208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1314 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1314  Na+/xyloside symporter related transporter  100 
 
 
470 aa  933    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.313105  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2246  Na+/xyloside symporter related transporter  58.62 
 
 
462 aa  505  9.999999999999999e-143  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0305  Na+/xyloside symporter or related transporter  51.5 
 
 
479 aa  500  1e-140  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0574168  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1065  Na+/lactose symporter related transporter  47.28 
 
 
639 aa  453  1.0000000000000001e-126  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0728  Na+/xyloside symporter  49.68 
 
 
495 aa  448  1e-125  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0449813  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1367  Na+/xyloside symporter or related transporter  47.53 
 
 
634 aa  440  9.999999999999999e-123  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.316422  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1086  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  47.89 
 
 
640 aa  435  1e-121  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0880  Na+/xyloside symporter related transporter  47.33 
 
 
640 aa  404  1e-111  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0363049  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1768  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  47.61 
 
 
650 aa  365  1e-99  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000025521  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1454  sugar transporter  30.6 
 
 
454 aa  238  2e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1935  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  27.98 
 
 
461 aa  227  4e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0071  melibiose:sodium symporter  28.76 
 
 
448 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00245996  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4645  melibiose:sodium symporter  26.3 
 
 
476 aa  150  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.752392  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4586  melibiose:sodium symporter  25.1 
 
 
481 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3907  melibiose:sodium symporter  25.1 
 
 
473 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4361  melibiose:sodium symporter  25.1 
 
 
473 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4674  melibiose:sodium symporter  25.1 
 
 
473 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4563  melibiose:sodium symporter  26.1 
 
 
476 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4554  melibiose:sodium symporter  26.1 
 
 
476 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4694  melibiose:sodium symporter  26.1 
 
 
476 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.772252  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4645  melibiose:sodium symporter  26.1 
 
 
476 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5634  melibiose:sodium symporter  24.9 
 
 
481 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03952  hypothetical protein  24.89 
 
 
469 aa  146  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03991  melibiose:sodium symporter  24.89 
 
 
469 aa  146  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3872  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  24.89 
 
 
469 aa  145  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1245  Na+/xyloside symporter related transporter  25.73 
 
 
467 aa  125  2e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0733  sodium:glactoside symporter family protein  24.25 
 
 
465 aa  124  3e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.958172  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0748  sodium:glactoside symporter family protein  24.41 
 
 
454 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.329176  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0764  sugar glycoside-pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  24.03 
 
 
454 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00819234  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4110  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  23.4 
 
 
467 aa  113  7.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002666  galactose permease  23.1 
 
 
462 aa  112  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4261  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter family protein  22.98 
 
 
467 aa  110  5e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5322  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter family protein  22.93 
 
 
467 aa  110  5e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.357419 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4399  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter family protein  22.93 
 
 
467 aa  110  6e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3314  glucuronide transporter  25.18 
 
 
457 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03761  predicted transporter  23.08 
 
 
467 aa  108  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03710  hypothetical protein  23.08 
 
 
467 aa  108  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2498  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  21.83 
 
 
480 aa  107  5e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.358109  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0781  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.37 
 
 
474 aa  107  7e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0709  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.37 
 
 
474 aa  107  7e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0195  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.37 
 
 
474 aa  107  7e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0477575 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3697  sugar:cation symporter family protein  24.74 
 
 
467 aa  105  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.455392  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4227  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  24.47 
 
 
473 aa  104  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4248  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  23.66 
 
 
472 aa  103  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2719  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.68 
 
 
443 aa  102  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0761738  normal  0.0687051 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4293  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  23.44 
 
 
472 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0966548  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4339  putative permease  23.44 
 
 
474 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3732  sugar:cation symporter family protein  24.89 
 
 
443 aa  99.4  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.170381  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4262  sugar transporter family protein  25.06 
 
 
461 aa  99  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4405  glucuronide carrier protein  24.42 
 
 
473 aa  98.6  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.196167  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5323  sugar transporter family protein  25.06 
 
 
461 aa  99  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.333242 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4109  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  25.06 
 
 
461 aa  97.8  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4954  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  22.92 
 
 
463 aa  98.2  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0843133  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4400  sugar transporter family protein  25.06 
 
 
468 aa  98.2  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1593  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  23.35 
 
 
462 aa  97.8  4e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.113599  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0789  glucuronide transporter  24.88 
 
 
469 aa  97.8  4e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4294  inner membrane symporter YihP  22.51 
 
 
460 aa  97.1  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.357729  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4249  inner membrane symporter YihP  22.51 
 
 
460 aa  97.1  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03762  predicted transporter  24.82 
 
 
468 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4340  inner membrane symporter YihP  22.51 
 
 
460 aa  96.3  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03711  hypothetical protein  24.82 
 
 
468 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2602  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.11 
 
 
475 aa  95.9  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.178809  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01585  glucuronide transporter  23.84 
 
 
457 aa  93.2  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2026  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  23.6 
 
 
457 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.232812  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01575  hypothetical protein  23.84 
 
 
457 aa  93.2  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.845658  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3708  sugar:cation symporter family protein  23.18 
 
 
442 aa  92.4  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2284  putative cation symporter  24.18 
 
 
461 aa  92.4  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974122 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1691  glucuronide transporter  23.6 
 
 
457 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1614  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  22.98 
 
 
448 aa  91.7  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0329184  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1824  glucuronide transporter  23.6 
 
 
457 aa  90.5  5e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1583  glucuronide transporter  23.6 
 
 
457 aa  90.5  7e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2327  glucuronide transporter  23.36 
 
 
457 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5398  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  23.34 
 
 
471 aa  89.4  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.243683  normal  0.179969 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3335  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  22.7 
 
 
460 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736057  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0456  putative symporter YagG  24.72 
 
 
459 aa  88.6  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0319555 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1406  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  22.22 
 
 
471 aa  87.4  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.455319  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4406  inner membrane symporter YihP  23.44 
 
 
460 aa  85.9  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0907861  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2993  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.34 
 
 
475 aa  84.7  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.624539  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4228  inner membrane symporter YihP  23.44 
 
 
460 aa  84.7  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0657  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.46 
 
 
465 aa  84.7  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.242235  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0162  Na+/galactoside symporter  23.86 
 
 
468 aa  83.6  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0167  Na+/galactoside symporter  23.86 
 
 
468 aa  84  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.774115  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0170  Na+/galactoside symporter  23.86 
 
 
468 aa  84  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.671323  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0163  Na+/galactoside symporter  24.32 
 
 
468 aa  84  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1315  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.59 
 
 
442 aa  83.6  0.000000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3985  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  21.72 
 
 
476 aa  83.2  0.000000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.439786  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2372  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  21.67 
 
 
457 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.100315  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0162  Na+/galactoside symporter  24.25 
 
 
468 aa  82.8  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1675  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  23.14 
 
 
462 aa  82  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1144  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  21.65 
 
 
468 aa  82.4  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2997  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  23.36 
 
 
484 aa  80.5  0.00000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.738547  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2608  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  28.82 
 
 
442 aa  80.5  0.00000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1592  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  23.38 
 
 
464 aa  80.1  0.00000000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00442608  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0571  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  21.43 
 
 
457 aa  79.7  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.74034  normal  0.0218606 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1395  hypothetical protein  24.71 
 
 
443 aa  79.7  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00525698 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1130  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.07 
 
 
441 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1269  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  23.65 
 
 
465 aa  79.3  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.727469  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3350  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  25 
 
 
477 aa  79  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2992  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.05 
 
 
472 aa  78.2  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3175  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  23.65 
 
 
442 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0664881  normal  0.904255 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>