More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1768 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_1768  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  100 
 
 
650 aa  1304    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000025521  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0880  Na+/xyloside symporter related transporter  59.94 
 
 
640 aa  752    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0363049  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1367  Na+/xyloside symporter or related transporter  57.01 
 
 
634 aa  743    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.316422  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0305  Na+/xyloside symporter or related transporter  44.87 
 
 
479 aa  432  1e-119  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0574168  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1086  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  38.24 
 
 
640 aa  424  1e-117  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1065  Na+/lactose symporter related transporter  37.14 
 
 
639 aa  425  1e-117  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1314  Na+/xyloside symporter related transporter  47.61 
 
 
470 aa  417  9.999999999999999e-116  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.313105  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2246  Na+/xyloside symporter related transporter  42.67 
 
 
462 aa  350  4e-95  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0728  Na+/xyloside symporter  40.17 
 
 
495 aa  348  2e-94  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0449813  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1454  sugar transporter  30.87 
 
 
454 aa  248  4e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1935  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  30.19 
 
 
461 aa  246  8e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0071  melibiose:sodium symporter  29.03 
 
 
448 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00245996  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4694  melibiose:sodium symporter  24.9 
 
 
476 aa  160  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.772252  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4563  melibiose:sodium symporter  24.9 
 
 
476 aa  160  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4554  melibiose:sodium symporter  24.9 
 
 
476 aa  160  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4645  melibiose:sodium symporter  24.9 
 
 
476 aa  160  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4645  melibiose:sodium symporter  24.69 
 
 
476 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.752392  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03991  melibiose:sodium symporter  22.94 
 
 
469 aa  151  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03952  hypothetical protein  22.94 
 
 
469 aa  151  3e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4586  melibiose:sodium symporter  22.94 
 
 
481 aa  152  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3907  melibiose:sodium symporter  22.94 
 
 
473 aa  151  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4361  melibiose:sodium symporter  22.94 
 
 
473 aa  151  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4674  melibiose:sodium symporter  22.94 
 
 
473 aa  151  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5634  melibiose:sodium symporter  22.94 
 
 
481 aa  151  5e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3872  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  22.94 
 
 
469 aa  150  7e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2439  PTS system beta-glucoside-specific transporter subunits IIABC  41.83 
 
 
633 aa  143  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0118762  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1755  beta-glucosides PTS, EIIBCA  45.99 
 
 
624 aa  139  2e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000638137  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2105  PTS system, glucose subfamily, IIA subunit  45.68 
 
 
724 aa  134  3.9999999999999996e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.684712  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1710  sucrose PTS, EIIBCA  52.38 
 
 
633 aa  131  3e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.433436  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0748  sodium:glactoside symporter family protein  25.63 
 
 
454 aa  130  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.329176  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2742  PTS system beta-glucoside-specific transporter subunits IIABC  45.95 
 
 
633 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.234192  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0901  trehalose PTS trehalose component IIBC  46.97 
 
 
612 aa  128  3e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0764  sugar glycoside-pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  25.42 
 
 
454 aa  127  5e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00819234  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1690  PTS system, IIABC components  38.32 
 
 
639 aa  127  6e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.151541  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0288  sucrose PTS, EIIBCA  43.33 
 
 
653 aa  127  7e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0534348  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4231  PTS system beta-glucoside-specific transporter subunits IIABC  48.92 
 
 
625 aa  124  4e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03606  fused beta-glucoside-specific PTS enzymes: IIA component/IIB component/IIC component  48.2 
 
 
625 aa  124  7e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03550  hypothetical protein  48.2 
 
 
625 aa  124  7e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4245  PTS system, beta-glucoside-specific IIABC subunit  48.2 
 
 
625 aa  123  9e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3936  PTS system beta-glucoside-specific transporter subunits IIABC  48.2 
 
 
625 aa  123  9e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.64171  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4272  PTS system beta-glucoside-specific transporter subunits IIABC  48.2 
 
 
625 aa  123  9e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0877  PTS system, beta-glucoside-specific enzyme II, ABC component  42.95 
 
 
630 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0324408  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002666  galactose permease  27.17 
 
 
462 aa  123  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0784  PTS system, beta-glucoside-specific IIABC subunit  44.97 
 
 
636 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.063374  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1242  sucrose-specific PTS system IIBC component  40.97 
 
 
645 aa  120  6e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.91372  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0859  PTS system, beta-glucoside-specific enzyme II, ABC component  41.61 
 
 
630 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1667  PTS system beta-glucoside-specific transporter subunits IIABC  43.92 
 
 
636 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0376301  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1892  PTS system, beta-glucoside-specific IIABC subunit  35.8 
 
 
627 aa  119  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000024125  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2740  PTS system beta-glucoside-specific transporter subunits IIABC  47.29 
 
 
619 aa  118  3.9999999999999997e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0781  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.57 
 
 
474 aa  117  6e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1704  PTS system beta-glucoside-specific transporter subunits IIABC  48.78 
 
 
636 aa  117  6.9999999999999995e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.13733  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0709  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.57 
 
 
474 aa  117  6.9999999999999995e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0195  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.57 
 
 
474 aa  117  6.9999999999999995e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0477575 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1778  sucrose PTS, EIIBCA  44 
 
 
647 aa  117  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000018652  hitchhiker  0.000000000675608 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1669  trehalose PTS trehalose component IIBC  42.26 
 
 
672 aa  115  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3482  PTS system, beta-glucoside-specific IIABC subunit  41.1 
 
 
644 aa  115  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0398  sucrose PTS, EIIBCA  44.8 
 
 
654 aa  114  4.0000000000000004e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000327344  hitchhiker  0.00000162153 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4954  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.75 
 
 
463 aa  113  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0843133  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0744  PTS system, beta-glucoside-specific IIABC subunit  31.13 
 
 
634 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0980  PTS system, beta-glucoside-specific IIABC subunit  33.2 
 
 
639 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.668297  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0758  PTS system, beta-glucoside-specific IIABC subunit  41.41 
 
 
653 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.573965  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0904  PTS system, glucose subfamily, IIA subunit  40.69 
 
 
176 aa  112  2.0000000000000002e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.292557 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2561  PTS system, glucose-specific IIBC subunit  37.91 
 
 
688 aa  111  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2323  PTS system, beta-glucoside-specific IIABC subunit  34.35 
 
 
621 aa  112  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2614  PTS system, glucose-specific IIBC subunit  37.91 
 
 
688 aa  111  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0733  sodium:glactoside symporter family protein  25.42 
 
 
465 aa  111  5e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.958172  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1353  PTS system, beta-glucoside-specific IIABC subunit  38.1 
 
 
613 aa  110  9.000000000000001e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2114  PTS system, IIABC components  38.01 
 
 
675 aa  110  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000024561  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0542  PTS system, beta-glucoside-specific IIABC subunit  38.89 
 
 
642 aa  109  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1459  PTS system, glucose-specific IIBC subunit  38.22 
 
 
658 aa  109  2e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0104386  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3509  PTS system, glucose subfamily, IIA subunit  42.52 
 
 
164 aa  108  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0474  PTS system, beta-glucoside-specific IIABC subunit  41.43 
 
 
618 aa  108  4e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000629343  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3964  PTS system, beta-glucoside-specific IIABC subunit  41.27 
 
 
603 aa  108  5e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.168346 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3697  sugar:cation symporter family protein  25.15 
 
 
467 aa  107  6e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.455392  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0174  PTS system, glucose-specific IIBC subunit  37.91 
 
 
681 aa  107  6e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0179  PTS system, glucose-specific IIBC subunit  37.91 
 
 
681 aa  107  6e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0535  beta-glucoside-specific PTS system IIABC component  39.68 
 
 
654 aa  107  6e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000350615  hitchhiker  0.00000000000038873 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1768  PTS system, glucose subfamily, IIA subunit  42.11 
 
 
751 aa  107  6e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1349  PTS system, beta-glucoside-specific IIABC subunit  37.09 
 
 
623 aa  107  6e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.495868  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0192  PTS system, IIABC components  31.82 
 
 
676 aa  105  2e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0747  PTS system, beta-glucoside-specific IIABC subunit  38.36 
 
 
638 aa  106  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0763  PTS system, beta-glucoside-specific IIABC subunit  38.35 
 
 
626 aa  105  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1047  PTS system, beta-glucoside-specific IIABC subunit  36.65 
 
 
627 aa  106  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0332  PTS system, glucose subfamily, IIA subunit  35.76 
 
 
622 aa  106  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0890  PTS system, beta-glucoside-specific IIABC subunit  36.31 
 
 
627 aa  105  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0239  phosphotransferase system IIA component  41.73 
 
 
164 aa  104  6e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1245  Na+/xyloside symporter related transporter  24.6 
 
 
467 aa  103  1e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2750  PTS system glucose-specific transporter subunit  42.86 
 
 
169 aa  102  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000941748  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1315  PTS system glucose-specific transporter subunit  42.86 
 
 
169 aa  102  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  3.2052800000000003e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3271  PTS system glucose-specific transporter subunit  40.94 
 
 
169 aa  102  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0096084  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1426  PTS system glucose-specific transporter subunit  42.86 
 
 
169 aa  102  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000530963  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4313  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  28.83 
 
 
497 aa  102  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0453293  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0256  PTS system, glucose subfamily, IIA subunit  35.63 
 
 
263 aa  101  5e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0077  PTS system, trehalose-specific IIBC subunit  33.53 
 
 
643 aa  101  5e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.569592  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0936  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  24.9 
 
 
478 aa  101  5e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0250  PTS system, glucose subfamily, IIA subunit  35.63 
 
 
263 aa  101  5e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3450  PTS system glucose-specific transporter subunit  45.71 
 
 
169 aa  100  8e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000505878 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0773  PTS system glucose-specific transporter subunit  45.71 
 
 
169 aa  100  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000282146  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2799  PTS system glucose-specific transporter subunit  40 
 
 
169 aa  99.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.19381  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0790  PTS system, beta-glucosides-specific IIABC components  41.01 
 
 
622 aa  100  1e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.933117  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>