274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0971 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_0971  phosphotransferase system EIIC  100 
 
 
468 aa  913    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1198  phosphotransferase system EIIC  55.76 
 
 
495 aa  515  1.0000000000000001e-145  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.742148  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4458  PTS system, sucrose-specific IIBC component  41.67 
 
 
454 aa  348  1e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.222368  normal  0.618386 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0877  PTS system, sucrose-specific IIBC component  41.67 
 
 
454 aa  348  1e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0733  phosphotransferase system EIIC  41.45 
 
 
454 aa  346  6e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0671  PTS system, sucrose-specific IIBC component  40.3 
 
 
455 aa  346  6e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0733  PTS system, sucrose-specific IIBC component  41.45 
 
 
454 aa  345  1e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000656707  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0784  PTS system sucrose-specific transporter subunit IIBC  41.24 
 
 
454 aa  344  2e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0823  PTS system sucrose-specific transporter subunit IIBC  41.24 
 
 
454 aa  344  2e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262491  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0988  PTS system, sucrose-specific IIBC component  42 
 
 
454 aa  344  2e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.55468  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0719  PTS system, sucrose-specific IIBC component  41.03 
 
 
454 aa  343  5e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.514005  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0919  PTS system, sucrose-specific IIBC component  41.03 
 
 
454 aa  342  8e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6517e-42 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0914  PTS system, sucrose-specific IIBC component  41.79 
 
 
454 aa  342  8e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0121729  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2812  phosphotransferase system EIIC  40.9 
 
 
454 aa  337  3.9999999999999995e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1470  phosphotransferase system EIIC  40.73 
 
 
450 aa  336  5e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0563215  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3832  phosphotransferase system EIIC  42.28 
 
 
466 aa  332  9e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1242  sucrose-specific PTS system IIBC component  39.42 
 
 
645 aa  306  5.0000000000000004e-82  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.91372  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0182  phosphotransferase system EIIC  38.52 
 
 
484 aa  295  1e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0177  phosphotransferase system, EIIC  38.52 
 
 
484 aa  295  1e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1067  phosphotransferase system EIIC  38.76 
 
 
446 aa  285  9e-76  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0170  phosphotransferase system, EIIC  41.76 
 
 
476 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00257735  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2732  phosphotransferase system, eiic  37.93 
 
 
453 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2948  PTS system transporter subunit EIIC  37.72 
 
 
453 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2773  PTS system transporter subunit EIIC  37.93 
 
 
453 aa  277  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2836  PTS system EIIC component  37.93 
 
 
453 aa  277  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.799285 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2813  phosphotransferase system, eiic  37.72 
 
 
453 aa  277  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.526275  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3660  phosphotransferase system EIIC  37.23 
 
 
455 aa  274  3e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1900  PTS system, IIBC components  38.03 
 
 
474 aa  273  6e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3046  phosphotransferase system, EIIC  38.39 
 
 
453 aa  264  2e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0279286 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1540  phosphotransferase system EIIC  37.61 
 
 
479 aa  262  8.999999999999999e-69  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7243  phosphotransferase system PTS, EIIB/EIIC  34.54 
 
 
513 aa  251  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.838529  normal  0.924215 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2715  PTS system N-acetylmuramic acid transporter subunits EIIBC  36.53 
 
 
474 aa  238  1e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02329  N-acetylmuramic acid phosphotransfer permease  36.53 
 
 
474 aa  238  2e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1232  phosphotransferase system EIIC  36.33 
 
 
474 aa  238  2e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02290  hypothetical protein  36.53 
 
 
474 aa  238  2e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2565  PTS system N-acetylmuramic acid transporter subunits EIIBC  36.33 
 
 
474 aa  238  2e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1250  PTS system N-acetylmuramic acid transporter subunits EIIBC  36.33 
 
 
474 aa  238  2e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.290523 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2801  PTS system N-acetylmuramic acid transporter subunits EIIBC  36.12 
 
 
474 aa  236  9e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3659  PTS system N-acetylmuramic acid transporter subunits EIIBC  36.27 
 
 
474 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2584  PTS system N-acetylmuramic acid transporter subunits EIIBC  36.12 
 
 
474 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001000  PTS system N-acetylmuramic acid-specific IIBC component  36.14 
 
 
484 aa  234  3e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2586  PTS system N-acetylmuramic acid transporter subunits EIIBC  33.4 
 
 
482 aa  207  5e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2449  PTS system, sucrose-specific IIBC subunit  30.78 
 
 
480 aa  204  2e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000521739  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2403  PTS system, sucrose-specific IIBC subunit  30.78 
 
 
480 aa  204  2e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000860113  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1968  PTS system, sucrose-specific IIBC components  32.35 
 
 
481 aa  203  4e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0000108474  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000599  phosphotransferase system sucrose-specific IIBC component  31.36 
 
 
479 aa  201  3e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000683079  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3594  PTS system, sucrose-specific IIBC subunit  32.06 
 
 
456 aa  192  1e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3757  PTS system, sucrose-specific IIBC subunit  31.63 
 
 
456 aa  189  8e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0342215  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3507  PTS system, sucrose-specific IIBC subunit  32.71 
 
 
458 aa  189  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0597  PTS system, sucrose-specific IIBC component  30.57 
 
 
479 aa  189  1e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000306243  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1620  PTS system, trehalose-specific IIBC subunit  31.42 
 
 
471 aa  186  9e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000938635  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0972  PTS system, sucrose-specific IIBC subunit  30.99 
 
 
485 aa  185  2.0000000000000003e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0102663  normal  0.021269 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2554  PTS system, trehalose-specific IIBC subunit  32.15 
 
 
472 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0810  PTS system, sucrose-specific IIBC component  33.12 
 
 
458 aa  183  6e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0668  PTS system, sucrose-specific IIBC component  32.41 
 
 
458 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00638232  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0917  PTS system, sucrose-specific IIBC component  32.84 
 
 
458 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2907  PTS system sucrose-specific EIIBC component ScrA  31.16 
 
 
456 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0119328  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3482  PTS system, beta-glucoside-specific IIABC subunit  31.49 
 
 
644 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0718  PTS system sucrose-specific transporter subunit IIBC  32.41 
 
 
458 aa  181  4e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000127924  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0754  PTS system sucrose-specific transporter subunit IIBC  32.41 
 
 
458 aa  181  4e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3657  PTS system, sucrose-specific IIBC subunit  31.03 
 
 
478 aa  179  7e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2021  PTS system, sucrose-specific IIBC subunit  31.38 
 
 
456 aa  179  7e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.139063  normal  0.0932593 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1690  PTS system, IIABC components  30.32 
 
 
639 aa  179  1e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.151541  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1710  sucrose PTS, EIIBCA  31.7 
 
 
633 aa  179  1e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.433436  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0349  PTS system, sucrose-specific IIBC subunit  32.01 
 
 
456 aa  178  2e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4205  PTS system, sucrose-specific IIBC subunit  31.11 
 
 
456 aa  177  3e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0393  PTS system, sucrose-specific IIBC subunit  31.59 
 
 
457 aa  177  4e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0813466  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0859  PTS system, beta-glucoside-specific enzyme II, ABC component  27.62 
 
 
630 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1513  PTS system, sucrose-specific IIBC component  30.11 
 
 
450 aa  167  4e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000189676  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0760  PTS system, trehalose-specific IIBC component  27.22 
 
 
475 aa  167  5e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0542  protein-N(pi)-phosphohistidine-sugar phosphotransferase (PTS system, trehalose-specific IIBC component)  26.93 
 
 
475 aa  167  5e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.190354  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0667  PTS system, trehalose-specific IIBC component  27.22 
 
 
475 aa  167  5e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.652435  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4670  PTS system, trehalose-specific IIBC component  27.01 
 
 
475 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  5.21575e-21 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0699  PTS system, trehalose-specific IIBC component  26.75 
 
 
475 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.712537  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1785  PTS system, sucrose-specific IIBC component  30.42 
 
 
450 aa  165  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000306537  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0598  PTS system trehalose-specific transporter subunit IIBC  26.75 
 
 
475 aa  164  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0356425  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0542  protein-N(pi)-phosphohistidine-sugar phosphotransferase (PTS system, trehalose-specific IIBC component)  26.75 
 
 
475 aa  164  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0631  PTS system trehalose-specific transporter subunit IIBC  26.75 
 
 
475 aa  164  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0686  PTS system, trehalose-specific IIBC component  26.75 
 
 
475 aa  164  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.872474 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1778  sucrose PTS, EIIBCA  27.43 
 
 
647 aa  164  4.0000000000000004e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000018652  hitchhiker  0.000000000675608 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1285  PTS system, sucrose-specific (IIBC component) transmembrane protein  28.11 
 
 
465 aa  162  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.410172  normal  0.484299 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0288  sucrose PTS, EIIBCA  27.03 
 
 
653 aa  160  4e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0534348  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3433  PTS system, sucrose-specific IIBC subunit  28.2 
 
 
462 aa  158  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0234327 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0976  phosphotransferase system EIIC  28.45 
 
 
450 aa  155  1e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00180134  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4064  phosphotransferase system EIIC  28.45 
 
 
462 aa  155  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0784  PTS system, beta-glucoside-specific IIABC subunit  28.66 
 
 
636 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.063374  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4074  phosphotransferase system EIIC  28.18 
 
 
470 aa  154  4e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0877  PTS system, beta-glucoside-specific enzyme II, ABC component  27.62 
 
 
630 aa  153  7e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0324408  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0508  PTS system, trehalose-specific IIBC subunit  29.5 
 
 
475 aa  152  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0495  PTS system, trehalose-specific IIBC subunit  29.5 
 
 
475 aa  152  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.247391  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0763  PTS system, beta-glucoside-specific IIABC subunit  26.12 
 
 
626 aa  152  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0577  PTS system trehalose(maltose)-specific transporter subunits IIBC  28.18 
 
 
474 aa  150  4e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0544  PTS system, trehalose-specific IIBC subunit  26.8 
 
 
475 aa  150  4e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2418  PTS system, glucose-like IIB subunint  27.93 
 
 
489 aa  150  5e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000324347  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4255  phosphotransferase system EIIC  28.25 
 
 
460 aa  150  5e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1667  PTS system beta-glucoside-specific transporter subunits IIABC  26.69 
 
 
636 aa  150  5e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0376301  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2439  PTS system beta-glucoside-specific transporter subunits IIABC  27.78 
 
 
633 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0118762  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4856  PTS system trehalose(maltose)-specific transporter subunits IIBC  26.96 
 
 
472 aa  146  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000588436  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1335  PTS system, trehalose-specific IIBC subunit  26.42 
 
 
497 aa  146  9e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.135548  hitchhiker  0.00345051 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4737  PTS system trehalose(maltose)-specific transporter subunits IIBC  26.27 
 
 
472 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>