More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2586 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_001000  PTS system N-acetylmuramic acid-specific IIBC component  84.92 
 
 
484 aa  801    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2586  PTS system N-acetylmuramic acid transporter subunits EIIBC  100 
 
 
482 aa  951    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2584  PTS system N-acetylmuramic acid transporter subunits EIIBC  61.83 
 
 
474 aa  595  1e-169  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3659  PTS system N-acetylmuramic acid transporter subunits EIIBC  61.62 
 
 
474 aa  597  1e-169  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02290  hypothetical protein  61.41 
 
 
474 aa  593  1e-168  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02329  N-acetylmuramic acid phosphotransfer permease  61.41 
 
 
474 aa  593  1e-168  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2565  PTS system N-acetylmuramic acid transporter subunits EIIBC  61.62 
 
 
474 aa  594  1e-168  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1232  phosphotransferase system EIIC  61.62 
 
 
474 aa  594  1e-168  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2715  PTS system N-acetylmuramic acid transporter subunits EIIBC  61.41 
 
 
474 aa  593  1e-168  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1250  PTS system N-acetylmuramic acid transporter subunits EIIBC  61.62 
 
 
474 aa  594  1e-168  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.290523 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2801  PTS system N-acetylmuramic acid transporter subunits EIIBC  61 
 
 
474 aa  590  1e-167  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1470  phosphotransferase system EIIC  39.33 
 
 
450 aa  293  4e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0563215  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2812  phosphotransferase system EIIC  39.62 
 
 
454 aa  291  2e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4458  PTS system, sucrose-specific IIBC component  38.2 
 
 
454 aa  290  3e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.222368  normal  0.618386 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0671  PTS system, sucrose-specific IIBC component  38.2 
 
 
455 aa  289  8e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0988  PTS system, sucrose-specific IIBC component  38 
 
 
454 aa  289  8e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.55468  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0733  PTS system, sucrose-specific IIBC component  38 
 
 
454 aa  288  1e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000656707  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0877  PTS system, sucrose-specific IIBC component  38 
 
 
454 aa  288  1e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0914  PTS system, sucrose-specific IIBC component  37.79 
 
 
454 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0121729  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0784  PTS system sucrose-specific transporter subunit IIBC  37.79 
 
 
454 aa  287  4e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0823  PTS system sucrose-specific transporter subunit IIBC  37.79 
 
 
454 aa  287  4e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262491  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0919  PTS system, sucrose-specific IIBC component  37.42 
 
 
454 aa  286  5e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6517e-42 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0733  phosphotransferase system EIIC  37.79 
 
 
454 aa  286  5e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0719  PTS system, sucrose-specific IIBC component  37.21 
 
 
454 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.514005  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3660  phosphotransferase system EIIC  37.78 
 
 
455 aa  283  4.0000000000000003e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2813  phosphotransferase system, eiic  38.05 
 
 
453 aa  276  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.526275  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2732  phosphotransferase system, eiic  37.84 
 
 
453 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2948  PTS system transporter subunit EIIC  37.63 
 
 
453 aa  275  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2836  PTS system EIIC component  37.63 
 
 
453 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.799285 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2773  PTS system transporter subunit EIIC  37.63 
 
 
453 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1540  phosphotransferase system EIIC  37.84 
 
 
479 aa  270  4e-71  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3832  phosphotransferase system EIIC  36.74 
 
 
466 aa  259  7e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0182  phosphotransferase system EIIC  37.11 
 
 
484 aa  256  4e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0177  phosphotransferase system, EIIC  37.11 
 
 
484 aa  256  4e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3046  phosphotransferase system, EIIC  36.95 
 
 
453 aa  254  2.0000000000000002e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0279286 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1067  phosphotransferase system EIIC  35.08 
 
 
446 aa  251  2e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1242  sucrose-specific PTS system IIBC component  36.69 
 
 
645 aa  248  1e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.91372  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1900  PTS system, IIBC components  36.16 
 
 
474 aa  244  1.9999999999999999e-63  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7243  phosphotransferase system PTS, EIIB/EIIC  36.01 
 
 
513 aa  241  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.838529  normal  0.924215 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0170  phosphotransferase system, EIIC  37.03 
 
 
476 aa  231  2e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00257735  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0971  phosphotransferase system EIIC  33.74 
 
 
468 aa  219  8.999999999999998e-56  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1198  phosphotransferase system EIIC  34.72 
 
 
495 aa  212  1e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.742148  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2907  PTS system sucrose-specific EIIBC component ScrA  34.29 
 
 
456 aa  177  5e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0119328  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2021  PTS system, sucrose-specific IIBC subunit  33 
 
 
456 aa  173  5e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.139063  normal  0.0932593 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3757  PTS system, sucrose-specific IIBC subunit  31.45 
 
 
456 aa  173  5.999999999999999e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0342215  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3594  PTS system, sucrose-specific IIBC subunit  32.92 
 
 
456 aa  172  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0349  PTS system, sucrose-specific IIBC subunit  32.75 
 
 
456 aa  171  3e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0747  PTS system, beta-glucoside-specific IIABC subunit  28.92 
 
 
638 aa  171  4e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0859  PTS system, beta-glucoside-specific enzyme II, ABC component  28.16 
 
 
630 aa  168  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0393  PTS system, sucrose-specific IIBC subunit  31.76 
 
 
457 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0813466  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1285  PTS system, sucrose-specific (IIBC component) transmembrane protein  29.83 
 
 
465 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.410172  normal  0.484299 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2449  PTS system, sucrose-specific IIBC subunit  28.46 
 
 
480 aa  166  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000521739  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2403  PTS system, sucrose-specific IIBC subunit  28.46 
 
 
480 aa  166  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000860113  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0668  PTS system, sucrose-specific IIBC component  29.83 
 
 
458 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00638232  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0917  PTS system, sucrose-specific IIBC component  29.83 
 
 
458 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3507  PTS system, sucrose-specific IIBC subunit  29.63 
 
 
458 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3433  PTS system, sucrose-specific IIBC subunit  33.25 
 
 
462 aa  163  6e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0234327 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0810  PTS system, sucrose-specific IIBC component  29.62 
 
 
458 aa  163  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0877  PTS system, beta-glucoside-specific enzyme II, ABC component  28.4 
 
 
630 aa  162  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0324408  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4205  PTS system, sucrose-specific IIBC subunit  30.79 
 
 
456 aa  162  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3482  PTS system, beta-glucoside-specific IIABC subunit  27.25 
 
 
644 aa  161  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0718  PTS system sucrose-specific transporter subunit IIBC  28.99 
 
 
458 aa  162  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000127924  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0754  PTS system sucrose-specific transporter subunit IIBC  28.99 
 
 
458 aa  162  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1620  PTS system, trehalose-specific IIBC subunit  28.98 
 
 
471 aa  161  3e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000938635  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1968  PTS system, sucrose-specific IIBC components  28.36 
 
 
481 aa  160  6e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0000108474  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1667  PTS system beta-glucoside-specific transporter subunits IIABC  28.86 
 
 
636 aa  160  6e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0376301  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03606  fused beta-glucoside-specific PTS enzymes: IIA component/IIB component/IIC component  28.18 
 
 
625 aa  159  8e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03550  hypothetical protein  28.18 
 
 
625 aa  159  8e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1704  PTS system beta-glucoside-specific transporter subunits IIABC  29.27 
 
 
636 aa  158  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.13733  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2554  PTS system, trehalose-specific IIBC subunit  30 
 
 
472 aa  158  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1710  sucrose PTS, EIIBCA  28.72 
 
 
633 aa  158  2e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.433436  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4245  PTS system, beta-glucoside-specific IIABC subunit  28.18 
 
 
625 aa  157  3e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4272  PTS system beta-glucoside-specific transporter subunits IIABC  28.18 
 
 
625 aa  157  3e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4231  PTS system beta-glucoside-specific transporter subunits IIABC  27.94 
 
 
625 aa  157  3e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3936  PTS system beta-glucoside-specific transporter subunits IIABC  28.18 
 
 
625 aa  157  4e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.64171  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0763  PTS system, beta-glucoside-specific IIABC subunit  27.83 
 
 
626 aa  157  4e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000599  phosphotransferase system sucrose-specific IIBC component  28.08 
 
 
479 aa  157  6e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000683079  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3657  PTS system, sucrose-specific IIBC subunit  28.6 
 
 
478 aa  156  1e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0699  PTS system, trehalose-specific IIBC component  24.9 
 
 
475 aa  154  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.712537  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0542  protein-N(pi)-phosphohistidine-sugar phosphotransferase (PTS system, trehalose-specific IIBC component)  25.25 
 
 
475 aa  154  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0686  PTS system, trehalose-specific IIBC component  25.25 
 
 
475 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.872474 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0760  PTS system, trehalose-specific IIBC component  25.45 
 
 
475 aa  155  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0598  PTS system trehalose-specific transporter subunit IIBC  24.9 
 
 
475 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0356425  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0631  PTS system trehalose-specific transporter subunit IIBC  24.9 
 
 
475 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0784  PTS system, beta-glucoside-specific IIABC subunit  27.66 
 
 
636 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.063374  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0508  PTS system, trehalose-specific IIBC subunit  29.95 
 
 
475 aa  154  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1513  PTS system, sucrose-specific IIBC component  30.02 
 
 
450 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000189676  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0495  PTS system, trehalose-specific IIBC subunit  29.95 
 
 
475 aa  154  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.247391  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1690  PTS system, IIABC components  28.6 
 
 
639 aa  154  4e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.151541  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0667  PTS system, trehalose-specific IIBC component  24.9 
 
 
475 aa  154  4e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.652435  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4670  PTS system, trehalose-specific IIBC component  25.05 
 
 
475 aa  154  4e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  5.21575e-21 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0597  PTS system, sucrose-specific IIBC component  27.4 
 
 
479 aa  154  4e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000306243  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2439  PTS system beta-glucoside-specific transporter subunits IIABC  28.28 
 
 
633 aa  153  5e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0118762  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1785  PTS system, sucrose-specific IIBC component  28.72 
 
 
450 aa  154  5e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000306537  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0542  protein-N(pi)-phosphohistidine-sugar phosphotransferase (PTS system, trehalose-specific IIBC component)  25.4 
 
 
475 aa  153  7e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.190354  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2740  PTS system beta-glucoside-specific transporter subunits IIABC  27.19 
 
 
619 aa  153  7e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0972  PTS system, sucrose-specific IIBC subunit  29.48 
 
 
485 aa  153  8e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0102663  normal  0.021269 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04108  fused trehalose(maltose)-specific PTS enzyme: IIB component/IIC component  25.87 
 
 
473 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04072  hypothetical protein  25.87 
 
 
473 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2742  PTS system beta-glucoside-specific transporter subunits IIABC  29.08 
 
 
633 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.234192  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>