35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2680 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2680  major facilitator transporter  100 
 
 		 475 aa  959    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0685  Na+/melibiose symporter and related transporters-like  32.49 
 
 		 455 aa  280  3e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000328828 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2049  Na+/melibiose symporter and related transporters-like protein  32.39 
 
 		 469 aa  262  8e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal  0.648168 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1077  major facilitator transporter  36.18 
 
 		 429 aa  257  3e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00530736 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3332  major facilitator transporter  35.96 
 
 		 429 aa  254  3e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3738  hypothetical protein  24.32 
 
 		 467 aa  144  3e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00183877  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4367  major facilitator transporter  24.83 
 
 		 493 aa  143  6e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0248  major facilitator transporter  23.87 
 
 		 486 aa  120  7e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.135747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4221  major facilitator transporter  23.46 
 
 		 472 aa  111  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.218171  normal  0.657626 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2315  hypothetical protein  21.18 
 
 		 511 aa  99.4  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.276879  normal  0.0219591 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0571  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  21.79 
 
 		 457 aa  66.2  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.74034  normal  0.0218606 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3858  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  22.47 
 
 		 469 aa  65.9  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.784369  normal  0.0678057 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1406  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  22.41 
 
 		 471 aa  64.3  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.455319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3387  major facilitator superfamily MFS_1  22.22 
 
 		 475 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0724765 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2664  hypothetical protein  21.6 
 
 		 486 aa  60.5  0.00000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3190  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  21.14 
 
 		 460 aa  57.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.712372 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2906  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  20.9 
 
 		 460 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2853  sugar transporter  26.5 
 
 		 485 aa  52  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.563006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2993  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  22.38 
 
 		 475 aa  51.2  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.624539  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2816  major facilitator superfamily protein  21.59 
 
 		 459 aa  50.8  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4479  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  20.25 
 
 		 552 aa  50.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.176062 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0576  GPH family sugar transporter  23.26 
 
 		 455 aa  50.4  0.00007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0997  Na+/melibiose symporter and related transporters-like  20.68 
 
 		 475 aa  49.3  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.281913  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0200  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  23.27 
 
 		 544 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2335  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  21.28 
 
 		 476 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2069  major facilitator superfamily MFS_1  20.35 
 
 		 432 aa  48.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350858  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8054  Na+/melibiose symporter and related transporter- like protein  20.28 
 
 		 460 aa  48.5  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0444125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0388  major facilitator transporter  20.64 
 
 		 497 aa  46.6  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.991466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3075  Na+/melibiose symporter and related transporters-like protein  22.11 
 
 		 482 aa  46.6  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.818183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0353  major facilitator transporter  24.62 
 
 		 464 aa  45.8  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.939472  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1070  major facilitator transporter  29.52 
 
 		 471 aa  45.1  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3996  major facilitator transporter  19.91 
 
 		 443 aa  44.7  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.14105  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2719  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  21.16 
 
 		 443 aa  44.3  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0761738  normal  0.0687051 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06480  Na+/melibiose symporter-like transporter  21.15 
 
 		 460 aa  43.5  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.610657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4415  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  29.03 
 
 		 552 aa  43.5  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>