More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A2773 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011149  SeAg_B2732  phosphotransferase system, eiic  99.78 
 
 
453 aa  884    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2836  PTS system EIIC component  100 
 
 
453 aa  885    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.799285 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2773  PTS system transporter subunit EIIC  100 
 
 
453 aa  885    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2948  PTS system transporter subunit EIIC  99.56 
 
 
453 aa  883    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2813  phosphotransferase system, eiic  99.34 
 
 
453 aa  881    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.526275  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3660  phosphotransferase system EIIC  78.9 
 
 
455 aa  716    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3046  phosphotransferase system, EIIC  87.42 
 
 
453 aa  749    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0279286 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1470  phosphotransferase system EIIC  45.37 
 
 
450 aa  379  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0563215  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1067  phosphotransferase system EIIC  49.55 
 
 
446 aa  381  1e-104  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0671  PTS system, sucrose-specific IIBC component  44.96 
 
 
455 aa  376  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2812  phosphotransferase system EIIC  47.25 
 
 
454 aa  377  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0170  phosphotransferase system, EIIC  47.9 
 
 
476 aa  378  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00257735  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4458  PTS system, sucrose-specific IIBC component  45.08 
 
 
454 aa  372  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.222368  normal  0.618386 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0877  PTS system, sucrose-specific IIBC component  45.08 
 
 
454 aa  371  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0919  PTS system, sucrose-specific IIBC component  44.86 
 
 
454 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6517e-42 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0784  PTS system sucrose-specific transporter subunit IIBC  44.64 
 
 
454 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0733  PTS system, sucrose-specific IIBC component  44.64 
 
 
454 aa  369  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000656707  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0719  PTS system, sucrose-specific IIBC component  44.86 
 
 
454 aa  370  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.514005  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0823  PTS system sucrose-specific transporter subunit IIBC  44.64 
 
 
454 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262491  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0988  PTS system, sucrose-specific IIBC component  44.64 
 
 
454 aa  369  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.55468  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0914  PTS system, sucrose-specific IIBC component  44.64 
 
 
454 aa  368  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0121729  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0733  phosphotransferase system EIIC  44.64 
 
 
454 aa  368  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1242  sucrose-specific PTS system IIBC component  41.65 
 
 
645 aa  309  8e-83  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.91372  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3832  phosphotransferase system EIIC  39.61 
 
 
466 aa  300  5e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1900  PTS system, IIBC components  38.11 
 
 
474 aa  286  4e-76  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0177  phosphotransferase system, EIIC  36.23 
 
 
484 aa  280  4e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0182  phosphotransferase system EIIC  36.23 
 
 
484 aa  280  4e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1198  phosphotransferase system EIIC  38.46 
 
 
495 aa  279  6e-74  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.742148  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001000  PTS system N-acetylmuramic acid-specific IIBC component  36.72 
 
 
484 aa  267  2.9999999999999995e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0971  phosphotransferase system EIIC  37.93 
 
 
468 aa  261  3e-68  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3659  PTS system N-acetylmuramic acid transporter subunits EIIBC  38.85 
 
 
474 aa  258  2e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2715  PTS system N-acetylmuramic acid transporter subunits EIIBC  38.61 
 
 
474 aa  257  2e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02329  N-acetylmuramic acid phosphotransfer permease  38.61 
 
 
474 aa  257  4e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1232  phosphotransferase system EIIC  38.4 
 
 
474 aa  257  4e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02290  hypothetical protein  38.61 
 
 
474 aa  257  4e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2584  PTS system N-acetylmuramic acid transporter subunits EIIBC  38.27 
 
 
474 aa  256  4e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1250  PTS system N-acetylmuramic acid transporter subunits EIIBC  38.4 
 
 
474 aa  257  4e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.290523 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2565  PTS system N-acetylmuramic acid transporter subunits EIIBC  38.4 
 
 
474 aa  257  4e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2801  PTS system N-acetylmuramic acid transporter subunits EIIBC  37.97 
 
 
474 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1540  phosphotransferase system EIIC  38.43 
 
 
479 aa  254  3e-66  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7243  phosphotransferase system PTS, EIIB/EIIC  35.7 
 
 
513 aa  252  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.838529  normal  0.924215 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2586  PTS system N-acetylmuramic acid transporter subunits EIIBC  36.42 
 
 
482 aa  252  1e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0917  PTS system, sucrose-specific IIBC component  36.66 
 
 
458 aa  234  3e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0810  PTS system, sucrose-specific IIBC component  36.44 
 
 
458 aa  233  5e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0718  PTS system sucrose-specific transporter subunit IIBC  36.23 
 
 
458 aa  228  2e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000127924  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0668  PTS system, sucrose-specific IIBC component  36.09 
 
 
458 aa  228  2e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00638232  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0754  PTS system sucrose-specific transporter subunit IIBC  36.23 
 
 
458 aa  228  2e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1968  PTS system, sucrose-specific IIBC components  32.9 
 
 
481 aa  224  2e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0000108474  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3507  PTS system, sucrose-specific IIBC subunit  34.62 
 
 
458 aa  220  5e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2403  PTS system, sucrose-specific IIBC subunit  32.56 
 
 
480 aa  218  1e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000860113  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2449  PTS system, sucrose-specific IIBC subunit  32.56 
 
 
480 aa  218  1e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000521739  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3594  PTS system, sucrose-specific IIBC subunit  34.05 
 
 
456 aa  212  1e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3757  PTS system, sucrose-specific IIBC subunit  33.41 
 
 
456 aa  209  7e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0342215  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0747  PTS system, beta-glucoside-specific IIABC subunit  30.04 
 
 
638 aa  206  6e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4205  PTS system, sucrose-specific IIBC subunit  34.17 
 
 
456 aa  204  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0393  PTS system, sucrose-specific IIBC subunit  33.98 
 
 
457 aa  202  9.999999999999999e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0813466  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000599  phosphotransferase system sucrose-specific IIBC component  30.36 
 
 
479 aa  202  9.999999999999999e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000683079  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0763  PTS system, beta-glucoside-specific IIABC subunit  29.87 
 
 
626 aa  200  5e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0349  PTS system, sucrose-specific IIBC subunit  34.04 
 
 
456 aa  200  5e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0597  PTS system, sucrose-specific IIBC component  29.62 
 
 
479 aa  200  5e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000306243  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2907  PTS system sucrose-specific EIIBC component ScrA  33.55 
 
 
456 aa  199  6e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0119328  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2021  PTS system, sucrose-specific IIBC subunit  33.26 
 
 
456 aa  198  1.0000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.139063  normal  0.0932593 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1620  PTS system, trehalose-specific IIBC subunit  32.26 
 
 
471 aa  196  1e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000938635  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0972  PTS system, sucrose-specific IIBC subunit  30.85 
 
 
485 aa  192  1e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0102663  normal  0.021269 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2740  PTS system beta-glucoside-specific transporter subunits IIABC  28.97 
 
 
619 aa  189  8e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0598  PTS system trehalose-specific transporter subunit IIBC  29.34 
 
 
475 aa  186  8e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0356425  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0631  PTS system trehalose-specific transporter subunit IIBC  29.34 
 
 
475 aa  186  8e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0667  PTS system, trehalose-specific IIBC component  29.34 
 
 
475 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.652435  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0699  PTS system, trehalose-specific IIBC component  29.12 
 
 
475 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.712537  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0542  protein-N(pi)-phosphohistidine-sugar phosphotransferase (PTS system, trehalose-specific IIBC component)  29.12 
 
 
475 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0760  PTS system, trehalose-specific IIBC component  29.34 
 
 
475 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0542  protein-N(pi)-phosphohistidine-sugar phosphotransferase (PTS system, trehalose-specific IIBC component)  29.34 
 
 
475 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.190354  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0859  PTS system, beta-glucoside-specific enzyme II, ABC component  27.42 
 
 
630 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0686  PTS system, trehalose-specific IIBC component  29.12 
 
 
475 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.872474 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2554  PTS system, trehalose-specific IIBC subunit  31.05 
 
 
472 aa  184  3e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4670  PTS system, trehalose-specific IIBC component  28.91 
 
 
475 aa  184  3e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  5.21575e-21 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3657  PTS system, sucrose-specific IIBC subunit  28.94 
 
 
478 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1285  PTS system, sucrose-specific (IIBC component) transmembrane protein  32.57 
 
 
465 aa  183  5.0000000000000004e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.410172  normal  0.484299 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1778  sucrose PTS, EIIBCA  30.2 
 
 
647 aa  182  1e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000018652  hitchhiker  0.000000000675608 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1667  PTS system beta-glucoside-specific transporter subunits IIABC  28.24 
 
 
636 aa  180  4.999999999999999e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0376301  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2323  PTS system, beta-glucoside-specific IIABC subunit  28.91 
 
 
621 aa  179  9e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1704  PTS system beta-glucoside-specific transporter subunits IIABC  28.07 
 
 
636 aa  178  2e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.13733  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1755  beta-glucosides PTS, EIIBCA  28.82 
 
 
624 aa  177  3e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000638137  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3433  PTS system, sucrose-specific IIBC subunit  34.17 
 
 
462 aa  177  5e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0234327 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1690  PTS system, IIABC components  28.75 
 
 
639 aa  174  2.9999999999999996e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.151541  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0877  PTS system, beta-glucoside-specific enzyme II, ABC component  27.65 
 
 
630 aa  172  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0324408  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1710  sucrose PTS, EIIBCA  28.73 
 
 
633 aa  171  2e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.433436  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0544  PTS system, trehalose-specific IIBC subunit  29.12 
 
 
475 aa  171  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0541  PTS system, trehalose-specific IIBC component  29.79 
 
 
473 aa  170  4e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000364471  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0980  PTS system, beta-glucoside-specific IIABC subunit  27.62 
 
 
639 aa  169  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.668297  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0508  PTS system, trehalose-specific IIBC subunit  29.67 
 
 
475 aa  168  2e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0495  PTS system, trehalose-specific IIBC subunit  29.67 
 
 
475 aa  168  2e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.247391  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0744  PTS system, beta-glucoside-specific IIABC subunit  27.84 
 
 
634 aa  167  4e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2439  PTS system beta-glucoside-specific transporter subunits IIABC  28.2 
 
 
633 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0118762  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2742  PTS system beta-glucoside-specific transporter subunits IIABC  28.36 
 
 
633 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.234192  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4255  phosphotransferase system EIIC  27.29 
 
 
460 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4245  PTS system, beta-glucoside-specific IIABC subunit  29.28 
 
 
625 aa  163  6e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4272  PTS system beta-glucoside-specific transporter subunits IIABC  29.28 
 
 
625 aa  163  6e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3936  PTS system beta-glucoside-specific transporter subunits IIABC  29.28 
 
 
625 aa  162  8.000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.64171  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03606  fused beta-glucoside-specific PTS enzymes: IIA component/IIB component/IIC component  28.63 
 
 
625 aa  162  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>