73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2108 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_2347  major facilitator transporter  84.92 
 
 		 551 aa  912    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2108  major facilitator transporter  100 
 
 		 531 aa  1077    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.753085 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1776  major facilitator transporter  78.53 
 
 		 519 aa  806    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0516559  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1870  major facilitator transporter  99.44 
 
 		 531 aa  1071    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1925  major facilitator transporter  98.31 
 
 		 531 aa  1062    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1657  major facilitator transporter  69.47 
 
 		 518 aa  729    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2003  major facilitator transporter  72.66 
 
 		 530 aa  775    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1874  major facilitator transporter  75.7 
 
 		 524 aa  779    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322942  normal  0.129685 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2336  major facilitator transporter  84.92 
 
 		 551 aa  909    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2452  major facilitator transporter  85.11 
 
 		 551 aa  912    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2458  transporter, putative  89.14 
 
 		 529 aa  956    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2202  major facilitator transporter  74.71 
 
 		 551 aa  809    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000401875 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2011  major facilitator superfamily MFS_1  85.11 
 
 		 551 aa  912    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000990966  hitchhiker  0.000202625 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0599  transporter, putative  62.73 
 
 		 501 aa  610  1e-173  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.870524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2187  major facilitator transporter  60.04 
 
 		 502 aa  608  9.999999999999999e-173  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1403  major facilitator transporter  57.06 
 
 		 505 aa  591  1e-167  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.206645  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05075  putative sugar transporter  57.72 
 
 		 507 aa  587  1e-166  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0544446  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1021  major facilitator superfamily MFS_1  59.24 
 
 		 495 aa  543  1e-153  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1015  major facilitator transporter  54.6 
 
 		 502 aa  538  1e-151  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2738  major facilitator transporter  54.64 
 
 		 510 aa  528  1e-148  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.934726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4087  major facilitator transporter  58.57 
 
 		 514 aa  518  1e-146  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1886  major facilitator transporter  51.36 
 
 		 501 aa  483  1e-135  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.156331  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0596  major facilitator transporter  48.58 
 
 		 500 aa  428  1e-118  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.377823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5086  major facilitator superfamily MFS_1  43.87 
 
 		 457 aa  412  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0501179  normal  0.911731 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01889  sugar transporter  39.27 
 
 		 493 aa  384  1e-105  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.660327  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0975  hypothetical protein  39.27 
 
 		 498 aa  384  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.798408  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0864  major facilitator transporter  42.91 
 
 		 441 aa  362  1e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1089  major facilitator superfamily MFS_1  37.84 
 
 		 509 aa  334  3e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.339374  normal  0.270172 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1500  major facilitator transporter  60.85 
 
 		 448 aa  271  2e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.21091 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01240  sugar transporter  35.19 
 
 		 428 aa  247  4.9999999999999997e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.686511  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0053  major facilitator transporter  31.89 
 
 		 449 aa  208  2e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000090495  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0994  major facilitator superfamily permease  30.49 
 
 		 450 aa  195  1e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.211502  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3953  major facilitator superfamily MFS_1  41.38 
 
 		 457 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.210656 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1614  major facilitator transporter  36.51 
 
 		 448 aa  169  1e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000115723  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2441  transporter, putative  37.84 
 
 		 453 aa  168  2e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0973262  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0893  major facilitator superfamily permease  40.17 
 
 		 450 aa  168  2.9999999999999998e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1877  major facilitator transporter  41.71 
 
 		 458 aa  166  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0898  major facilitator superfamily permease  35.54 
 
 		 454 aa  162  1e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.880726  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0087  major facilitator transporter  37.82 
 
 		 457 aa  162  1e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000315537  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0041  major facilitator superfamily permease  34.27 
 
 		 471 aa  162  1e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000141077  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0832  major facilitator superfamily permease  38.98 
 
 		 453 aa  157  3e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000561592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02413  sugar transporter  40.8 
 
 		 443 aa  154  2.9999999999999998e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0084  major facilitator transporter  35.69 
 
 		 461 aa  154  2.9999999999999998e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380135  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01510  conserved hypothetical protein  31.79 
 
 		 459 aa  79.7  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02289  sucrose transporter, putative (Eurofung)  27.27 
 
 		 635 aa  75.5  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1599  major facilitator transporter  26.49 
 
 		 421 aa  62.8  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0523  major facilitator transporter  25.42 
 
 		 416 aa  61.2  0.00000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0200  major facilitator superfamily MFS_1  25.69 
 
 		 415 aa  58.5  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2049  Na+/melibiose symporter and related transporters-like protein  28.5 
 
 		 469 aa  58.2  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal  0.648168 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0454  major facilitator superfamily MFS_1  30.09 
 
 		 404 aa  53.1  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.1922  normal  0.684757 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02710  Major Facilitator Superfamily transporter  26.11 
 
 		 428 aa  51.6  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1406  major facilitator transporter  21.89 
 
 		 401 aa  50.8  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000773977  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0575  major facilitator transporter  28.89 
 
 		 461 aa  50.1  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0290  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.9 
 
 		 472 aa  48.9  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000222424  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2052  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  27.34 
 
 		 471 aa  48.5  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0248  major facilitator transporter  36.36 
 
 		 486 aa  48.1  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.135747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0034  major facilitator superfamily MFS_1  32.69 
 
 		 435 aa  47.8  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2904  tetracycline resistance protein  22.43 
 
 		 411 aa  47.8  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.316872  normal  0.10266 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2081  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.74 
 
 		 481 aa  47.4  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0834729  hitchhiker  0.000000228967 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0269  major facilitator transporter  30.53 
 
 		 506 aa  47  0.0008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0846  glycoside-Pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  26.83 
 
 		 416 aa  47  0.0008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0427  major facilitator superfamily MFS_1  31.67 
 
 		 426 aa  47  0.0009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1271  major facilitator transporter  29.44 
 
 		 403 aa  47  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.879022 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2155  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  27.59 
 
 		 471 aa  47  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00011339  normal  0.022313 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1981  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.28 
 
 		 481 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00156524  hitchhiker  0.000367008 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01690  conserved hypothetical protein  26.83 
 
 		 674 aa  46.2  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.887535  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1610  major facilitator transporter  30.59 
 
 		 404 aa  46.6  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0353  major facilitator transporter  26.32 
 
 		 464 aa  45.8  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.939472  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1994  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25 
 
 		 481 aa  45.8  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00859833  hitchhiker  0.00113965 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4939  major facilitator transporter  24.32 
 
 		 414 aa  45.4  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2426  tetracycline resistance protein  21.89 
 
 		 411 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1401  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.26 
 
 		 444 aa  43.9  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.738999  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2955  major facilitator superfamily MFS_1  29.52 
 
 		 405 aa  43.9  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>