243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5276 on replicon NC_010335
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010335  Caul_5276  major facilitator transporter  100 
 
 		 505 aa  973    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000299294 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1019  major facilitator transporter  45.67 
 
 		 500 aa  411  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2664  hypothetical protein  31.35 
 
 		 486 aa  189  9e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0430  major facilitator transporter  30.49 
 
 		 503 aa  174  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2853  sugar transporter  30.67 
 
 		 485 aa  160  4e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.563006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3075  Na+/melibiose symporter and related transporters-like protein  31.12 
 
 		 482 aa  159  2e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.818183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2335  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  28.48 
 
 		 476 aa  136  8e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3387  major facilitator superfamily MFS_1  28.48 
 
 		 475 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0724765 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3583  galactoside symporter  26.9 
 
 		 475 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.012026 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2906  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  25.52 
 
 		 460 aa  128  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0997  Na+/melibiose symporter and related transporters-like  28.18 
 
 		 475 aa  128  3e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.281913  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1146  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  27.03 
 
 		 442 aa  125  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3190  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  25.37 
 
 		 460 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.712372 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3858  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.94 
 
 		 469 aa  119  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.784369  normal  0.0678057 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1315  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.61 
 
 		 442 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2608  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.72 
 
 		 442 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1406  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  25.87 
 
 		 471 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.455319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0571  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  27.39 
 
 		 457 aa  113  9e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.74034  normal  0.0218606 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3697  sugar:cation symporter family protein  24.46 
 
 		 467 aa  112  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.455392  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3175  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  25.72 
 
 		 442 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0664881  normal  0.904255 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1215  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.98 
 
 		 441 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.525269  normal  0.0570071 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3350  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  25.8 
 
 		 477 aa  111  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1130  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.46 
 
 		 441 aa  111  3e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1182  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.65 
 
 		 441 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.020658  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1269  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.74 
 
 		 465 aa  109  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.727469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0290  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.49 
 
 		 472 aa  108  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000222424  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1395  hypothetical protein  24.79 
 
 		 443 aa  108  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00525698 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1401  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  27.39 
 
 		 444 aa  105  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.738999  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0701  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  26.36 
 
 		 478 aa  105  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.657348  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0936  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  26.01 
 
 		 478 aa  105  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8054  Na+/melibiose symporter and related transporter- like protein  27.54 
 
 		 460 aa  105  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0444125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02748  cation symporter  25.72 
 
 		 462 aa  104  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3708  sugar:cation symporter family protein  24.21 
 
 		 442 aa  104  4e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2992  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.28 
 
 		 472 aa  103  8e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0200  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  27.88 
 
 		 544 aa  103  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0353  major facilitator transporter  25.83 
 
 		 464 aa  103  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.939472  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2993  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.56 
 
 		 475 aa  103  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.624539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1614  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.79 
 
 		 448 aa  101  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0329184  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3732  sugar:cation symporter family protein  23.76 
 
 		 443 aa  101  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.170381  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4221  major facilitator transporter  26.51 
 
 		 472 aa  101  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.218171  normal  0.657626 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4000  putative transporter  25.42 
 
 		 460 aa  97.1  6e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.947516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4161  putative transporter  25.42 
 
 		 479 aa  97.1  7e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1647  major facilitator superfamily MFS_1  31.11 
 
 		 495 aa  97.1  7e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.187163  hitchhiker  0.001175 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3868  putative transporter  25.42 
 
 		 479 aa  97.1  7e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0048  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  25.42 
 
 		 460 aa  96.7  8e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4108  putative transporter  25.42 
 
 		 479 aa  96.7  8e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4415  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  33.75 
 
 		 552 aa  96.7  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4524  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.11 
 
 		 465 aa  96.7  8e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0054  putative transporter  25.42 
 
 		 460 aa  96.7  8e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.320086 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4479  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  33.75 
 
 		 552 aa  96.7  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.176062 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1702  Na+/melibiose symporter and related transporter protein  31.03 
 
 		 445 aa  96.3  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.574642  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3985  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  23.35 
 
 		 476 aa  95.5  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.439786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1619  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  31.34 
 
 		 436 aa  95.5  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03515  predicted transporter  25.42 
 
 		 460 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.371706  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03467  hypothetical protein  25.42 
 
 		 460 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.333065  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1144  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  23.68 
 
 		 468 aa  94.4  5e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5030  putative transporter  25.42 
 
 		 460 aa  93.6  8e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2284  putative cation symporter  25.17 
 
 		 461 aa  92.8  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974122 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5398  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  27.1 
 
 		 471 aa  92.4  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.243683  normal  0.179969 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2611  major facilitator transporter  27.16 
 
 		 480 aa  92  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.803344  normal  0.0185611 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4014  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.19 
 
 		 466 aa  91.3  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.85917  normal  0.255078 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3565  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  28.29 
 
 		 447 aa  91.3  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.117988  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0657  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.9 
 
 		 465 aa  90.9  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.242235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3957  putative transporter  25.79 
 
 		 460 aa  90.1  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0070  putative transporter  26.14 
 
 		 464 aa  90.1  9e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.602143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1387  major facilitator superfamily transport protein  28.99 
 
 		 468 aa  89  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0294045  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1527  Na+/xyloside symporter  27.45 
 
 		 444 aa  88.6  3e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4030  putative transporter  25.89 
 
 		 460 aa  88.2  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2816  major facilitator superfamily protein  28.02 
 
 		 459 aa  88.2  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4076  putative transporter  25.89 
 
 		 460 aa  88.2  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.591118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3967  putative transporter  25.89 
 
 		 460 aa  88.2  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.286007  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0162  Na+/galactoside symporter  23.17 
 
 		 468 aa  86.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2613  sodium:galactoside symporter family protein  26.48 
 
 		 453 aa  86.3  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.777957  normal  0.0752663 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0170  Na+/galactoside symporter  23.22 
 
 		 468 aa  85.1  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.671323  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0456  putative symporter YagG  23.44 
 
 		 459 aa  85.1  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0319555 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0167  Na+/galactoside symporter  23.22 
 
 		 468 aa  84.7  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.774115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17501  GPH family sugar transporter  28.12 
 
 		 467 aa  84.3  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.276796  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3335  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  23.91 
 
 		 460 aa  84  0.000000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736057  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0162  Na+/galactoside symporter  23.01 
 
 		 468 aa  83.6  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0163  Na+/galactoside symporter  23.01 
 
 		 468 aa  83.6  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0894  putative GPH family sugar transporter  27.89 
 
 		 451 aa  83.2  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.351001  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2095  GPH family sugar transporter  27.12 
 
 		 442 aa  82.4  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2049  Na+/melibiose symporter and related transporters-like protein  26.85 
 
 		 469 aa  81.3  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal  0.648168 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3962  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 455 aa  81.3  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4954  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  21.38 
 
 		 463 aa  79.3  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0843133  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1070  major facilitator transporter  28.03 
 
 		 471 aa  79.3  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5634  melibiose:sodium symporter  22.45 
 
 		 481 aa  80.1  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4554  melibiose:sodium symporter  24.65 
 
 		 476 aa  79  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4563  melibiose:sodium symporter  24.65 
 
 		 476 aa  79  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4645  melibiose:sodium symporter  24.65 
 
 		 476 aa  79  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06480  Na+/melibiose symporter-like transporter  25.27 
 
 		 460 aa  79  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.610657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4694  melibiose:sodium symporter  24.65 
 
 		 476 aa  79  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.772252  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03991  melibiose:sodium symporter  22.54 
 
 		 469 aa  78.2  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4586  melibiose:sodium symporter  22.22 
 
 		 481 aa  78.6  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4361  melibiose:sodium symporter  22.22 
 
 		 473 aa  78.6  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03952  hypothetical protein  22.54 
 
 		 469 aa  78.2  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3907  melibiose:sodium symporter  22.22 
 
 		 473 aa  78.6  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4645  melibiose:sodium symporter  24.65 
 
 		 476 aa  78.6  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.752392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4674  melibiose:sodium symporter  22.22 
 
 		 473 aa  78.6  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3872  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  22.54 
 
 		 469 aa  77.8  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>