271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2622 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2622  sugar transporter, glycoside-pentoside-hexuronide  100 
 
 
479 aa  947    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.455215  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2719  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  37.41 
 
 
443 aa  223  6e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0761738  normal  0.0687051 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2697  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  32.73 
 
 
465 aa  209  9e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.296513 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1614  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  29.54 
 
 
448 aa  207  3e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0329184  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3697  sugar:cation symporter family protein  30.38 
 
 
467 aa  201  1.9999999999999998e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.455392  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4954  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.11 
 
 
463 aa  185  1.0000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0843133  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0733  sodium:glactoside symporter family protein  28.7 
 
 
465 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.958172  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02748  cation symporter  30.97 
 
 
462 aa  184  4.0000000000000006e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2992  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  28.54 
 
 
472 aa  184  5.0000000000000004e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2284  putative cation symporter  29.31 
 
 
461 aa  181  2.9999999999999997e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974122 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5398  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  27.04 
 
 
471 aa  180  4.999999999999999e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.243683  normal  0.179969 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2993  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  29.62 
 
 
475 aa  179  7e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.624539  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3175  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  31.8 
 
 
442 aa  179  8e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0664881  normal  0.904255 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1315  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  30.22 
 
 
442 aa  178  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1130  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  31.58 
 
 
441 aa  178  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1182  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  31.8 
 
 
441 aa  178  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.020658  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1215  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  31.58 
 
 
441 aa  176  7e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.525269  normal  0.0570071 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2608  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  30.73 
 
 
442 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3985  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  26.4 
 
 
476 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.439786  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1401  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  29.74 
 
 
444 aa  171  2e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.738999  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4645  melibiose:sodium symporter  27.77 
 
 
476 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.752392  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4554  melibiose:sodium symporter  27.77 
 
 
476 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4563  melibiose:sodium symporter  27.77 
 
 
476 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4694  melibiose:sodium symporter  27.77 
 
 
476 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.772252  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4645  melibiose:sodium symporter  27.77 
 
 
476 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3708  sugar:cation symporter family protein  29.02 
 
 
442 aa  167  5e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1395  hypothetical protein  29.63 
 
 
443 aa  165  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00525698 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3335  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  26.86 
 
 
460 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736057  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1269  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  30.73 
 
 
465 aa  164  4.0000000000000004e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.727469  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3732  sugar:cation symporter family protein  28.82 
 
 
443 aa  163  6e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.170381  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3583  galactoside symporter  29.42 
 
 
475 aa  163  6e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.012026 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0701  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  27.46 
 
 
478 aa  163  7e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.657348  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4586  melibiose:sodium symporter  27.46 
 
 
481 aa  163  8.000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3907  melibiose:sodium symporter  27.46 
 
 
473 aa  162  9e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4361  melibiose:sodium symporter  27.46 
 
 
473 aa  162  9e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4674  melibiose:sodium symporter  27.46 
 
 
473 aa  162  9e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03991  melibiose:sodium symporter  27.37 
 
 
469 aa  161  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03952  hypothetical protein  27.37 
 
 
469 aa  161  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3350  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  27.93 
 
 
477 aa  162  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0456  putative symporter YagG  26.8 
 
 
459 aa  162  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0319555 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4524  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  28.9 
 
 
465 aa  161  3e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5634  melibiose:sodium symporter  27.25 
 
 
481 aa  161  3e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2372  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  27.91 
 
 
457 aa  160  4e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.100315  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3872  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  27.16 
 
 
469 aa  159  8e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01585  glucuronide transporter  27.65 
 
 
457 aa  159  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2327  glucuronide transporter  27.37 
 
 
457 aa  159  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1144  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  27.78 
 
 
468 aa  159  1e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01575  hypothetical protein  27.65 
 
 
457 aa  159  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.845658  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1824  glucuronide transporter  27.43 
 
 
457 aa  159  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2155  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  27.12 
 
 
471 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00011339  normal  0.022313 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4396  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  28.48 
 
 
444 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3314  glucuronide transporter  27.96 
 
 
457 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1691  glucuronide transporter  27.37 
 
 
457 aa  157  3e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4311  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  27.65 
 
 
444 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4394  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  27.78 
 
 
444 aa  157  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0181186  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1146  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  29.69 
 
 
442 aa  157  4e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4463  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  27.43 
 
 
444 aa  156  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4282  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  28.04 
 
 
444 aa  156  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.368763  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2081  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.98 
 
 
481 aa  155  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0834729  hitchhiker  0.000000228967 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2026  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  27.21 
 
 
457 aa  155  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.232812  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0936  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  26.84 
 
 
478 aa  155  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1994  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  27 
 
 
481 aa  154  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00859833  hitchhiker  0.00113965 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1981  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  27.51 
 
 
481 aa  155  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00156524  hitchhiker  0.000367008 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2052  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.2 
 
 
471 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0907  Na+/melibiose symporter and related transporters-like  33.77 
 
 
538 aa  153  5.9999999999999996e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000225717  decreased coverage  0.000000181101 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0764  sugar glycoside-pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  27.6 
 
 
454 aa  153  7e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00819234  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1583  glucuronide transporter  27 
 
 
457 aa  153  7e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0657  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  27.2 
 
 
465 aa  153  8e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.242235  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0748  sodium:glactoside symporter family protein  27.05 
 
 
454 aa  152  1e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.329176  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0776  Zinc finger-domain-containing protein  27.65 
 
 
447 aa  151  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0781581 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3858  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  27.8 
 
 
469 aa  152  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.784369  normal  0.0678057 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002666  galactose permease  29.06 
 
 
462 aa  148  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1406  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  28.69 
 
 
471 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.455319  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4227  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  26.9 
 
 
473 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4405  glucuronide carrier protein  26.68 
 
 
473 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.196167  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4261  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter family protein  26.36 
 
 
467 aa  145  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2505  putative symporter YagG  25.81 
 
 
442 aa  145  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2335  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  26.91 
 
 
476 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03761  predicted transporter  25.93 
 
 
467 aa  143  7e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_012892  B21_03710  hypothetical protein  25.93 
 
 
467 aa  143  7e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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CP001637  EcDH1_4110  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  25.83 
 
 
467 aa  143  8e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011353  ECH74115_5322  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter family protein  25.77 
 
 
467 aa  143  9e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.357419 
 
 
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NC_010003  Pmob_0290  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.43 
 
 
472 aa  142  9e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000222424  n/a   
 
 
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NC_009832  Spro_4014  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  27.29 
 
 
466 aa  142  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.85917  normal  0.255078 
 
 
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NC_011149  SeAg_B0170  Na+/galactoside symporter  26.87 
 
 
468 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.671323  n/a   
 
 
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NC_011094  SeSA_A3957  putative transporter  27.52 
 
 
460 aa  140  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_011094  SeSA_A0167  Na+/galactoside symporter  27.71 
 
 
468 aa  140  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.774115  normal 
 
 
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NC_009801  EcE24377A_4399  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter family protein  25.39 
 
 
467 aa  140  7e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011205  SeD_A0162  Na+/galactoside symporter  27.09 
 
 
468 aa  140  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_011083  SeHA_C0163  Na+/galactoside symporter  27.09 
 
 
468 aa  140  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_011083  SeHA_C4340  inner membrane symporter YihP  27.27 
 
 
460 aa  139  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_011080  SNSL254_A4294  inner membrane symporter YihP  27.27 
 
 
460 aa  139  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.357729  normal 
 
 
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NC_011149  SeAg_B4249  inner membrane symporter YihP  27.27 
 
 
460 aa  139  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011083  SeHA_C4339  putative permease  25.82 
 
 
474 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_011080  SNSL254_A4293  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  25.82 
 
 
472 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0966548  normal 
 
 
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NC_011149  SeAg_B4248  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  25.82 
 
 
472 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011205  SeD_A4406  inner membrane symporter YihP  27 
 
 
460 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0907861  normal 
 
 
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NC_011094  SeSA_A4228  inner membrane symporter YihP  27 
 
 
460 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_011083  SeHA_C4076  putative transporter  27.68 
 
 
460 aa  139  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.591118  normal 
 
 
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NC_011080  SNSL254_A4030  putative transporter  27.68 
 
 
460 aa  139  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
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