214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1647 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_1647  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
495 aa  964    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.187163  hitchhiker  0.001175 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3372  major facilitator superfamily MFS_1  43.94 
 
 
457 aa  309  1.0000000000000001e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0546081  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3996  major facilitator transporter  43.86 
 
 
443 aa  305  2.0000000000000002e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.14105  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0388  major facilitator transporter  42.42 
 
 
497 aa  249  1e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.991466  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0459  major facilitator transporter  42.58 
 
 
481 aa  233  7.000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8054  Na+/melibiose symporter and related transporter- like protein  35.92 
 
 
460 aa  226  7e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0444125  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22670  Na+/melibiose symporter-like transporter  39.12 
 
 
453 aa  225  1e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3962  major facilitator superfamily MFS_1  38.9 
 
 
455 aa  219  7.999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3770  major facilitator superfamily MFS_1  42.38 
 
 
420 aa  218  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00377745  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2816  major facilitator superfamily protein  35.73 
 
 
459 aa  209  8e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0272  major facilitator superfamily MFS_1  36.28 
 
 
474 aa  197  3e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3419  Na+/melibiose symporter and related transporter- like protein  47.9 
 
 
456 aa  124  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.860481 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3583  galactoside symporter  25.16 
 
 
475 aa  117  6.9999999999999995e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.012026 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1406  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  25.37 
 
 
471 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.455319  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2335  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  24.01 
 
 
476 aa  106  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0576  GPH family sugar transporter  28.09 
 
 
455 aa  105  2e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0571  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.12 
 
 
457 aa  104  3e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.74034  normal  0.0218606 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3858  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.14 
 
 
469 aa  105  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.784369  normal  0.0678057 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3190  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  25.46 
 
 
460 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.712372 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3387  major facilitator superfamily MFS_1  26.23 
 
 
475 aa  103  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0724765 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2906  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  25.46 
 
 
460 aa  103  8e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05681  GPH family sugar transporter  27.12 
 
 
480 aa  102  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0456  putative symporter YagG  25 
 
 
459 aa  98.2  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0319555 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4014  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.45 
 
 
466 aa  98.2  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.85917  normal  0.255078 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3335  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  24.73 
 
 
460 aa  97.4  6e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736057  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2095  GPH family sugar transporter  26.91 
 
 
442 aa  94.7  3e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2697  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  27.08 
 
 
465 aa  94.4  5e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.296513 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2719  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  27.93 
 
 
443 aa  94  5e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0761738  normal  0.0687051 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0657  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  23.66 
 
 
465 aa  92  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.242235  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03515  predicted transporter  22.25 
 
 
460 aa  91.7  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.371706  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03467  hypothetical protein  22.25 
 
 
460 aa  91.7  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.333065  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0748  sodium:glactoside symporter family protein  21.5 
 
 
454 aa  90.9  5e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.329176  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0290  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  20.68 
 
 
472 aa  90.5  6e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000222424  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3957  putative transporter  23.13 
 
 
460 aa  90.5  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0733  sodium:glactoside symporter family protein  23.58 
 
 
465 aa  90.5  7e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.958172  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3967  putative transporter  23.13 
 
 
460 aa  89.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.286007  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0764  sugar glycoside-pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  21.7 
 
 
454 aa  89.7  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00819234  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4076  putative transporter  23.13 
 
 
460 aa  89.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.591118  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4030  putative transporter  23.13 
 
 
460 aa  89.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4108  putative transporter  22.02 
 
 
479 aa  89.4  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1019  major facilitator transporter  26.88 
 
 
500 aa  89  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4000  putative transporter  22.02 
 
 
460 aa  88.2  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.947516  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0353  major facilitator transporter  25.46 
 
 
464 aa  88.2  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.939472  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0048  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  22.02 
 
 
460 aa  87.8  4e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0054  putative transporter  22.02 
 
 
460 aa  87.8  4e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.320086 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3868  putative transporter  22.02 
 
 
479 aa  87.8  4e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4161  putative transporter  22.02 
 
 
479 aa  87.8  4e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5030  putative transporter  22.02 
 
 
460 aa  87.4  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2498  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  25 
 
 
480 aa  87  7e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.358109  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02748  cation symporter  26.16 
 
 
462 aa  87  7e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0070  putative transporter  22.5 
 
 
464 aa  85.9  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.602143  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1215  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.52 
 
 
441 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.525269  normal  0.0570071 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5276  major facilitator transporter  35.89 
 
 
505 aa  85.1  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000299294 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0726  major facilitator transporter  28.31 
 
 
468 aa  84.3  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0162  Na+/galactoside symporter  26.32 
 
 
468 aa  83.6  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03437  putative permease  27.69 
 
 
466 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3908  sugar glycoside-pentoside-hexuronide family protein  27.69 
 
 
466 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.845629  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03388  hypothetical protein  27.69 
 
 
466 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4954  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  22.7 
 
 
463 aa  82.8  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0843133  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3708  sugar:cation symporter family protein  22.25 
 
 
442 aa  82.4  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1130  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.31 
 
 
441 aa  82  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0163  Na+/galactoside symporter  26.32 
 
 
468 aa  82  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0162  Na+/galactoside symporter  26.32 
 
 
468 aa  81.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3175  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  23.73 
 
 
442 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0664881  normal  0.904255 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0170  Na+/galactoside symporter  26.32 
 
 
468 aa  81.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.671323  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0167  Na+/galactoside symporter  26.32 
 
 
468 aa  81.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.774115  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1182  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  23.73 
 
 
441 aa  80.9  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.020658  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4951  sugar transporter, glycoside-pentoside-hexuronide family  27.38 
 
 
466 aa  80.5  0.00000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.841107 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2505  putative symporter YagG  22.29 
 
 
442 aa  80.1  0.00000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2602  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.48 
 
 
475 aa  78.6  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.178809  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1146  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  23.95 
 
 
442 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4415  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  21.36 
 
 
552 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4479  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  21.36 
 
 
552 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.176062 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1315  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  23.86 
 
 
442 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0701  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  23.91 
 
 
478 aa  76.6  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.657348  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3697  sugar:cation symporter family protein  24.18 
 
 
467 aa  75.9  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.455392  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0200  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  28.75 
 
 
544 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0575  major facilitator transporter  26.94 
 
 
461 aa  75.9  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0936  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  23.83 
 
 
478 aa  75.9  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1614  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.05 
 
 
448 aa  75.9  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0329184  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2284  putative cation symporter  25.76 
 
 
461 aa  74.7  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974122 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1619  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  28.33 
 
 
436 aa  75.1  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3350  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  25.17 
 
 
477 aa  74.3  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1702  Na+/melibiose symporter and related transporter protein  26.4 
 
 
445 aa  74.3  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.574642  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4524  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.41 
 
 
465 aa  74.3  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1401  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.24 
 
 
444 aa  74.3  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.738999  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3985  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  26.24 
 
 
476 aa  73.9  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.439786  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3275  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.31 
 
 
513 aa  72.8  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2049  Na+/melibiose symporter and related transporters-like protein  24.19 
 
 
469 aa  72.8  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal  0.648168 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2608  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  22.67 
 
 
442 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0269  major facilitator transporter  24.54 
 
 
506 aa  72.4  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41542  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1245  Na+/xyloside symporter related transporter  23.24 
 
 
467 aa  72  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2611  major facilitator transporter  24.16 
 
 
480 aa  72  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.803344  normal  0.0185611 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2992  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  22.52 
 
 
472 aa  71.6  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1193  Na+/xyloside symporter or related transporter  22.73 
 
 
437 aa  71.2  0.00000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.255847  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1269  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24 
 
 
465 aa  70.9  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.727469  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0907  Na+/melibiose symporter and related transporters-like  26.63 
 
 
538 aa  70.9  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000225717  decreased coverage  0.000000181101 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1070  major facilitator transporter  25.42 
 
 
471 aa  70.5  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3149  major facilitator superfamily MFS_1  26.91 
 
 
460 aa  70.1  0.00000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03762  predicted transporter  23.84 
 
 
468 aa  69.7  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>