248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_13771 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008819  NATL1_17501  GPH family sugar transporter  70.92 
 
 
467 aa  634    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.276796  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13771  GPH family sugar transporter  100 
 
 
472 aa  934    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.66133  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0894  putative GPH family sugar transporter  70.75 
 
 
451 aa  628  1e-179  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.351001  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2095  GPH family sugar transporter  65.63 
 
 
442 aa  580  1e-164  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05681  GPH family sugar transporter  63.95 
 
 
480 aa  581  1e-164  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0576  GPH family sugar transporter  61.42 
 
 
455 aa  568  1e-161  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14841  GPH family sugar transporter  62.97 
 
 
449 aa  539  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1421  GPH family sugar transporter  62.3 
 
 
448 aa  527  1e-148  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15231  GPH family sugar transporter  61.85 
 
 
448 aa  518  1e-146  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15091  GPH family sugar transporter  61.85 
 
 
448 aa  520  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3858  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  33.94 
 
 
469 aa  243  3.9999999999999997e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.784369  normal  0.0678057 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0571  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  36.42 
 
 
457 aa  243  7.999999999999999e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.74034  normal  0.0218606 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1406  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  34.76 
 
 
471 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.455319  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3583  galactoside symporter  33.48 
 
 
475 aa  229  9e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.012026 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2335  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  33.33 
 
 
476 aa  226  8e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3190  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  35.35 
 
 
460 aa  220  3e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.712372 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2906  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  35.12 
 
 
460 aa  219  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3387  major facilitator superfamily MFS_1  30.87 
 
 
475 aa  184  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0724765 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0200  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  42.65 
 
 
544 aa  144  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3996  major facilitator transporter  26.35 
 
 
443 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.14105  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2816  major facilitator superfamily protein  26.2 
 
 
459 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4415  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  46.05 
 
 
552 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4479  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  46.05 
 
 
552 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.176062 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0290  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.77 
 
 
472 aa  129  1.0000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000222424  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3732  sugar:cation symporter family protein  27.32 
 
 
443 aa  128  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.170381  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4014  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.11 
 
 
466 aa  126  8.000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.85917  normal  0.255078 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0388  major facilitator transporter  26.09 
 
 
497 aa  124  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.991466  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0733  sodium:glactoside symporter family protein  27.36 
 
 
465 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.958172  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0459  major facilitator transporter  27.53 
 
 
481 aa  117  6e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1315  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  23.89 
 
 
442 aa  114  3e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1614  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.15 
 
 
448 aa  111  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0329184  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8054  Na+/melibiose symporter and related transporter- like protein  25 
 
 
460 aa  110  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0444125  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0657  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  23.33 
 
 
465 aa  110  6e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.242235  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1130  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.18 
 
 
441 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2608  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.12 
 
 
442 aa  109  9.000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3175  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  24.18 
 
 
442 aa  109  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0664881  normal  0.904255 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3335  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  25.88 
 
 
460 aa  108  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736057  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1215  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.18 
 
 
441 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.525269  normal  0.0570071 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2706  hypothetical protein  26.88 
 
 
625 aa  107  4e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0456  putative symporter YagG  25.17 
 
 
459 aa  107  4e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0319555 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1182  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  27.07 
 
 
441 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.020658  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3708  sugar:cation symporter family protein  22.65 
 
 
442 aa  106  8e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2697  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.45 
 
 
465 aa  103  5e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.296513 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4282  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  24.77 
 
 
444 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.368763  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1071  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  27.31 
 
 
445 aa  102  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4954  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  30.97 
 
 
463 aa  101  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0843133  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2191  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  27.91 
 
 
445 aa  101  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4396  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  24.55 
 
 
444 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0936  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  22.67 
 
 
478 aa  101  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2505  putative symporter YagG  23.26 
 
 
442 aa  100  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0163  Na+/galactoside symporter  24.4 
 
 
468 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4463  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  24.55 
 
 
444 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4311  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  24.55 
 
 
444 aa  101  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1395  hypothetical protein  28.97 
 
 
443 aa  100  5e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00525698 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0701  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  23.04 
 
 
478 aa  100  5e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.657348  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0170  Na+/galactoside symporter  24.4 
 
 
468 aa  100  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.671323  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0167  Na+/galactoside symporter  24.4 
 
 
468 aa  100  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.774115  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0162  Na+/galactoside symporter  24.4 
 
 
468 aa  100  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0162  Na+/galactoside symporter  24.16 
 
 
468 aa  100  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1146  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.04 
 
 
442 aa  100  8e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22670  Na+/melibiose symporter-like transporter  26.88 
 
 
453 aa  99.4  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1401  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.2 
 
 
444 aa  98.6  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.738999  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3350  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  23.26 
 
 
477 aa  98.6  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4394  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  24.32 
 
 
444 aa  98.6  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0181186  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4313  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  34.9 
 
 
497 aa  94.7  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0453293  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2284  putative cation symporter  22.29 
 
 
461 aa  95.1  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974122 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0272  major facilitator superfamily MFS_1  25.75 
 
 
474 aa  94.7  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1387  major facilitator superfamily transport protein  26.62 
 
 
468 aa  94.7  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0294045  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4108  putative transporter  21.73 
 
 
479 aa  93.6  8e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03437  putative permease  25.42 
 
 
466 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03388  hypothetical protein  25.42 
 
 
466 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4161  putative transporter  21.73 
 
 
479 aa  92  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3908  sugar glycoside-pentoside-hexuronide family protein  25.42 
 
 
466 aa  92.4  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.845629  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3868  putative transporter  21.73 
 
 
479 aa  92  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4076  putative transporter  21.88 
 
 
460 aa  91.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.591118  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3967  putative transporter  21.88 
 
 
460 aa  91.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.286007  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4030  putative transporter  21.88 
 
 
460 aa  91.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5030  putative transporter  22 
 
 
460 aa  91.3  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2069  major facilitator superfamily MFS_1  23.61 
 
 
432 aa  90.9  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350858  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3957  putative transporter  21.88 
 
 
460 aa  91.3  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0048  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  22 
 
 
460 aa  90.5  6e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0054  putative transporter  22 
 
 
460 aa  90.5  6e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.320086 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3697  sugar:cation symporter family protein  25.87 
 
 
467 aa  90.1  8e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.455392  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4000  putative transporter  22 
 
 
460 aa  90.1  8e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.947516  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4524  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  33.12 
 
 
465 aa  90.1  9e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5634  melibiose:sodium symporter  22.61 
 
 
481 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0907  Na+/melibiose symporter and related transporters-like  27.24 
 
 
538 aa  89.7  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000225717  decreased coverage  0.000000181101 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4951  sugar transporter, glycoside-pentoside-hexuronide family  25.08 
 
 
466 aa  89.7  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.841107 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3985  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  25.83 
 
 
476 aa  89.7  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.439786  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2992  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.36 
 
 
472 aa  89  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4586  melibiose:sodium symporter  22.39 
 
 
481 aa  87.4  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3907  melibiose:sodium symporter  22.52 
 
 
473 aa  87.8  4e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4674  melibiose:sodium symporter  22.52 
 
 
473 aa  87.8  4e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03868  transport protein  29.11 
 
 
514 aa  87.8  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4361  melibiose:sodium symporter  22.52 
 
 
473 aa  87.8  4e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03952  hypothetical protein  22.52 
 
 
469 aa  87.4  5e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03991  melibiose:sodium symporter  22.52 
 
 
469 aa  87.4  5e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0070  putative transporter  23.21 
 
 
464 aa  87.4  6e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.602143  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3872  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  22.52 
 
 
469 aa  87  7e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2719  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  23.59 
 
 
443 aa  86.7  9e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0761738  normal  0.0687051 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>