More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1242 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_1242  sucrose-specific PTS system IIBC component  100 
 
 
645 aa  1272    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.91372  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1900  PTS system, IIBC components  59.45 
 
 
474 aa  499  1e-140  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0177  phosphotransferase system, EIIC  55.21 
 
 
484 aa  493  9.999999999999999e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0182  phosphotransferase system EIIC  55.21 
 
 
484 aa  493  9.999999999999999e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1540  phosphotransferase system EIIC  50.84 
 
 
479 aa  438  1e-121  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0733  phosphotransferase system EIIC  49.79 
 
 
454 aa  429  1e-119  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0914  PTS system, sucrose-specific IIBC component  50.21 
 
 
454 aa  432  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0121729  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0919  PTS system, sucrose-specific IIBC component  50 
 
 
454 aa  430  1e-119  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6517e-42 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0671  PTS system, sucrose-specific IIBC component  49.79 
 
 
455 aa  430  1e-119  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0988  PTS system, sucrose-specific IIBC component  50.21 
 
 
454 aa  431  1e-119  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.55468  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4458  PTS system, sucrose-specific IIBC component  49.57 
 
 
454 aa  429  1e-118  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.222368  normal  0.618386 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0784  PTS system sucrose-specific transporter subunit IIBC  49.79 
 
 
454 aa  428  1e-118  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0733  PTS system, sucrose-specific IIBC component  49.57 
 
 
454 aa  427  1e-118  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000656707  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0719  PTS system, sucrose-specific IIBC component  49.79 
 
 
454 aa  428  1e-118  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.514005  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0877  PTS system, sucrose-specific IIBC component  49.57 
 
 
454 aa  428  1e-118  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0823  PTS system sucrose-specific transporter subunit IIBC  49.79 
 
 
454 aa  428  1e-118  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262491  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1470  phosphotransferase system EIIC  47.56 
 
 
450 aa  419  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0563215  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2812  phosphotransferase system EIIC  45.73 
 
 
454 aa  394  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2732  phosphotransferase system, eiic  41.86 
 
 
453 aa  328  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2948  PTS system transporter subunit EIIC  41.65 
 
 
453 aa  327  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3482  PTS system, beta-glucoside-specific IIABC subunit  33.98 
 
 
644 aa  327  4.0000000000000003e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3832  phosphotransferase system EIIC  40.59 
 
 
466 aa  327  4.0000000000000003e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2813  phosphotransferase system, eiic  41.86 
 
 
453 aa  327  6e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.526275  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2836  PTS system EIIC component  41.65 
 
 
453 aa  326  8.000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.799285 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2773  PTS system transporter subunit EIIC  41.65 
 
 
453 aa  326  8.000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0859  PTS system, beta-glucoside-specific enzyme II, ABC component  32.61 
 
 
630 aa  324  4e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0784  PTS system, beta-glucoside-specific IIABC subunit  34.91 
 
 
636 aa  320  6e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.063374  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3660  phosphotransferase system EIIC  41.61 
 
 
455 aa  317  3e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0877  PTS system, beta-glucoside-specific enzyme II, ABC component  32.3 
 
 
630 aa  317  4e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0324408  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2439  PTS system beta-glucoside-specific transporter subunits IIABC  32.97 
 
 
633 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0118762  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0971  phosphotransferase system EIIC  39.63 
 
 
468 aa  308  2.0000000000000002e-82  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1067  phosphotransferase system EIIC  42.11 
 
 
446 aa  306  1.0000000000000001e-81  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0170  phosphotransferase system, EIIC  43.37 
 
 
476 aa  302  1e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00257735  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7243  phosphotransferase system PTS, EIIB/EIIC  37.45 
 
 
513 aa  300  6e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.838529  normal  0.924215 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3046  phosphotransferase system, EIIC  40.93 
 
 
453 aa  293  7e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0279286 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1704  PTS system beta-glucoside-specific transporter subunits IIABC  32.76 
 
 
636 aa  291  3e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.13733  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2742  PTS system beta-glucoside-specific transporter subunits IIABC  32.77 
 
 
633 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.234192  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2740  PTS system beta-glucoside-specific transporter subunits IIABC  32.04 
 
 
619 aa  290  5.0000000000000004e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1667  PTS system beta-glucoside-specific transporter subunits IIABC  32.97 
 
 
636 aa  289  1e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0376301  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0288  sucrose PTS, EIIBCA  31.27 
 
 
653 aa  289  1e-76  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0534348  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1710  sucrose PTS, EIIBCA  30.73 
 
 
633 aa  287  5e-76  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.433436  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03606  fused beta-glucoside-specific PTS enzymes: IIA component/IIB component/IIC component  33.13 
 
 
625 aa  286  8e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4231  PTS system beta-glucoside-specific transporter subunits IIABC  33.38 
 
 
625 aa  286  8e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03550  hypothetical protein  33.13 
 
 
625 aa  286  8e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0901  trehalose PTS trehalose component IIBC  34 
 
 
612 aa  285  2.0000000000000002e-75  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0763  PTS system, beta-glucoside-specific IIABC subunit  32.01 
 
 
626 aa  283  7.000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1690  PTS system, IIABC components  31.89 
 
 
639 aa  282  1e-74  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.151541  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4272  PTS system beta-glucoside-specific transporter subunits IIABC  32.58 
 
 
625 aa  281  2e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4245  PTS system, beta-glucoside-specific IIABC subunit  32.58 
 
 
625 aa  281  2e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3936  PTS system beta-glucoside-specific transporter subunits IIABC  32.58 
 
 
625 aa  281  4e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.64171  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1778  sucrose PTS, EIIBCA  30.04 
 
 
647 aa  276  9e-73  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000018652  hitchhiker  0.000000000675608 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1669  trehalose PTS trehalose component IIBC  30.7 
 
 
672 aa  274  4.0000000000000004e-72  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0790  PTS system, beta-glucosides-specific IIABC components  30.12 
 
 
622 aa  271  2e-71  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.933117  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0747  PTS system, beta-glucoside-specific IIABC subunit  30.42 
 
 
638 aa  269  1e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1198  phosphotransferase system EIIC  37.04 
 
 
495 aa  264  3e-69  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.742148  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1755  beta-glucosides PTS, EIIBCA  30.54 
 
 
624 aa  263  6.999999999999999e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000638137  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0398  sucrose PTS, EIIBCA  31.7 
 
 
654 aa  259  8e-68  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000327344  hitchhiker  0.00000162153 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0980  PTS system, beta-glucoside-specific IIABC subunit  31.33 
 
 
639 aa  257  4e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.668297  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2548  PTS system, beta-glucoside-specific IIABC subunit  30.51 
 
 
641 aa  254  5.000000000000001e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.414224  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0077  PTS system, trehalose-specific IIBC subunit  29.94 
 
 
643 aa  253  7e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.569592  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001000  PTS system N-acetylmuramic acid-specific IIBC component  36.74 
 
 
484 aa  253  8.000000000000001e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2323  PTS system, beta-glucoside-specific IIABC subunit  33.03 
 
 
621 aa  249  9e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1892  PTS system, beta-glucoside-specific IIABC subunit  29.92 
 
 
627 aa  249  1e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000024125  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0744  PTS system, beta-glucoside-specific IIABC subunit  31.12 
 
 
634 aa  249  1e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2715  PTS system N-acetylmuramic acid transporter subunits EIIBC  37.27 
 
 
474 aa  248  2e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3659  PTS system N-acetylmuramic acid transporter subunits EIIBC  37.27 
 
 
474 aa  248  2e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02329  N-acetylmuramic acid phosphotransfer permease  37.27 
 
 
474 aa  248  3e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1232  phosphotransferase system EIIC  37.06 
 
 
474 aa  248  3e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2584  PTS system N-acetylmuramic acid transporter subunits EIIBC  37.06 
 
 
474 aa  248  3e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02290  hypothetical protein  37.27 
 
 
474 aa  248  3e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1250  PTS system N-acetylmuramic acid transporter subunits EIIBC  37.06 
 
 
474 aa  248  3e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.290523 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2565  PTS system N-acetylmuramic acid transporter subunits EIIBC  37.06 
 
 
474 aa  248  3e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0474  PTS system, beta-glucoside-specific IIABC subunit  31.95 
 
 
618 aa  246  6.999999999999999e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000629343  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0758  PTS system, beta-glucoside-specific IIABC subunit  31 
 
 
653 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.573965  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0542  PTS system, beta-glucoside-specific IIABC subunit  30.82 
 
 
642 aa  244  3e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2801  PTS system N-acetylmuramic acid transporter subunits EIIBC  36.85 
 
 
474 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0192  PTS system, IIABC components  30.48 
 
 
676 aa  241  2e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2586  PTS system N-acetylmuramic acid transporter subunits EIIBC  35.34 
 
 
482 aa  239  9e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1047  PTS system, beta-glucoside-specific IIABC subunit  29.1 
 
 
627 aa  238  2e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1353  PTS system, beta-glucoside-specific IIABC subunit  28.1 
 
 
613 aa  238  2e-61  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3468  PTS system, beta-glucoside-specific IIABC subunit  31.23 
 
 
615 aa  235  2.0000000000000002e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000541812  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1405  PTS system, beta-glucoside-specific IIABC subunit  30.11 
 
 
625 aa  234  4.0000000000000004e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0890  PTS system, beta-glucoside-specific IIABC subunit  32.38 
 
 
627 aa  231  4e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1349  PTS system, beta-glucoside-specific IIABC subunit  27.98 
 
 
623 aa  205  2e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.495868  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3964  PTS system, beta-glucoside-specific IIABC subunit  26.79 
 
 
603 aa  202  1.9999999999999998e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.168346 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1968  PTS system, sucrose-specific IIBC components  30.87 
 
 
481 aa  201  5e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0000108474  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2403  PTS system, sucrose-specific IIBC subunit  30 
 
 
480 aa  194  3e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000860113  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2449  PTS system, sucrose-specific IIBC subunit  30 
 
 
480 aa  194  3e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000521739  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3507  PTS system, sucrose-specific IIBC subunit  31.7 
 
 
458 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0810  PTS system, sucrose-specific IIBC component  32.33 
 
 
458 aa  189  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0917  PTS system, sucrose-specific IIBC component  32.33 
 
 
458 aa  189  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1620  PTS system, trehalose-specific IIBC subunit  30.98 
 
 
471 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000938635  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0668  PTS system, sucrose-specific IIBC component  31.49 
 
 
458 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00638232  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0718  PTS system sucrose-specific transporter subunit IIBC  31.7 
 
 
458 aa  184  5.0000000000000004e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000127924  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0754  PTS system sucrose-specific transporter subunit IIBC  31.7 
 
 
458 aa  184  5.0000000000000004e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2907  PTS system sucrose-specific EIIBC component ScrA  30.62 
 
 
456 aa  182  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0119328  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3594  PTS system, sucrose-specific IIBC subunit  30.77 
 
 
456 aa  181  4.999999999999999e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2554  PTS system, trehalose-specific IIBC subunit  30.5 
 
 
472 aa  180  9e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0495  PTS system, trehalose-specific IIBC subunit  30.54 
 
 
475 aa  178  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.247391  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0508  PTS system, trehalose-specific IIBC subunit  30.54 
 
 
475 aa  178  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>