More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_1250 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02329  N-acetylmuramic acid phosphotransfer permease  99.16 
 
 
474 aa  937    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3659  PTS system N-acetylmuramic acid transporter subunits EIIBC  99.16 
 
 
474 aa  938    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1232  phosphotransferase system EIIC  100 
 
 
474 aa  945    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2801  PTS system N-acetylmuramic acid transporter subunits EIIBC  99.37 
 
 
474 aa  941    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1250  PTS system N-acetylmuramic acid transporter subunits EIIBC  100 
 
 
474 aa  945    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.290523 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2565  PTS system N-acetylmuramic acid transporter subunits EIIBC  100 
 
 
474 aa  945    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02290  hypothetical protein  99.16 
 
 
474 aa  937    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2584  PTS system N-acetylmuramic acid transporter subunits EIIBC  99.58 
 
 
474 aa  941    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2715  PTS system N-acetylmuramic acid transporter subunits EIIBC  99.79 
 
 
474 aa  944    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001000  PTS system N-acetylmuramic acid-specific IIBC component  60.82 
 
 
484 aa  591  1e-168  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2586  PTS system N-acetylmuramic acid transporter subunits EIIBC  61.62 
 
 
482 aa  567  1e-160  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4458  PTS system, sucrose-specific IIBC component  39.79 
 
 
454 aa  290  3e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.222368  normal  0.618386 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0877  PTS system, sucrose-specific IIBC component  39.79 
 
 
454 aa  290  3e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0914  PTS system, sucrose-specific IIBC component  39.58 
 
 
454 aa  287  2e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0121729  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0733  PTS system, sucrose-specific IIBC component  39.58 
 
 
454 aa  288  2e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000656707  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0919  PTS system, sucrose-specific IIBC component  39.17 
 
 
454 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6517e-42 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0733  phosphotransferase system EIIC  39.38 
 
 
454 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0988  PTS system, sucrose-specific IIBC component  39.38 
 
 
454 aa  286  4e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.55468  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0784  PTS system sucrose-specific transporter subunit IIBC  39.38 
 
 
454 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0823  PTS system sucrose-specific transporter subunit IIBC  39.38 
 
 
454 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262491  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0719  PTS system, sucrose-specific IIBC component  38.96 
 
 
454 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.514005  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3660  phosphotransferase system EIIC  38.91 
 
 
455 aa  276  7e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0671  PTS system, sucrose-specific IIBC component  38.25 
 
 
455 aa  276  8e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1470  phosphotransferase system EIIC  36.71 
 
 
450 aa  274  3e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0563215  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2813  phosphotransferase system, eiic  38.61 
 
 
453 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.526275  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2732  phosphotransferase system, eiic  38.4 
 
 
453 aa  270  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2948  PTS system transporter subunit EIIC  38.19 
 
 
453 aa  270  5.9999999999999995e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2836  PTS system EIIC component  38.4 
 
 
453 aa  270  5.9999999999999995e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.799285 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2773  PTS system transporter subunit EIIC  38.4 
 
 
453 aa  270  5.9999999999999995e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2812  phosphotransferase system EIIC  37.84 
 
 
454 aa  266  5e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1540  phosphotransferase system EIIC  35.31 
 
 
479 aa  256  6e-67  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0177  phosphotransferase system, EIIC  36.4 
 
 
484 aa  251  2e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0182  phosphotransferase system EIIC  36.4 
 
 
484 aa  251  2e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3046  phosphotransferase system, EIIC  37.42 
 
 
453 aa  247  4e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0279286 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3832  phosphotransferase system EIIC  35.62 
 
 
466 aa  242  1e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0971  phosphotransferase system EIIC  36.33 
 
 
468 aa  242  1e-62  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1242  sucrose-specific PTS system IIBC component  37.06 
 
 
645 aa  242  1e-62  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.91372  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1900  PTS system, IIBC components  35.38 
 
 
474 aa  228  2e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0170  phosphotransferase system, EIIC  36.34 
 
 
476 aa  228  2e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00257735  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1067  phosphotransferase system EIIC  34.19 
 
 
446 aa  223  8e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7243  phosphotransferase system PTS, EIIB/EIIC  35.29 
 
 
513 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.838529  normal  0.924215 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1198  phosphotransferase system EIIC  34.87 
 
 
495 aa  211  3e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.742148  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2403  PTS system, sucrose-specific IIBC subunit  28.46 
 
 
480 aa  184  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000860113  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2449  PTS system, sucrose-specific IIBC subunit  28.46 
 
 
480 aa  184  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000521739  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4205  PTS system, sucrose-specific IIBC subunit  32.56 
 
 
456 aa  182  9.000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2021  PTS system, sucrose-specific IIBC subunit  32.75 
 
 
456 aa  179  8e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.139063  normal  0.0932593 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1968  PTS system, sucrose-specific IIBC components  29.6 
 
 
481 aa  177  3e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0000108474  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1285  PTS system, sucrose-specific (IIBC component) transmembrane protein  31.77 
 
 
465 aa  177  3e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.410172  normal  0.484299 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2907  PTS system sucrose-specific EIIBC component ScrA  32.34 
 
 
456 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0119328  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3594  PTS system, sucrose-specific IIBC subunit  33 
 
 
456 aa  171  3e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3433  PTS system, sucrose-specific IIBC subunit  32.59 
 
 
462 aa  170  4e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0234327 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000599  phosphotransferase system sucrose-specific IIBC component  29.39 
 
 
479 aa  170  4e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000683079  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0917  PTS system, sucrose-specific IIBC component  29.03 
 
 
458 aa  170  4e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3757  PTS system, sucrose-specific IIBC subunit  32.92 
 
 
456 aa  170  5e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0342215  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0810  PTS system, sucrose-specific IIBC component  28.81 
 
 
458 aa  169  8e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0668  PTS system, sucrose-specific IIBC component  29.35 
 
 
458 aa  169  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00638232  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0718  PTS system sucrose-specific transporter subunit IIBC  29.35 
 
 
458 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000127924  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0754  PTS system sucrose-specific transporter subunit IIBC  29.35 
 
 
458 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0349  PTS system, sucrose-specific IIBC subunit  32.74 
 
 
456 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0393  PTS system, sucrose-specific IIBC subunit  32.23 
 
 
457 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0813466  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0972  PTS system, sucrose-specific IIBC subunit  31.68 
 
 
485 aa  164  3e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0102663  normal  0.021269 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03606  fused beta-glucoside-specific PTS enzymes: IIA component/IIB component/IIC component  30.11 
 
 
625 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0699  PTS system, trehalose-specific IIBC component  28.72 
 
 
475 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.712537  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03550  hypothetical protein  30.11 
 
 
625 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4231  PTS system beta-glucoside-specific transporter subunits IIABC  30.18 
 
 
625 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4245  PTS system, beta-glucoside-specific IIABC subunit  29.89 
 
 
625 aa  162  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4272  PTS system beta-glucoside-specific transporter subunits IIABC  29.89 
 
 
625 aa  162  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0686  PTS system, trehalose-specific IIBC component  28.51 
 
 
475 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.872474 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0598  PTS system trehalose-specific transporter subunit IIBC  28.51 
 
 
475 aa  161  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0356425  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0542  protein-N(pi)-phosphohistidine-sugar phosphotransferase (PTS system, trehalose-specific IIBC component)  28.51 
 
 
475 aa  161  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0631  PTS system trehalose-specific transporter subunit IIBC  28.51 
 
 
475 aa  161  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3936  PTS system beta-glucoside-specific transporter subunits IIABC  29.89 
 
 
625 aa  162  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.64171  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3482  PTS system, beta-glucoside-specific IIABC subunit  28.07 
 
 
644 aa  161  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0976  phosphotransferase system EIIC  28.03 
 
 
450 aa  161  3e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00180134  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0760  PTS system, trehalose-specific IIBC component  28.51 
 
 
475 aa  160  4e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0763  PTS system, beta-glucoside-specific IIABC subunit  30.22 
 
 
626 aa  160  5e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0747  PTS system, beta-glucoside-specific IIABC subunit  29.71 
 
 
638 aa  160  6e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0542  protein-N(pi)-phosphohistidine-sugar phosphotransferase (PTS system, trehalose-specific IIBC component)  28.51 
 
 
475 aa  160  7e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.190354  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0508  PTS system, trehalose-specific IIBC subunit  29.23 
 
 
475 aa  159  7e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0495  PTS system, trehalose-specific IIBC subunit  29.23 
 
 
475 aa  159  7e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.247391  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4670  PTS system, trehalose-specific IIBC component  28.51 
 
 
475 aa  160  7e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  5.21575e-21 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1785  PTS system, sucrose-specific IIBC component  29.7 
 
 
450 aa  159  8e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000306537  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0597  PTS system, sucrose-specific IIBC component  27.76 
 
 
479 aa  159  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000306243  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1704  PTS system beta-glucoside-specific transporter subunits IIABC  31.69 
 
 
636 aa  159  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.13733  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1513  PTS system, sucrose-specific IIBC component  28.45 
 
 
450 aa  159  1e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000189676  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0667  PTS system, trehalose-specific IIBC component  28.31 
 
 
475 aa  159  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.652435  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3507  PTS system, sucrose-specific IIBC subunit  30.61 
 
 
458 aa  158  3e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0859  PTS system, beta-glucoside-specific enzyme II, ABC component  27.48 
 
 
630 aa  155  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4074  phosphotransferase system EIIC  25.89 
 
 
470 aa  155  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1667  PTS system beta-glucoside-specific transporter subunits IIABC  29.01 
 
 
636 aa  153  5.9999999999999996e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0376301  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0877  PTS system, beta-glucoside-specific enzyme II, ABC component  27.78 
 
 
630 aa  152  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0324408  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2740  PTS system beta-glucoside-specific transporter subunits IIABC  28.37 
 
 
619 aa  152  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1620  PTS system, trehalose-specific IIBC subunit  28.12 
 
 
471 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000938635  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0544  PTS system, trehalose-specific IIBC subunit  28.11 
 
 
475 aa  147  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3657  PTS system, sucrose-specific IIBC subunit  27.8 
 
 
478 aa  148  3e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0933  phosphotransferase system, EIIC  28.33 
 
 
459 aa  146  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.393836  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04108  fused trehalose(maltose)-specific PTS enzyme: IIB component/IIC component  27.34 
 
 
473 aa  144  3e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04072  hypothetical protein  27.34 
 
 
473 aa  144  3e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5762  PTS system trehalose(maltose)-specific transporter subunits IIBC  27.34 
 
 
473 aa  144  3e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.742409  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4721  PTS system trehalose(maltose)-specific transporter subunits IIBC  27.34 
 
 
473 aa  144  3e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.612827 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>