More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1198 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013203  Apar_1198  phosphotransferase system EIIC  100 
 
 
495 aa  989    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.742148  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0971  phosphotransferase system EIIC  55.76 
 
 
468 aa  514  1e-144  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0877  PTS system, sucrose-specific IIBC component  39.23 
 
 
454 aa  325  8.000000000000001e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4458  PTS system, sucrose-specific IIBC component  39.02 
 
 
454 aa  324  3e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.222368  normal  0.618386 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0671  PTS system, sucrose-specific IIBC component  39.14 
 
 
455 aa  324  3e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1470  phosphotransferase system EIIC  38.52 
 
 
450 aa  323  6e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0563215  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0914  PTS system, sucrose-specific IIBC component  38.62 
 
 
454 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0121729  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0919  PTS system, sucrose-specific IIBC component  38.62 
 
 
454 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6517e-42 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0733  phosphotransferase system EIIC  38.82 
 
 
454 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0733  PTS system, sucrose-specific IIBC component  38.62 
 
 
454 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000656707  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0719  PTS system, sucrose-specific IIBC component  38.62 
 
 
454 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.514005  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0784  PTS system sucrose-specific transporter subunit IIBC  38.62 
 
 
454 aa  320  3e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0823  PTS system sucrose-specific transporter subunit IIBC  38.62 
 
 
454 aa  320  3e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262491  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0988  PTS system, sucrose-specific IIBC component  38.62 
 
 
454 aa  320  3e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.55468  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2812  phosphotransferase system EIIC  38.52 
 
 
454 aa  317  2e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3832  phosphotransferase system EIIC  39.16 
 
 
466 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0182  phosphotransferase system EIIC  37.25 
 
 
484 aa  297  3e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0177  phosphotransferase system, EIIC  37.25 
 
 
484 aa  297  3e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2836  PTS system EIIC component  38.46 
 
 
453 aa  293  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.799285 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2773  PTS system transporter subunit EIIC  38.46 
 
 
453 aa  293  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2732  phosphotransferase system, eiic  38.66 
 
 
453 aa  293  7e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2813  phosphotransferase system, eiic  38.87 
 
 
453 aa  292  8e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.526275  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2948  PTS system transporter subunit EIIC  38.46 
 
 
453 aa  292  9e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3660  phosphotransferase system EIIC  38.79 
 
 
455 aa  289  1e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0170  phosphotransferase system, EIIC  39.63 
 
 
476 aa  280  5e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00257735  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3046  phosphotransferase system, EIIC  37.14 
 
 
453 aa  268  2e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0279286 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1242  sucrose-specific PTS system IIBC component  37.04 
 
 
645 aa  266  8e-70  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.91372  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1067  phosphotransferase system EIIC  38.11 
 
 
446 aa  263  6.999999999999999e-69  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1900  PTS system, IIBC components  34.34 
 
 
474 aa  258  2e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7243  phosphotransferase system PTS, EIIB/EIIC  34.36 
 
 
513 aa  247  4e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.838529  normal  0.924215 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1540  phosphotransferase system EIIC  34.27 
 
 
479 aa  236  6e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4205  PTS system, sucrose-specific IIBC subunit  32.38 
 
 
456 aa  219  1e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001000  PTS system N-acetylmuramic acid-specific IIBC component  33.73 
 
 
484 aa  218  2e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2021  PTS system, sucrose-specific IIBC subunit  31.98 
 
 
456 aa  216  5e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.139063  normal  0.0932593 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2907  PTS system sucrose-specific EIIBC component ScrA  31.24 
 
 
456 aa  216  8e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0119328  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3594  PTS system, sucrose-specific IIBC subunit  30.88 
 
 
456 aa  213  9e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0349  PTS system, sucrose-specific IIBC subunit  31.98 
 
 
456 aa  210  4e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0393  PTS system, sucrose-specific IIBC subunit  31.98 
 
 
457 aa  209  7e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0813466  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1968  PTS system, sucrose-specific IIBC components  32.39 
 
 
481 aa  207  5e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0000108474  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3757  PTS system, sucrose-specific IIBC subunit  31.29 
 
 
456 aa  206  7e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0342215  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0597  PTS system, sucrose-specific IIBC component  30.37 
 
 
479 aa  206  8e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000306243  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2403  PTS system, sucrose-specific IIBC subunit  31.54 
 
 
480 aa  204  2e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000860113  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2449  PTS system, sucrose-specific IIBC subunit  31.54 
 
 
480 aa  204  2e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000521739  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000599  phosphotransferase system sucrose-specific IIBC component  30.77 
 
 
479 aa  204  3e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000683079  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2586  PTS system N-acetylmuramic acid transporter subunits EIIBC  34.52 
 
 
482 aa  204  4e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02329  N-acetylmuramic acid phosphotransfer permease  33.86 
 
 
474 aa  202  9e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02290  hypothetical protein  33.86 
 
 
474 aa  202  9e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1232  phosphotransferase system EIIC  33.47 
 
 
474 aa  201  3e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2715  PTS system N-acetylmuramic acid transporter subunits EIIBC  33.66 
 
 
474 aa  201  3e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1250  PTS system N-acetylmuramic acid transporter subunits EIIBC  33.47 
 
 
474 aa  201  3e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.290523 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2565  PTS system N-acetylmuramic acid transporter subunits EIIBC  33.47 
 
 
474 aa  201  3e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3659  PTS system N-acetylmuramic acid transporter subunits EIIBC  33.47 
 
 
474 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0810  PTS system, sucrose-specific IIBC component  30.88 
 
 
458 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2801  PTS system N-acetylmuramic acid transporter subunits EIIBC  33.27 
 
 
474 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0917  PTS system, sucrose-specific IIBC component  30.94 
 
 
458 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0668  PTS system, sucrose-specific IIBC component  31.15 
 
 
458 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00638232  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2584  PTS system N-acetylmuramic acid transporter subunits EIIBC  33.27 
 
 
474 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0718  PTS system sucrose-specific transporter subunit IIBC  30.94 
 
 
458 aa  196  6e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000127924  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0754  PTS system sucrose-specific transporter subunit IIBC  30.94 
 
 
458 aa  196  6e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0972  PTS system, sucrose-specific IIBC subunit  29.86 
 
 
485 aa  191  4e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0102663  normal  0.021269 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3657  PTS system, sucrose-specific IIBC subunit  28.85 
 
 
478 aa  187  3e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0760  PTS system, trehalose-specific IIBC component  27.45 
 
 
475 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4670  PTS system, trehalose-specific IIBC component  29.06 
 
 
475 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  5.21575e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0667  PTS system, trehalose-specific IIBC component  28.66 
 
 
475 aa  181  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.652435  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0699  PTS system, trehalose-specific IIBC component  27.92 
 
 
475 aa  181  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.712537  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0598  PTS system trehalose-specific transporter subunit IIBC  27.92 
 
 
475 aa  182  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0356425  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0542  protein-N(pi)-phosphohistidine-sugar phosphotransferase (PTS system, trehalose-specific IIBC component)  27.92 
 
 
475 aa  182  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0542  protein-N(pi)-phosphohistidine-sugar phosphotransferase (PTS system, trehalose-specific IIBC component)  27.25 
 
 
475 aa  182  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.190354  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0631  PTS system trehalose-specific transporter subunit IIBC  27.92 
 
 
475 aa  182  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0686  PTS system, trehalose-specific IIBC component  27.92 
 
 
475 aa  182  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.872474 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3507  PTS system, sucrose-specific IIBC subunit  29.58 
 
 
458 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1620  PTS system, trehalose-specific IIBC subunit  29.9 
 
 
471 aa  179  1e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000938635  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1778  sucrose PTS, EIIBCA  29.41 
 
 
647 aa  175  9.999999999999999e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000018652  hitchhiker  0.000000000675608 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2554  PTS system, trehalose-specific IIBC subunit  30.04 
 
 
472 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3482  PTS system, beta-glucoside-specific IIABC subunit  30.43 
 
 
644 aa  173  6.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0859  PTS system, beta-glucoside-specific enzyme II, ABC component  30.14 
 
 
630 aa  173  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1285  PTS system, sucrose-specific (IIBC component) transmembrane protein  28.27 
 
 
465 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.410172  normal  0.484299 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2439  PTS system beta-glucoside-specific transporter subunits IIABC  28.83 
 
 
633 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0118762  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0544  PTS system, trehalose-specific IIBC subunit  29.11 
 
 
475 aa  167  4e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1667  PTS system beta-glucoside-specific transporter subunits IIABC  27.77 
 
 
636 aa  166  8e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0376301  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0288  sucrose PTS, EIIBCA  28.54 
 
 
653 aa  166  1.0000000000000001e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0534348  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2740  PTS system beta-glucoside-specific transporter subunits IIABC  29.01 
 
 
619 aa  163  5.0000000000000005e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3433  PTS system, sucrose-specific IIBC subunit  28.97 
 
 
462 aa  163  8.000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0234327 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1710  sucrose PTS, EIIBCA  29.9 
 
 
633 aa  162  1e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.433436  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2742  PTS system beta-glucoside-specific transporter subunits IIABC  28.72 
 
 
633 aa  160  4e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.234192  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1690  PTS system, IIABC components  28.54 
 
 
639 aa  157  3e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.151541  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0976  phosphotransferase system EIIC  27.97 
 
 
450 aa  157  4e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00180134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0877  PTS system, beta-glucoside-specific enzyme II, ABC component  29.32 
 
 
630 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0324408  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1704  PTS system beta-glucoside-specific transporter subunits IIABC  27.38 
 
 
636 aa  155  1e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.13733  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4064  phosphotransferase system EIIC  27.88 
 
 
462 aa  152  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01205  PTS system trehalose(maltose)-specific transporter subunits IIBC  28.1 
 
 
468 aa  152  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4255  phosphotransferase system EIIC  26.18 
 
 
460 aa  152  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0432  PTS system trehalose(maltose)-specific transporter subunits IIBC  28.05 
 
 
478 aa  152  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00257211  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0077  PTS system, trehalose-specific IIBC subunit  27.22 
 
 
643 aa  151  3e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.569592  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1785  PTS system, sucrose-specific IIBC component  28.69 
 
 
450 aa  151  3e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000306537  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0784  PTS system, beta-glucoside-specific IIABC subunit  27.38 
 
 
636 aa  151  3e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.063374  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004235  phosphotransferase system trehalose-specific IIBC component  28.1 
 
 
474 aa  151  3e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.712328  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1335  PTS system, trehalose-specific IIBC subunit  27.4 
 
 
497 aa  150  5e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.135548  hitchhiker  0.00345051 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0439  PTS system trehalose(maltose)-specific transporter subunits IIBC  28.16 
 
 
473 aa  149  8e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1513  PTS system, sucrose-specific IIBC component  28.27 
 
 
450 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000189676  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>