64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0898 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_0898  major facilitator superfamily permease  100 
 
 		 454 aa  917    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.880726  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1614  major facilitator transporter  59.01 
 
 		 448 aa  552  1e-156  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000115723  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0893  major facilitator superfamily permease  51.36 
 
 		 450 aa  479  1e-134  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0041  major facilitator superfamily permease  52.48 
 
 		 471 aa  478  1e-134  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000141077  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0053  major facilitator transporter  52.12 
 
 		 449 aa  475  1e-133  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000090495  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0994  major facilitator superfamily permease  51.7 
 
 		 450 aa  474  1e-132  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.211502  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0087  major facilitator transporter  48.75 
 
 		 457 aa  462  1e-129  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000315537  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0832  major facilitator superfamily permease  49.77 
 
 		 453 aa  456  1e-127  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000561592  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2441  transporter, putative  50.34 
 
 		 453 aa  450  1e-125  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0973262  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0084  major facilitator transporter  49.15 
 
 		 461 aa  428  1e-118  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380135  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0975  hypothetical protein  33.4 
 
 		 498 aa  278  2e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.798408  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01889  sugar transporter  34.22 
 
 		 493 aa  263  6.999999999999999e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.660327  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5086  major facilitator superfamily MFS_1  34.82 
 
 		 457 aa  254  3e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0501179  normal  0.911731 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1874  major facilitator transporter  29.88 
 
 		 524 aa  227  3e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322942  normal  0.129685 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1089  major facilitator superfamily MFS_1  26.82 
 
 		 509 aa  224  2e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.339374  normal  0.270172 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1500  major facilitator transporter  32.83 
 
 		 448 aa  224  3e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.21091 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1021  major facilitator superfamily MFS_1  29.6 
 
 		 495 aa  221  1.9999999999999999e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0864  major facilitator transporter  27.64 
 
 		 441 aa  201  3e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1015  major facilitator transporter  27.79 
 
 		 502 aa  196  1e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1657  major facilitator transporter  26.68 
 
 		 518 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1776  major facilitator transporter  37.96 
 
 		 519 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0516559  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2011  major facilitator superfamily MFS_1  33.82 
 
 		 551 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000990966  hitchhiker  0.000202625 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2336  major facilitator transporter  33.82 
 
 		 551 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2452  major facilitator transporter  33.82 
 
 		 551 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2347  major facilitator transporter  33.82 
 
 		 551 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05075  putative sugar transporter  35.97 
 
 		 507 aa  173  5e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0544446  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2187  major facilitator transporter  37.07 
 
 		 502 aa  172  1e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1925  major facilitator transporter  36.02 
 
 		 531 aa  169  8e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2108  major facilitator transporter  35.54 
 
 		 531 aa  169  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.753085 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2003  major facilitator transporter  36.05 
 
 		 530 aa  169  1e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1870  major facilitator transporter  35.54 
 
 		 531 aa  169  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2202  major facilitator transporter  34.48 
 
 		 551 aa  168  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000401875 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1403  major facilitator transporter  36.56 
 
 		 505 aa  167  5e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.206645  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2458  transporter, putative  33.83 
 
 		 529 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4087  major facilitator transporter  29.42 
 
 		 514 aa  162  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1877  major facilitator transporter  26.15 
 
 		 458 aa  162  1e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0596  major facilitator transporter  37.56 
 
 		 500 aa  162  1e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.377823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1886  major facilitator transporter  38.12 
 
 		 501 aa  160  4e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.156331  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2738  major facilitator transporter  39.82 
 
 		 510 aa  160  5e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.934726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3953  major facilitator superfamily MFS_1  25.54 
 
 		 457 aa  159  7e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.210656 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02413  sugar transporter  25.88 
 
 		 443 aa  156  6e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0599  transporter, putative  32.92 
 
 		 501 aa  156  6e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.870524  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01240  sugar transporter  26.22 
 
 		 428 aa  155  9e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.686511  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01510  conserved hypothetical protein  26.03 
 
 		 459 aa  79.3  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0200  major facilitator superfamily MFS_1  25.33 
 
 		 415 aa  73.9  0.000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0523  major facilitator transporter  23.08 
 
 		 416 aa  63.9  0.000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2885  major facilitator transporter  22.02 
 
 		 432 aa  61.2  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00035649  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0255  major facilitator transporter  24.21 
 
 		 440 aa  57.8  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02289  sucrose transporter, putative (Eurofung)  27.32 
 
 		 635 aa  57.4  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3996  major facilitator transporter  24.29 
 
 		 438 aa  51.6  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1599  major facilitator transporter  23.57 
 
 		 421 aa  50.1  0.00009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0892  major facilitator transporter  24.57 
 
 		 424 aa  48.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.805867  normal  0.497197 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0798  transporter, putative  22.25 
 
 		 442 aa  47.4  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1988  major facilitator superfamily MFS_1  22.73 
 
 		 425 aa  47.4  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3267  major facilitator transporter  21.49 
 
 		 415 aa  47  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0780681  normal  0.364964 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01690  conserved hypothetical protein  22.44 
 
 		 674 aa  46.2  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.887535  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45818  predicted protein  26.77 
 
 		 583 aa  46.2  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0729495  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2955  major facilitator superfamily MFS_1  26.17 
 
 		 405 aa  46.2  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2528  major facilitator superfamily MFS_1  22.47 
 
 		 451 aa  45.1  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0819  oligogalacturonide transporter  24.16 
 
 		 524 aa  45.1  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3738  hypothetical protein  27.48 
 
 		 467 aa  45.1  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00183877  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14174  predicted protein  29.6 
 
 		 405 aa  44.3  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1406  major facilitator transporter  24.22 
 
 		 401 aa  43.5  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000773977  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2444  major facilitator transporter  24.16 
 
 		 527 aa  43.5  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>