206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3770 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3770  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 420 aa  776    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00377745  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3996  major facilitator transporter  56.9 
 
 		 443 aa  402  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.14105  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22670  Na+/melibiose symporter-like transporter  58.41 
 
 		 453 aa  389  1e-107  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0388  major facilitator transporter  58.84 
 
 		 497 aa  359  5e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.991466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0459  major facilitator transporter  57.74 
 
 		 481 aa  343  4e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8054  Na+/melibiose symporter and related transporter- like protein  47.69 
 
 		 460 aa  293  3e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0444125  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2816  major facilitator superfamily protein  45.93 
 
 		 459 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3372  major facilitator superfamily MFS_1  47.89 
 
 		 457 aa  281  1e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0546081  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1647  major facilitator superfamily MFS_1  42.72 
 
 		 495 aa  251  1e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.187163  hitchhiker  0.001175 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0272  major facilitator superfamily MFS_1  42.66 
 
 		 474 aa  223  4.9999999999999996e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3962  major facilitator superfamily MFS_1  42.04 
 
 		 455 aa  195  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3419  Na+/melibiose symporter and related transporter- like protein  43.47 
 
 		 456 aa  187  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.860481 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2335  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  25.54 
 
 		 476 aa  119  9e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3190  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  26.59 
 
 		 460 aa  117  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.712372 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0576  GPH family sugar transporter  28.28 
 
 		 455 aa  116  7.999999999999999e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2906  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  26.34 
 
 		 460 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3583  galactoside symporter  24.55 
 
 		 475 aa  114  5e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.012026 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2095  GPH family sugar transporter  28.98 
 
 		 442 aa  108  2e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0353  major facilitator transporter  29.46 
 
 		 464 aa  108  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.939472  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1406  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  28.3 
 
 		 471 aa  105  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.455319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17501  GPH family sugar transporter  24.55 
 
 		 467 aa  102  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.276796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3858  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  23.89 
 
 		 469 aa  99.8  9e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.784369  normal  0.0678057 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0894  putative GPH family sugar transporter  24.37 
 
 		 451 aa  98.6  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.351001  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05681  GPH family sugar transporter  28.15 
 
 		 480 aa  98.2  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3387  major facilitator superfamily MFS_1  24.94 
 
 		 475 aa  98.2  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0724765 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0290  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  22.45 
 
 		 472 aa  96.7  7e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000222424  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13771  GPH family sugar transporter  25.46 
 
 		 472 aa  94.4  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.66133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0571  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.34 
 
 		 457 aa  90.9  4e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.74034  normal  0.0218606 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2697  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  30.33 
 
 		 465 aa  90.1  6e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.296513 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2719  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  27.38 
 
 		 443 aa  85.1  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0761738  normal  0.0687051 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2191  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  24.71 
 
 		 445 aa  82.8  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5398  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  24.4 
 
 		 471 aa  82.4  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.243683  normal  0.179969 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1144  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.65 
 
 		 468 aa  80.9  0.00000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0726  major facilitator transporter  29.22 
 
 		 468 aa  80.5  0.00000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0269  major facilitator transporter  25.89 
 
 		 506 aa  78.6  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41542  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2706  hypothetical protein  24.34 
 
 		 625 aa  77.8  0.0000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2664  hypothetical protein  27.25 
 
 		 486 aa  77.4  0.0000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15091  GPH family sugar transporter  21.53 
 
 		 448 aa  77.4  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0575  major facilitator transporter  26.4 
 
 		 461 aa  77  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5030  putative transporter  24.64 
 
 		 460 aa  77  0.0000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2315  hypothetical protein  25.79 
 
 		 511 aa  76.3  0.0000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.276879  normal  0.0219591 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1421  GPH family sugar transporter  21.6 
 
 		 448 aa  75.9  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4000  putative transporter  24.64 
 
 		 460 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.947516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15231  GPH family sugar transporter  21.91 
 
 		 448 aa  75.1  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14841  GPH family sugar transporter  23.28 
 
 		 449 aa  75.5  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0070  putative transporter  24.65 
 
 		 464 aa  75.1  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.602143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1019  major facilitator transporter  27.45 
 
 		 500 aa  75.5  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4014  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  23.46 
 
 		 466 aa  75.1  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.85917  normal  0.255078 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03515  predicted transporter  24.64 
 
 		 460 aa  74.7  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.371706  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0048  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  24.64 
 
 		 460 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0054  putative transporter  24.64 
 
 		 460 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.320086 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03467  hypothetical protein  24.64 
 
 		 460 aa  74.7  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.333065  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3708  sugar:cation symporter family protein  26.25 
 
 		 442 aa  74.3  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3868  putative transporter  24.64 
 
 		 479 aa  74.3  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4161  putative transporter  24.64 
 
 		 479 aa  74.3  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4108  putative transporter  24.64 
 
 		 479 aa  73.9  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1453  major facilitator superfamily transporter  31.27 
 
 		 452 aa  73.9  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.722152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2966  major facilitator superfamily transporter  30.57 
 
 		 439 aa  73.2  0.000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.274258 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1071  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  24.37 
 
 		 445 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2505  putative symporter YagG  23.49 
 
 		 442 aa  72  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1614  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  23.99 
 
 		 448 aa  72  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0329184  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3335  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  25.31 
 
 		 460 aa  70.5  0.00000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736057  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5634  melibiose:sodium symporter  23.25 
 
 		 481 aa  69.7  0.00000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6100  sodium:galactoside symporter family protein  28.41 
 
 		 431 aa  69.7  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0503744  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4221  major facilitator transporter  28.66 
 
 		 472 aa  69.7  0.00000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.218171  normal  0.657626 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2622  sugar transporter, glycoside-pentoside-hexuronide  26.39 
 
 		 479 aa  69.7  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.455215  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3872  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  23.02 
 
 		 469 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2498  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  25.11 
 
 		 480 aa  68.2  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.358109  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4586  melibiose:sodium symporter  23.02 
 
 		 481 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03991  melibiose:sodium symporter  23.02 
 
 		 469 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2372  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  26.2 
 
 		 457 aa  68.2  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.100315  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03952  hypothetical protein  23.02 
 
 		 469 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2049  Na+/melibiose symporter and related transporters-like protein  26.62 
 
 		 469 aa  67.8  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal  0.648168 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3907  melibiose:sodium symporter  23.02 
 
 		 473 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3957  putative transporter  24.2 
 
 		 460 aa  67.8  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4361  melibiose:sodium symporter  23.02 
 
 		 473 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4674  melibiose:sodium symporter  23.02 
 
 		 473 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2393  major facilitator superfamily transporter  28.41 
 
 		 439 aa  67.4  0.0000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1619  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  26.91 
 
 		 436 aa  67.4  0.0000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0456  putative symporter YagG  25.06 
 
 		 459 aa  67  0.0000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0319555 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4076  putative transporter  24.2 
 
 		 460 aa  67  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.591118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4030  putative transporter  24.2 
 
 		 460 aa  67  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3967  putative transporter  24.2 
 
 		 460 aa  67  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.286007  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3985  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  21.78 
 
 		 476 aa  65.1  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.439786  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03437  putative permease  25.83 
 
 		 466 aa  64.3  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1387  major facilitator superfamily transport protein  25.25 
 
 		 468 aa  64.3  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0294045  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3314  glucuronide transporter  28.53 
 
 		 457 aa  64.3  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3908  sugar glycoside-pentoside-hexuronide family protein  25.83 
 
 		 466 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.845629  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03388  hypothetical protein  25.83 
 
 		 466 aa  64.3  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4954  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.39 
 
 		 463 aa  63.9  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0843133  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4367  major facilitator transporter  35.25 
 
 		 493 aa  63.9  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0200  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  27.46 
 
 		 544 aa  63.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4645  melibiose:sodium symporter  22.62 
 
 		 476 aa  63.2  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.752392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4694  melibiose:sodium symporter  25 
 
 		 476 aa  62.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.772252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4563  melibiose:sodium symporter  25 
 
 		 476 aa  62.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2602  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.03 
 
 		 475 aa  62.8  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.178809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4554  melibiose:sodium symporter  25 
 
 		 476 aa  62.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02748  cation symporter  30.41 
 
 		 462 aa  62.4  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0701  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  25.77 
 
 		 478 aa  62.4  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.657348  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4645  melibiose:sodium symporter  25 
 
 		 476 aa  62.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>