181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3372 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3372  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 457 aa  871    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0546081  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1647  major facilitator superfamily MFS_1  43.94 
 
 		 495 aa  325  1e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.187163  hitchhiker  0.001175 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3996  major facilitator transporter  46.24 
 
 		 443 aa  324  2e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.14105  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22670  Na+/melibiose symporter-like transporter  46.15 
 
 		 453 aa  300  3e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0388  major facilitator transporter  43.72 
 
 		 497 aa  259  1e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.991466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3770  major facilitator superfamily MFS_1  47.82 
 
 		 420 aa  250  3e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00377745  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8054  Na+/melibiose symporter and related transporter- like protein  39.76 
 
 		 460 aa  248  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0444125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0459  major facilitator transporter  43.48 
 
 		 481 aa  237  3e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2816  major facilitator superfamily protein  39.27 
 
 		 459 aa  227  4e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3962  major facilitator superfamily MFS_1  39.53 
 
 		 455 aa  209  9e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3419  Na+/melibiose symporter and related transporter- like protein  38.93 
 
 		 456 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.860481 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0272  major facilitator superfamily MFS_1  34.83 
 
 		 474 aa  178  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0290  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.29 
 
 		 472 aa  111  3e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000222424  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0576  GPH family sugar transporter  27.17 
 
 		 455 aa  100  6e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2335  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  25.84 
 
 		 476 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3858  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25 
 
 		 469 aa  98.2  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.784369  normal  0.0678057 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3583  galactoside symporter  24.49 
 
 		 475 aa  97.1  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.012026 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3190  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  25.11 
 
 		 460 aa  96.7  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.712372 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2906  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  25.34 
 
 		 460 aa  96.3  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1406  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  27.13 
 
 		 471 aa  94.7  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.455319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2095  GPH family sugar transporter  26.48 
 
 		 442 aa  90.1  7e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1387  major facilitator superfamily transport protein  25.91 
 
 		 468 aa  88.6  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0294045  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3387  major facilitator superfamily MFS_1  24.71 
 
 		 475 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0724765 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0571  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.06 
 
 		 457 aa  87.8  4e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.74034  normal  0.0218606 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1019  major facilitator transporter  27.07 
 
 		 500 aa  84.7  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0353  major facilitator transporter  25.76 
 
 		 464 aa  85.1  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.939472  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0575  major facilitator transporter  25.23 
 
 		 461 aa  83.6  0.000000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05681  GPH family sugar transporter  26.45 
 
 		 480 aa  82  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0894  putative GPH family sugar transporter  23.93 
 
 		 451 aa  81.6  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.351001  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17501  GPH family sugar transporter  23.51 
 
 		 467 aa  81.3  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.276796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2602  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.69 
 
 		 475 aa  81.3  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.178809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0733  sodium:glactoside symporter family protein  21.56 
 
 		 465 aa  80.5  0.00000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.958172  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0269  major facilitator transporter  25.36 
 
 		 506 aa  76.6  0.0000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41542  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3738  hypothetical protein  23.49 
 
 		 467 aa  74.3  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00183877  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3149  major facilitator superfamily MFS_1  27.08 
 
 		 460 aa  73.9  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2706  hypothetical protein  24.37 
 
 		 625 aa  72.8  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0167  Na+/galactoside symporter  23.42 
 
 		 468 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.774115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0162  Na+/galactoside symporter  23.42 
 
 		 468 aa  72.4  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0163  Na+/galactoside symporter  23.42 
 
 		 468 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0170  Na+/galactoside symporter  23.42 
 
 		 468 aa  71.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.671323  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0162  Na+/galactoside symporter  23.42 
 
 		 468 aa  71.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4014  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  23.86 
 
 		 466 aa  71.6  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.85917  normal  0.255078 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0726  major facilitator transporter  27.94 
 
 		 468 aa  70.5  0.00000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0200  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  26.48 
 
 		 544 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1070  major facilitator transporter  24.13 
 
 		 471 aa  69.3  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3565  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.13 
 
 		 447 aa  68.9  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.117988  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3335  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  22.79 
 
 		 460 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736057  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5276  major facilitator transporter  28.46 
 
 		 505 aa  67.8  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000299294 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2049  Na+/melibiose symporter and related transporters-like protein  23.44 
 
 		 469 aa  67.4  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal  0.648168 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13771  GPH family sugar transporter  24.62 
 
 		 472 aa  67  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.66133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1619  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  28.5 
 
 		 436 aa  67  0.0000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0907  Na+/melibiose symporter and related transporters-like  23.35 
 
 		 538 aa  65.9  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000225717  decreased coverage  0.000000181101 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0456  putative symporter YagG  22.56 
 
 		 459 aa  65.9  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0319555 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2997  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  21.95 
 
 		 484 aa  65.1  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.738547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2697  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  23.49 
 
 		 465 aa  64.3  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.296513 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0248  major facilitator transporter  23.04 
 
 		 486 aa  63.9  0.000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.135747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02748  cation symporter  28.82 
 
 		 462 aa  63.9  0.000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4367  major facilitator transporter  30.14 
 
 		 493 aa  63.9  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2993  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  22.95 
 
 		 475 aa  62.4  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.624539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1144  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  21.95 
 
 		 468 aa  62.8  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0657  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  21.87 
 
 		 465 aa  63.2  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.242235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3350  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  21.84 
 
 		 477 aa  61.6  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2622  sugar transporter, glycoside-pentoside-hexuronide  24.36 
 
 		 479 aa  62  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.455215  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3075  Na+/melibiose symporter and related transporters-like protein  23.02 
 
 		 482 aa  61.6  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.818183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0748  sodium:glactoside symporter family protein  22.78 
 
 		 454 aa  61.6  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.329176  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15091  GPH family sugar transporter  22.61 
 
 		 448 aa  61.6  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2498  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  25 
 
 		 480 aa  61.2  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.358109  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0764  sugar glycoside-pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  22.01 
 
 		 454 aa  60.8  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00819234  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03437  putative permease  24.24 
 
 		 466 aa  60.5  0.00000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3120  major facilitator transporter  23.96 
 
 		 472 aa  60.5  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.448872  normal  0.243798 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03388  hypothetical protein  24.24 
 
 		 466 aa  60.5  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3908  sugar glycoside-pentoside-hexuronide family protein  24.24 
 
 		 466 aa  60.5  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.845629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1269  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  22.61 
 
 		 465 aa  60.5  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.727469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1527  Na+/xyloside symporter  24.72 
 
 		 444 aa  60.5  0.00000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2992  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.76 
 
 		 472 aa  60.1  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15231  GPH family sugar transporter  21.71 
 
 		 448 aa  60.1  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1071  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  23.66 
 
 		 445 aa  60.1  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4479  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  27.1 
 
 		 552 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.176062 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2719  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.87 
 
 		 443 aa  59.3  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0761738  normal  0.0687051 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4415  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  27.1 
 
 		 552 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3985  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  26.58 
 
 		 476 aa  59.3  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.439786  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01585  glucuronide transporter  23.49 
 
 		 457 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2105  sodium:galactoside symporter family protein  21.26 
 
 		 443 aa  58.9  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.366774  normal  0.477059 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01575  hypothetical protein  23.49 
 
 		 457 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.845658  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1583  glucuronide transporter  23.02 
 
 		 457 aa  58.5  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4261  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter family protein  22.65 
 
 		 467 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2069  major facilitator superfamily MFS_1  25.77 
 
 		 432 aa  57.4  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350858  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2613  sodium:galactoside symporter family protein  22.15 
 
 		 453 aa  57.4  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.777957  normal  0.0752663 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2191  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  22.41 
 
 		 445 aa  57.4  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1691  glucuronide transporter  23.49 
 
 		 457 aa  57.4  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1824  glucuronide transporter  23.49 
 
 		 457 aa  57.4  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06480  Na+/melibiose symporter-like transporter  25.61 
 
 		 460 aa  57.4  0.0000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.610657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4248  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  22.82 
 
 		 472 aa  57  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2614  major facilitator transporter  25.36 
 
 		 463 aa  57  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.106443  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4110  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  22.6 
 
 		 467 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1421  GPH family sugar transporter  22.38 
 
 		 448 aa  55.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2327  glucuronide transporter  23.26 
 
 		 457 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2611  major facilitator transporter  23.39 
 
 		 480 aa  55.8  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.803344  normal  0.0185611 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4339  putative permease  23.02 
 
 		 474 aa  56.6  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1935  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  19.15 
 
 		 461 aa  56.6  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>