277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0575 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0575  major facilitator transporter  100 
 
 		 461 aa  918    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0269  major facilitator transporter  46.47 
 
 		 506 aa  397  1e-109  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1387  major facilitator superfamily transport protein  41.5 
 
 		 468 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0294045  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1070  major facilitator transporter  37.76 
 
 		 471 aa  272  7e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2105  sodium:galactoside symporter family protein  35.32 
 
 		 443 aa  250  4e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.366774  normal  0.477059 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3120  major facilitator transporter  34.08 
 
 		 472 aa  247  4e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.448872  normal  0.243798 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2611  major facilitator transporter  34.12 
 
 		 480 aa  230  5e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.803344  normal  0.0185611 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1702  Na+/melibiose symporter and related transporter protein  32.59 
 
 		 445 aa  217  4e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.574642  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2613  sodium:galactoside symporter family protein  35.33 
 
 		 453 aa  207  3e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.777957  normal  0.0752663 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1619  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  34.15 
 
 		 436 aa  204  3e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0726  major facilitator transporter  36.68 
 
 		 468 aa  201  3e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1919  major facilitator transporter  31.35 
 
 		 461 aa  192  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2614  major facilitator transporter  32.39 
 
 		 463 aa  174  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.106443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1893  major facilitator superfamily MFS_1  33.11 
 
 		 440 aa  169  7e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0353  major facilitator transporter  27.88 
 
 		 464 aa  157  3e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.939472  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1545  major facilitator transporter  29.64 
 
 		 457 aa  146  9e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0517  major facilitator transporter  28.26 
 
 		 471 aa  145  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1586  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  32.97 
 
 		 453 aa  146  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3697  sugar:cation symporter family protein  26.52 
 
 		 467 aa  119  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.455392  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3583  galactoside symporter  26.34 
 
 		 475 aa  119  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.012026 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1057  putative symporter protein  30.3 
 
 		 514 aa  119  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.872646  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2335  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  24.3 
 
 		 476 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1315  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  27.38 
 
 		 442 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0494  major facilitator transporter  31.01 
 
 		 407 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.520669 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3387  major facilitator superfamily MFS_1  26.04 
 
 		 475 aa  114  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0724765 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2966  major facilitator superfamily transporter  28.54 
 
 		 439 aa  114  5e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.274258 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3858  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.16 
 
 		 469 aa  113  9e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.784369  normal  0.0678057 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2393  major facilitator superfamily transporter  28.92 
 
 		 439 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1182  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  27.59 
 
 		 441 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.020658  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3175  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  27.87 
 
 		 442 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0664881  normal  0.904255 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3738  hypothetical protein  24.51 
 
 		 467 aa  111  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00183877  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1215  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.47 
 
 		 441 aa  111  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.525269  normal  0.0570071 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1130  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  27.87 
 
 		 441 aa  111  3e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0290  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.25 
 
 		 472 aa  109  8.000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000222424  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4367  major facilitator transporter  26.45 
 
 		 493 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0571  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.44 
 
 		 457 aa  109  9.000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.74034  normal  0.0218606 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2608  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.68 
 
 		 442 aa  108  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1395  hypothetical protein  27.23 
 
 		 443 aa  107  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00525698 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1406  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  24.77 
 
 		 471 aa  105  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.455319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4221  major facilitator transporter  25.4 
 
 		 472 aa  103  8e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.218171  normal  0.657626 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3732  sugar:cation symporter family protein  27.03 
 
 		 443 aa  102  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.170381  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1453  major facilitator superfamily transporter  30.37 
 
 		 452 aa  102  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.722152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1146  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.64 
 
 		 442 aa  102  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2284  putative cation symporter  25.11 
 
 		 461 aa  102  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974122 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6100  sodium:galactoside symporter family protein  26.61 
 
 		 431 aa  101  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0503744  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3708  sugar:cation symporter family protein  23.53 
 
 		 442 aa  100  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2993  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.14 
 
 		 475 aa  101  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.624539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0466  sodium:galactoside symporter family protein  29.86 
 
 		 428 aa  99  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1401  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.82 
 
 		 444 aa  97.8  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.738999  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5398  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  25.1 
 
 		 471 aa  97.1  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.243683  normal  0.179969 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3996  major facilitator transporter  26.59 
 
 		 443 aa  95.9  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.14105  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2315  hypothetical protein  24.14 
 
 		 511 aa  95.5  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.276879  normal  0.0219591 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0232  sodium:galactoside symporter family protein  29.47 
 
 		 435 aa  95.5  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.626751 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2906  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  23.1 
 
 		 460 aa  93.2  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0679  major facilitator transporter  25.25 
 
 		 439 aa  91.7  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000876885  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3190  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  22.86 
 
 		 460 aa  91.3  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.712372 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2049  Na+/melibiose symporter and related transporters-like protein  27.06 
 
 		 469 aa  90.1  7e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal  0.648168 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4954  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  21.95 
 
 		 463 aa  89.7  9e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0843133  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2992  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.45 
 
 		 472 aa  89.4  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1824  glucuronide transporter  25.28 
 
 		 457 aa  88.2  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3314  glucuronide transporter  24.62 
 
 		 457 aa  87.8  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2327  glucuronide transporter  25.62 
 
 		 457 aa  88.2  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1691  glucuronide transporter  25.62 
 
 		 457 aa  87.8  4e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3985  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  22.67 
 
 		 476 aa  87  6e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.439786  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3335  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  24.72 
 
 		 460 aa  86.7  8e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736057  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01585  glucuronide transporter  25.06 
 
 		 457 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01575  hypothetical protein  25.06 
 
 		 457 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.845658  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4014  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  27.15 
 
 		 466 aa  86.3  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.85917  normal  0.255078 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2816  major facilitator superfamily protein  26.02 
 
 		 459 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2026  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  25.45 
 
 		 457 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.232812  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0733  sodium:glactoside symporter family protein  22.47 
 
 		 465 aa  84  0.000000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.958172  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0456  putative symporter YagG  23.68 
 
 		 459 aa  84  0.000000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0319555 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0748  sodium:glactoside symporter family protein  23.68 
 
 		 454 aa  83.6  0.000000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.329176  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8054  Na+/melibiose symporter and related transporter- like protein  23.72 
 
 		 460 aa  82.4  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0444125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4524  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  27.04 
 
 		 465 aa  82.4  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0167  Na+/galactoside symporter  23.14 
 
 		 468 aa  82.8  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.774115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1583  glucuronide transporter  24.83 
 
 		 457 aa  83.2  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1647  major facilitator superfamily MFS_1  26.94 
 
 		 495 aa  82.8  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.187163  hitchhiker  0.001175 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0764  sugar glycoside-pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  23.43 
 
 		 454 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00819234  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0170  Na+/galactoside symporter  23.14 
 
 		 468 aa  82.4  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.671323  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2191  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  26.15 
 
 		 445 aa  82.8  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0162  Na+/galactoside symporter  22.93 
 
 		 468 aa  82  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0163  Na+/galactoside symporter  23.19 
 
 		 468 aa  82.4  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0248  major facilitator transporter  24.62 
 
 		 486 aa  82.4  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.135747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0162  Na+/galactoside symporter  23.19 
 
 		 468 aa  82.4  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0388  major facilitator transporter  24.15 
 
 		 497 aa  81.3  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.991466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0576  GPH family sugar transporter  25.63 
 
 		 455 aa  80.5  0.00000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1994  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  23.71 
 
 		 481 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00859833  hitchhiker  0.00113965 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0776  Zinc finger-domain-containing protein  24.49 
 
 		 447 aa  78.6  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0781581 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3372  major facilitator superfamily MFS_1  24.56 
 
 		 457 aa  78.6  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0546081  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1071  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  25.34 
 
 		 445 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2081  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.22 
 
 		 481 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0834729  hitchhiker  0.000000228967 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3149  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 460 aa  77  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1981  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  23.61 
 
 		 481 aa  77  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00156524  hitchhiker  0.000367008 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13771  GPH family sugar transporter  22.86 
 
 		 472 aa  76.6  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.66133  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0272  major facilitator superfamily MFS_1  27.38 
 
 		 474 aa  76.6  0.0000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0657  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  22.54 
 
 		 465 aa  76.3  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.242235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3350  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  22.17 
 
 		 477 aa  76.3  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002666  galactose permease  22.73 
 
 		 462 aa  74.7  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0459  major facilitator transporter  26.15 
 
 		 481 aa  74.7  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>