  102  3e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000327344  hitchhiker  0.00000162153 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0195  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.21 
 
 
474 aa  101  3e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0477575 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0781  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.21 
 
 
474 aa  101  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5411  putative PTS system, glucose-specific IIA component  43.66 
 
 
165 aa  101  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.85272e-63 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5445  PTS system, glucose-specific IIA component, putative  43.66 
 
 
165 aa  101  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000302993  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5169  PTS system glucose-specific transporter subunit IIA  43.66 
 
 
165 aa  101  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000010415  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5498  putative PTS system, glucose-specific IIA component  43.66 
 
 
165 aa  101  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000128176  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5019  protein-N(pi)-phosphohistidine-sugar phosphotransferase, PTS system, IIA component  43.66 
 
 
165 aa  101  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000303487  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5563  PTS system glucose-specific transporter subunit IIA  43.66 
 
 
165 aa  101  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000151282  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5509  putative PTS system, glucose-specific IIA component  43.66 
 
 
165 aa  101  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000212559  unclonable  3.6700900000000004e-26 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5003  protein-N(pi)-phosphohistidine-sugar phosphotransferase, PTS system, IIA component  43.66 
 
 
165 aa  100  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  8.0907700000000005e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0288  sucrose PTS, EIIBCA  42.34 
 
 
653 aa  100  6e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0534348  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5118  PTS system, glucose subfamily, IIA subunit  43.66 
 
 
165 aa  100  7e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000126325  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0542  PTS system, beta-glucoside-specific IIABC subunit  34.64 
 
 
642 aa  100  7e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5442  putative PTS system, glucose-specific IIA component  42.96 
 
 
165 aa  99  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000107285  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1785  PTS system, glucose-specific IIBC subunit  36.99 
 
 
672 aa  99.8  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4261  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter family protein  23.39 
 
 
467 aa  98.6  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2190  PTS system glucose-specific transporter subunit  45.37 
 
 
169 aa  98.6  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00862742 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3509  PTS system, glucose subfamily, IIA subunit  37.09 
 
 
164 aa  98.2  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0912  PTS system, glucose-specific IIBC subunit  40.15 
 
 
675 aa  97.8  5e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0301112  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0239  phosphotransferase system IIA component  36.23 
 
 
164 aa  97.1  9e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2439  PTS system beta-glucoside-specific transporter subunits IIABC  32.39 
 
 
633 aa  97.1  9e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0118762  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0773  PTS system glucose-specific transporter subunit  45.87 
 
 
169 aa  96.7  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000282146  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5322  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter family protein  23.15 
 
 
467 aa  97.1  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.357419 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1010  PTS system glucose-specific transporter subunit  45.87 
 
 
169 aa  97.1  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.293491  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1077  PTS system, glucose subfamily, IIA subunit  39.53 
 
 
187 aa  97.1  1e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03761  predicted transporter  23.15 
 
 
467 aa  95.9  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4400  sugar transporter family protein  24.61 
 
 
468 aa  96.3  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4109  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  24.61 
 
 
461 aa  96.3  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4110  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  23.81 
 
 
467 aa  95.5  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5323  sugar transporter family protein  24.61 
 
 
461 aa  95.9  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.333242 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03710  hypothetical protein  23.15 
 
 
467 aa  95.9  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4399  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter family protein  23.81 
 
 
467 aa  95.9  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4262  sugar transporter family protein  24.61 
 
 
461 aa  95.5  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4954  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  22.58 
 
 
463 aa  95.5  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0843133  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1667  PTS system beta-glucoside-specific transporter subunits IIABC  35.34 
 
 
636 aa  95.5  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0376301  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3378  PTS system, glucose subfamily, IIA subunit  43.24 
 
 
167 aa  95.5  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.477381  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0218  PTS system, glucose subfamily, IIA subunit  39.22 
 
 
178 aa  95.1  4e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0904  PTS system, glucose subfamily, IIA subunit  41.94 
 
 
176 aa  94.7  4e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.292557 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2740  PTS system beta-glucoside-specific transporter subunits IIABC  34.04 
 
 
619 aa  94.7  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2120  PTS system glucose-specific transporter subunit  44.95 
 
 
169 aa  94.7  4e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.354798  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03762  predicted transporter  24.35 
 
 
468 aa  94.4  5e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03711  hypothetical protein  24.35 
 
 
468 aa  94.4  5e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3697  sugar:cation symporter family protein  22.27 
 
 
467 aa  94.7  5e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.455392  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0877  PTS system, beta-glucoside-specific enzyme II, ABC component  31.33 
 
 
630 aa  94.7  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0324408  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0859  PTS system, beta-glucoside-specific enzyme II, ABC component  31.33 
 
 
630 aa  94.7  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1768  PTS system, glucose subfamily, IIA subunit  33.55 
 
 
751 aa  94.4  5e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2114  PTS system, IIABC components  31.11 
 
 
675 aa  94.4  7e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000024561  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3271  PTS system glucose-specific transporter subunit  44.04 
 
 
169 aa  94  7e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0096084  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3193  PTS system glucose-specific transporter subunit  40.91 
 
 
169 aa  94  8e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.840589  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3450  PTS system glucose-specific transporter subunit  44.04 
 
 
169 aa  93.6  9e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000505878 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2750  PTS system glucose-specific transporter subunit  35.98 
 
 
169 aa  93.6  9e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000941748  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1315  PTS system glucose-specific transporter subunit  35.98 
 
 
169 aa  93.6  9e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  3.2052800000000003e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1426  PTS system glucose-specific transporter subunit  35.98 
 
 
169 aa  93.6  9e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000530963  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2236  PTS system glucose-specific transporter subunit  44.95 
 
 
169 aa  93.2  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>