More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1470 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2812  phosphotransferase system EIIC  85.02 
 
 
454 aa  754    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1470  phosphotransferase system EIIC  100 
 
 
450 aa  887    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0563215  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0914  PTS system, sucrose-specific IIBC component  77.31 
 
 
454 aa  711    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0121729  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4458  PTS system, sucrose-specific IIBC component  76.87 
 
 
454 aa  710    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.222368  normal  0.618386 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0784  PTS system sucrose-specific transporter subunit IIBC  76.87 
 
 
454 aa  710    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0733  PTS system, sucrose-specific IIBC component  76.65 
 
 
454 aa  709    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000656707  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0919  PTS system, sucrose-specific IIBC component  77.09 
 
 
454 aa  711    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6517e-42 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0671  PTS system, sucrose-specific IIBC component  75.38 
 
 
455 aa  705    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0719  PTS system, sucrose-specific IIBC component  76.87 
 
 
454 aa  710    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.514005  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0823  PTS system sucrose-specific transporter subunit IIBC  76.87 
 
 
454 aa  710    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262491  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0733  phosphotransferase system EIIC  76.43 
 
 
454 aa  710    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0877  PTS system, sucrose-specific IIBC component  76.65 
 
 
454 aa  707    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0988  PTS system, sucrose-specific IIBC component  76.87 
 
 
454 aa  709    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.55468  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0170  phosphotransferase system, EIIC  50.99 
 
 
476 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00257735  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1242  sucrose-specific PTS system IIBC component  47.77 
 
 
645 aa  407  1.0000000000000001e-112  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.91372  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3660  phosphotransferase system EIIC  46.68 
 
 
455 aa  394  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0177  phosphotransferase system, EIIC  45.4 
 
 
484 aa  390  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0182  phosphotransferase system EIIC  45.4 
 
 
484 aa  390  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2813  phosphotransferase system, eiic  45.81 
 
 
453 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.526275  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1900  PTS system, IIBC components  47.56 
 
 
474 aa  383  1e-105  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2836  PTS system EIIC component  45.37 
 
 
453 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.799285 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2948  PTS system transporter subunit EIIC  45.37 
 
 
453 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2732  phosphotransferase system, eiic  45.59 
 
 
453 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2773  PTS system transporter subunit EIIC  45.37 
 
 
453 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3046  phosphotransferase system, EIIC  46.34 
 
 
453 aa  375  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0279286 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1067  phosphotransferase system EIIC  45.82 
 
 
446 aa  359  5e-98  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3832  phosphotransferase system EIIC  43.29 
 
 
466 aa  356  5e-97  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0971  phosphotransferase system EIIC  40.73 
 
 
468 aa  317  2e-85  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1540  phosphotransferase system EIIC  40.3 
 
 
479 aa  314  1.9999999999999998e-84  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1198  phosphotransferase system EIIC  38.52 
 
 
495 aa  310  4e-83  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.742148  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7243  phosphotransferase system PTS, EIIB/EIIC  38.72 
 
 
513 aa  280  3e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.838529  normal  0.924215 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001000  PTS system N-acetylmuramic acid-specific IIBC component  38.46 
 
 
484 aa  275  1.0000000000000001e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2586  PTS system N-acetylmuramic acid transporter subunits EIIBC  39.33 
 
 
482 aa  269  8e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3659  PTS system N-acetylmuramic acid transporter subunits EIIBC  37.08 
 
 
474 aa  263  6e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2584  PTS system N-acetylmuramic acid transporter subunits EIIBC  37.13 
 
 
474 aa  262  8.999999999999999e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2715  PTS system N-acetylmuramic acid transporter subunits EIIBC  36.86 
 
 
474 aa  262  8.999999999999999e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1232  phosphotransferase system EIIC  37.13 
 
 
474 aa  261  1e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2565  PTS system N-acetylmuramic acid transporter subunits EIIBC  37.13 
 
 
474 aa  261  1e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1250  PTS system N-acetylmuramic acid transporter subunits EIIBC  37.13 
 
 
474 aa  261  1e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.290523 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02329  N-acetylmuramic acid phosphotransfer permease  37.13 
 
 
474 aa  261  2e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02290  hypothetical protein  37.13 
 
 
474 aa  261  2e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2801  PTS system N-acetylmuramic acid transporter subunits EIIBC  36.71 
 
 
474 aa  259  7e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3507  PTS system, sucrose-specific IIBC subunit  35.73 
 
 
458 aa  248  1e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0668  PTS system, sucrose-specific IIBC component  34.33 
 
 
458 aa  244  3e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00638232  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0917  PTS system, sucrose-specific IIBC component  34.55 
 
 
458 aa  242  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0718  PTS system sucrose-specific transporter subunit IIBC  34.33 
 
 
458 aa  242  7.999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000127924  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0754  PTS system sucrose-specific transporter subunit IIBC  34.33 
 
 
458 aa  242  7.999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0810  PTS system, sucrose-specific IIBC component  34.33 
 
 
458 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3594  PTS system, sucrose-specific IIBC subunit  33.12 
 
 
456 aa  236  6e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3757  PTS system, sucrose-specific IIBC subunit  33.12 
 
 
456 aa  236  9e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0342215  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2403  PTS system, sucrose-specific IIBC subunit  31.03 
 
 
480 aa  231  2e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000860113  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2449  PTS system, sucrose-specific IIBC subunit  31.03 
 
 
480 aa  231  2e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000521739  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2907  PTS system sucrose-specific EIIBC component ScrA  32.83 
 
 
456 aa  231  3e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0119328  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2021  PTS system, sucrose-specific IIBC subunit  33.26 
 
 
456 aa  229  8e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.139063  normal  0.0932593 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000599  phosphotransferase system sucrose-specific IIBC component  31.21 
 
 
479 aa  224  2e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000683079  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1968  PTS system, sucrose-specific IIBC components  29.96 
 
 
481 aa  221  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0000108474  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0349  PTS system, sucrose-specific IIBC subunit  32.39 
 
 
456 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1513  PTS system, sucrose-specific IIBC component  32.75 
 
 
450 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000189676  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3482  PTS system, beta-glucoside-specific IIABC subunit  29.71 
 
 
644 aa  221  3e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0393  PTS system, sucrose-specific IIBC subunit  32.39 
 
 
457 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0813466  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4205  PTS system, sucrose-specific IIBC subunit  32.39 
 
 
456 aa  219  1e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1785  PTS system, sucrose-specific IIBC component  32.75 
 
 
450 aa  219  1e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000306537  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1620  PTS system, trehalose-specific IIBC subunit  29.92 
 
 
471 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000938635  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2554  PTS system, trehalose-specific IIBC subunit  30.15 
 
 
472 aa  213  5.999999999999999e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0598  PTS system trehalose-specific transporter subunit IIBC  29.87 
 
 
475 aa  211  2e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0356425  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0631  PTS system trehalose-specific transporter subunit IIBC  29.87 
 
 
475 aa  211  2e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0542  protein-N(pi)-phosphohistidine-sugar phosphotransferase (PTS system, trehalose-specific IIBC component)  29.87 
 
 
475 aa  210  4e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0859  PTS system, beta-glucoside-specific enzyme II, ABC component  31.52 
 
 
630 aa  210  4e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0686  PTS system, trehalose-specific IIBC component  29.87 
 
 
475 aa  210  4e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.872474 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0699  PTS system, trehalose-specific IIBC component  29.66 
 
 
475 aa  210  5e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.712537  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0542  protein-N(pi)-phosphohistidine-sugar phosphotransferase (PTS system, trehalose-specific IIBC component)  29.6 
 
 
475 aa  209  8e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.190354  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0667  PTS system, trehalose-specific IIBC component  29.18 
 
 
475 aa  208  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.652435  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4670  PTS system, trehalose-specific IIBC component  28.96 
 
 
475 aa  208  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  5.21575e-21 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0760  PTS system, trehalose-specific IIBC component  29.18 
 
 
475 aa  208  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0597  PTS system, sucrose-specific IIBC component  30.59 
 
 
479 aa  207  2e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000306243  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0747  PTS system, beta-glucoside-specific IIABC subunit  29.1 
 
 
638 aa  204  2e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0763  PTS system, beta-glucoside-specific IIABC subunit  29.52 
 
 
626 aa  203  4e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0972  PTS system, sucrose-specific IIBC subunit  30.9 
 
 
485 aa  203  6e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0102663  normal  0.021269 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2439  PTS system beta-glucoside-specific transporter subunits IIABC  29.68 
 
 
633 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0118762  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1285  PTS system, sucrose-specific (IIBC component) transmembrane protein  30.82 
 
 
465 aa  199  9e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.410172  normal  0.484299 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3657  PTS system, sucrose-specific IIBC subunit  29.31 
 
 
478 aa  196  9e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0544  PTS system, trehalose-specific IIBC subunit  28.12 
 
 
475 aa  196  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0877  PTS system, beta-glucoside-specific enzyme II, ABC component  31.39 
 
 
630 aa  195  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0324408  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3433  PTS system, sucrose-specific IIBC subunit  34.32 
 
 
462 aa  192  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0234327 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1710  sucrose PTS, EIIBCA  29.06 
 
 
633 aa  192  1e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.433436  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2742  PTS system beta-glucoside-specific transporter subunits IIABC  30 
 
 
633 aa  190  4e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.234192  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1690  PTS system, IIABC components  29.66 
 
 
639 aa  189  7e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.151541  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2740  PTS system beta-glucoside-specific transporter subunits IIABC  30.57 
 
 
619 aa  189  7e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0577  PTS system trehalose(maltose)-specific transporter subunits IIBC  28.42 
 
 
474 aa  189  8e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1667  PTS system beta-glucoside-specific transporter subunits IIABC  27.7 
 
 
636 aa  187  4e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0376301  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0508  PTS system, trehalose-specific IIBC subunit  31.99 
 
 
475 aa  187  4e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0495  PTS system, trehalose-specific IIBC subunit  31.99 
 
 
475 aa  187  4e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.247391  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0432  PTS system trehalose(maltose)-specific transporter subunits IIBC  29.3 
 
 
478 aa  186  9e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00257211  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0784  PTS system, beta-glucoside-specific IIABC subunit  29.77 
 
 
636 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.063374  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1778  sucrose PTS, EIIBCA  28.3 
 
 
647 aa  182  9.000000000000001e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000018652  hitchhiker  0.000000000675608 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01205  PTS system trehalose(maltose)-specific transporter subunits IIBC  28.7 
 
 
468 aa  182  1e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4074  phosphotransferase system EIIC  27.55 
 
 
470 aa  182  1e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1704  PTS system beta-glucoside-specific transporter subunits IIABC  28.4 
 
 
636 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.13733  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004235  phosphotransferase system trehalose-specific IIBC component  28.41 
 
 
474 aa  181  2.9999999999999997e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.712328  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1507  PTS system trehalose(maltose)-specific transporter subunits IIBC  28.73 
 
 
472 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.44731  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>