170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_06480 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_06480  Na+/melibiose symporter-like transporter  100 
 
 		 460 aa  930    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.610657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1527  Na+/xyloside symporter  55.08 
 
 		 444 aa  484  1e-135  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1344  major facilitator transporter  38.98 
 
 		 454 aa  299  8e-80  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0679  major facilitator transporter  28.22 
 
 		 439 aa  156  6e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000876885  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3190  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  24.64 
 
 		 460 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.712372 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2906  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  24.64 
 
 		 460 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3583  galactoside symporter  23.85 
 
 		 475 aa  100  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.012026 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1383  major facilitator superfamily MFS_1  23.17 
 
 		 439 aa  100  5e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2711  major facilitator superfamily MFS_1  24.74 
 
 		 442 aa  97.1  7e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.309074  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3387  major facilitator superfamily MFS_1  25.65 
 
 		 475 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0724765 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2335  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  22.44 
 
 		 476 aa  90.9  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4221  major facilitator transporter  26.4 
 
 		 472 aa  90.5  6e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.218171  normal  0.657626 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0571  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  23.88 
 
 		 457 aa  88.6  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.74034  normal  0.0218606 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3858  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.52 
 
 		 469 aa  85.9  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.784369  normal  0.0678057 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1702  Na+/melibiose symporter and related transporter protein  26.14 
 
 		 445 aa  83.2  0.000000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.574642  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1406  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  24.79 
 
 		 471 aa  82  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.455319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0430  major facilitator transporter  24.23 
 
 		 503 aa  79.3  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0353  major facilitator transporter  27.32 
 
 		 464 aa  77  0.0000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.939472  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1619  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  26.25 
 
 		 436 aa  76.3  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2049  Na+/melibiose symporter and related transporters-like protein  24.79 
 
 		 469 aa  74.7  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal  0.648168 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1586  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  26.49 
 
 		 453 aa  73.9  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2611  major facilitator transporter  21.3 
 
 		 480 aa  73.6  0.000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.803344  normal  0.0185611 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2664  hypothetical protein  26.61 
 
 		 486 aa  73.6  0.000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2315  hypothetical protein  24.63 
 
 		 511 aa  73.2  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.276879  normal  0.0219591 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1019  major facilitator transporter  24.1 
 
 		 500 aa  72.8  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5276  major facilitator transporter  23.98 
 
 		 505 aa  70.9  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000299294 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2105  sodium:galactoside symporter family protein  23.91 
 
 		 443 aa  70.5  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.366774  normal  0.477059 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8054  Na+/melibiose symporter and related transporter- like protein  23.56 
 
 		 460 aa  69.7  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0444125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3996  major facilitator transporter  25.4 
 
 		 443 aa  68.9  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.14105  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2853  sugar transporter  26.57 
 
 		 485 aa  67.8  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.563006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1919  major facilitator transporter  24.73 
 
 		 461 aa  67.8  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2372  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  24.93 
 
 		 457 aa  67  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.100315  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2613  sodium:galactoside symporter family protein  24.04 
 
 		 453 aa  67  0.0000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.777957  normal  0.0752663 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3697  sugar:cation symporter family protein  23.98 
 
 		 467 aa  66.2  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.455392  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2069  major facilitator superfamily MFS_1  26.25 
 
 		 432 aa  65.1  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350858  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2052  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.1 
 
 		 471 aa  64.7  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3075  Na+/melibiose symporter and related transporters-like protein  24.38 
 
 		 482 aa  64.3  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.818183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2081  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.51 
 
 		 481 aa  63.9  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0834729  hitchhiker  0.000000228967 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1395  hypothetical protein  22.54 
 
 		 443 aa  63.9  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00525698 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2095  GPH family sugar transporter  26.98 
 
 		 442 aa  63.5  0.000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1981  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.51 
 
 		 481 aa  63.5  0.000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00156524  hitchhiker  0.000367008 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1245  Na+/xyloside symporter related transporter  21.29 
 
 		 467 aa  63.5  0.000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1831  major facilitator transporter  22.07 
 
 		 430 aa  63.2  0.000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.612991  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0200  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  29.15 
 
 		 544 aa  63.2  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1994  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.1 
 
 		 481 aa  62.8  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00859833  hitchhiker  0.00113965 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14841  GPH family sugar transporter  26.47 
 
 		 449 aa  63.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3738  hypothetical protein  24.14 
 
 		 467 aa  62.4  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00183877  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2697  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.41 
 
 		 465 aa  62  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.296513 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15091  GPH family sugar transporter  26.05 
 
 		 448 aa  62.4  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2191  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  21.21 
 
 		 445 aa  62  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15231  GPH family sugar transporter  26.14 
 
 		 448 aa  61.6  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3149  major facilitator superfamily MFS_1  24.04 
 
 		 460 aa  61.2  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2155  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  23.08 
 
 		 471 aa  60.8  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00011339  normal  0.022313 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0894  putative GPH family sugar transporter  26.27 
 
 		 451 aa  60.5  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.351001  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1421  GPH family sugar transporter  26.05 
 
 		 448 aa  60.5  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0726  major facilitator transporter  26.13 
 
 		 468 aa  60.1  0.00000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0269  major facilitator transporter  22.69 
 
 		 506 aa  60.1  0.00000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41542  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01585  glucuronide transporter  21.18 
 
 		 457 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17501  GPH family sugar transporter  26.27 
 
 		 467 aa  59.3  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.276796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1691  glucuronide transporter  21.18 
 
 		 457 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1824  glucuronide transporter  21.18 
 
 		 457 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01575  hypothetical protein  21.18 
 
 		 457 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.845658  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1583  glucuronide transporter  21.18 
 
 		 457 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2327  glucuronide transporter  21.18 
 
 		 457 aa  59.3  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3120  major facilitator transporter  21.25 
 
 		 472 aa  58.9  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.448872  normal  0.243798 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2706  hypothetical protein  22.55 
 
 		 625 aa  58.5  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05681  GPH family sugar transporter  22.22 
 
 		 480 aa  58.2  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1071  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  20.45 
 
 		 445 aa  57.8  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1315  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  21.74 
 
 		 442 aa  57  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4415  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  33.03 
 
 		 552 aa  57  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4479  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  33.03 
 
 		 552 aa  57  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.176062 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1146  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  22.44 
 
 		 442 aa  56.6  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0272  major facilitator superfamily MFS_1  22.05 
 
 		 474 aa  56.6  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2992  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  23.63 
 
 		 472 aa  55.8  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1070  major facilitator transporter  24.63 
 
 		 471 aa  56.2  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2816  major facilitator superfamily protein  22.12 
 
 		 459 aa  56.2  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4367  major facilitator transporter  23.5 
 
 		 493 aa  55.5  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0618  sugar efflux transporter  25.74 
 
 		 392 aa  55.5  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.145544 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1592  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  21.51 
 
 		 464 aa  55.8  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00442608  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3962  major facilitator superfamily MFS_1  22.08 
 
 		 455 aa  55.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2026  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  20.88 
 
 		 457 aa  55.1  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.232812  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1454  sugar transporter  23.09 
 
 		 454 aa  54.3  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3565  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  23.46 
 
 		 447 aa  54.3  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.117988  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1401  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  23.35 
 
 		 444 aa  54.3  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.738999  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2885  major facilitator transporter  23.73 
 
 		 432 aa  53.9  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00035649  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4524  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  22.53 
 
 		 465 aa  53.5  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3732  sugar:cation symporter family protein  22.99 
 
 		 443 aa  53.5  0.000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.170381  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0764  sugar glycoside-pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  21.12 
 
 		 454 aa  52.8  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00819234  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0748  sodium:glactoside symporter family protein  20.79 
 
 		 454 aa  53.1  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.329176  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0248  major facilitator transporter  35.29 
 
 		 486 aa  52.8  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.135747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0789  glucuronide transporter  24.86 
 
 		 469 aa  52.8  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0576  GPH family sugar transporter  21.53 
 
 		 455 aa  52.4  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5398  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  20.79 
 
 		 471 aa  52  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.243683  normal  0.179969 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1647  major facilitator superfamily MFS_1  23.94 
 
 		 495 aa  51.2  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.187163  hitchhiker  0.001175 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1614  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  23.05 
 
 		 448 aa  50.8  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0329184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0494  major facilitator transporter  24.21 
 
 		 407 aa  50.8  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.520669 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0070  putative transporter  23.03 
 
 		 464 aa  50.8  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.602143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2608  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  20.88 
 
 		 442 aa  50.4  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1130  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  22.35 
 
 		 441 aa  50.4  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4108  putative transporter  22.95 
 
 		 479 aa  50.4  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>