144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1700 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_1700  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
391 aa  747    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0805  major facilitator family transporter  26.74 
 
 
417 aa  63.5  0.000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.03228  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3289  major facilitator superfamily MFS_1  23.1 
 
 
416 aa  62.4  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0729  major facilitator transporter  27.24 
 
 
420 aa  59.3  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.463384  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_709  permease of the major facilitator superfamily  26.37 
 
 
420 aa  59.3  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.768296  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1406  major facilitator transporter  23.29 
 
 
401 aa  55.8  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000773977  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1765  major facilitator transporter  23.29 
 
 
376 aa  55.1  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2675  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25 
 
 
482 aa  54.3  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.493541  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0601  major facilitator superfamily MFS_1  21.69 
 
 
406 aa  53.9  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1988  major facilitator superfamily MFS_1  20.41 
 
 
425 aa  53.5  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1614  major facilitator transporter  21.12 
 
 
448 aa  53.1  0.000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000115723  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0659  permease of the major facilitator superfamily  26.11 
 
 
683 aa  53.1  0.000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1177  major facilitator transporter  22.44 
 
 
399 aa  52.8  0.000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.670552 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2482  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.51 
 
 
493 aa  52.8  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15461  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5055  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.67 
 
 
522 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.663135  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0896  major facilitator superfamily MFS_1  28.78 
 
 
462 aa  52  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1603  major facilitator superfamily permease  22.38 
 
 
465 aa  51.2  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000463294  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0523  major facilitator transporter  22.4 
 
 
416 aa  51.2  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2184  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  22.3 
 
 
514 aa  51.2  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.208618  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1842  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  22.3 
 
 
516 aa  50.8  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.17 
 
 
511 aa  50.8  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0454  major facilitator superfamily MFS_1  22.9 
 
 
404 aa  50.8  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.1922  normal  0.684757 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1145  major facilitator transporter  28.12 
 
 
436 aa  50.8  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.667647  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2761  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.76 
 
 
545 aa  50.4  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000648651  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5172  major facilitator superfamily MFS_1  27.03 
 
 
466 aa  50.1  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3331  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.17 
 
 
511 aa  50.1  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0816524  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3301  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.02 
 
 
512 aa  50.1  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.970656 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0963  major facilitator superfamily permease  26.77 
 
 
449 aa  49.7  0.00008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.337437  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01157  multidrug resistance membrane translocase  24.81 
 
 
501 aa  49.7  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.487953  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1289  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.5 
 
 
529 aa  50.1  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.433628  normal  0.278369 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4246  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  23.08 
 
 
411 aa  49.7  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381159  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0658  major facilitator superfamily drug efflux transporter  22.3 
 
 
534 aa  49.3  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.36986 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.06 
 
 
493 aa  49.3  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0551  major facilitator transporter  25.21 
 
 
407 aa  49.3  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000114988  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  22.66 
 
 
509 aa  49.3  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0528  major facilitator transporter  26.02 
 
 
467 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0826405  hitchhiker  0.00770286 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2493  major facilitator transporter  24.75 
 
 
465 aa  48.1  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270873  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4239  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.02 
 
 
493 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4465  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.02 
 
 
508 aa  48.9  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0456997  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5071  major facilitator transporter  24.75 
 
 
470 aa  48.5  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844572  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3392  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.02 
 
 
512 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.661215 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4120  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  23.08 
 
 
411 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.174908  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5358  major facilitator transporter  22.94 
 
 
465 aa  47.8  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12885  normal  0.601812 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3622  major facilitator transporter  24.75 
 
 
467 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4127  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.02 
 
 
512 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.648562  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11276  drug-transport integral membrane protein  22.96 
 
 
579 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.201451 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3898  major facilitator transporter  25.74 
 
 
467 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.547341  normal  0.242029 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3528  major facilitator transporter  22.94 
 
 
468 aa  47.8  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0798  transporter, putative  23.65 
 
 
442 aa  47.8  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4396  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.78 
 
 
526 aa  47.4  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01889  sugar transporter  23.19 
 
 
493 aa  47.4  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.660327  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2477  major facilitator superfamily MFS_1  22.08 
 
 
416 aa  47  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655762  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1686  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.12 
 
 
620 aa  47.4  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.892029  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  23.88 
 
 
473 aa  47  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1908  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.3 
 
 
509 aa  46.6  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.510287 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4299  major facilitator transporter  31.53 
 
 
413 aa  46.6  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.881294  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  23.88 
 
 
474 aa  46.6  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.95 
 
 
482 aa  46.6  0.0008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0049  sugar efflux permease  26.09 
 
 
485 aa  46.6  0.0008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.242248  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23370  arabinose efflux permease family protein  25.62 
 
 
535 aa  46.6  0.0009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.517259  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  23.88 
 
 
473 aa  46.6  0.0009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2450  major facilitator superfamily MFS_1  22.85 
 
 
407 aa  46.2  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.557384  normal  0.479748 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01230  Na+/melibiose symporter-like transporter  25.41 
 
 
435 aa  46.2  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1647  major facilitator superfamily protein  21.56 
 
 
386 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.761188  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3817  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.48 
 
 
697 aa  45.8  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00137036  normal  0.060926 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  23.88 
 
 
474 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  26.58 
 
 
451 aa  46.2  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6853  major facilitator transporter  24 
 
 
430 aa  46.2  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.854567  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1324  major facilitator superfamily MFS_1  21.6 
 
 
403 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.654344  normal  0.651678 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  20.74 
 
 
505 aa  46.2  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1852  multidrug resistance transmembrane protein  23.33 
 
 
512 aa  45.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.119423 
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  23.4 
 
 
476 aa  45.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  27.56 
 
 
413 aa  45.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0571  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  22.71 
 
 
457 aa  45.4  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.74034  normal  0.0218606 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0270  major facilitator transporter  27.36 
 
 
477 aa  45.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0250869  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  23.88 
 
 
474 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  21.7 
 
 
512 aa  45.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2382  major facilitator transporter  27.03 
 
 
466 aa  45.1  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.321963  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1519  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.48 
 
 
502 aa  45.4  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  27.88 
 
 
455 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0527  MDR-like permease  25.61 
 
 
387 aa  45.4  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  21.7 
 
 
389 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0219  cis,cis-muconate transport protein MucK  21.54 
 
 
427 aa  44.7  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1203  major facilitator superfamily MFS_1  26.06 
 
 
457 aa  44.7  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.831923  normal  0.147172 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3668  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  23.2 
 
 
411 aa  44.7  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1853  major facilitator superfamily permease  25.17 
 
 
471 aa  44.7  0.003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2187  major facilitator superfamily MFS_1  22.08 
 
 
416 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0329536  normal  0.242906 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2221  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.2 
 
 
609 aa  44.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.667625  normal  0.81194 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0199  cis,cis-muconate transport protein MucK  21.54 
 
 
427 aa  44.7  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.217293  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3450  major facilitator superfamily MFS_1  28.35 
 
 
499 aa  44.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00033474 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3742  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.63 
 
 
544 aa  44.7  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0155097  normal  0.299705 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3271  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  22.05 
 
 
411 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.638949 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  23.85 
 
 
474 aa  44.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0296  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.08 
 
 
531 aa  44.7  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3583  galactoside symporter  23.26 
 
 
475 aa  43.9  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.012026 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  23.21 
 
 
478 aa  43.9  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  23.15 
 
 
478 aa  43.9  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  25.97 
 
 
478 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  22.1 
 
 
388 aa  44.3  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  22.1 
 
 
388 aa  44.3  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>