50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0798 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0798  transporter, putative  100 
 
 		 442 aa  890    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1599  major facilitator transporter  33.18 
 
 		 421 aa  221  3e-56  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0523  major facilitator transporter  33.5 
 
 		 416 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0200  major facilitator superfamily MFS_1  32.96 
 
 		 415 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1406  major facilitator transporter  29.19 
 
 		 401 aa  177  3e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000773977  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2885  major facilitator transporter  28.28 
 
 		 432 aa  175  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00035649  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02710  Major Facilitator Superfamily transporter  25.51 
 
 		 428 aa  66.2  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5086  major facilitator superfamily MFS_1  25.43 
 
 		 457 aa  61.6  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0501179  normal  0.911731 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2222  multidrug resistance protein  32.77 
 
 		 398 aa  57.8  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000329957  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2183  multidrug resistance protein  31.47 
 
 		 400 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.532431  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2528  multidrug resistance protein  31.47 
 
 		 398 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000149033  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2463  multidrug resistance protein, putative  32.41 
 
 		 398 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.190584  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0454  major facilitator superfamily MFS_1  24.92 
 
 		 404 aa  55.8  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.1922  normal  0.684757 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0975  hypothetical protein  24.41 
 
 		 498 aa  54.3  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.798408  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0616  major facilitator superfamily MFS_1  23.97 
 
 		 443 aa  52  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0461422  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0427  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 426 aa  50.8  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0679  major facilitator transporter  23.23 
 
 		 439 aa  48.5  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000876885  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0084  major facilitator transporter  24.08 
 
 		 461 aa  48.5  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380135  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1015  major facilitator transporter  26 
 
 		 502 aa  48.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0864  major facilitator transporter  25.44 
 
 		 441 aa  48.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2441  transporter, putative  24.41 
 
 		 453 aa  48.1  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0973262  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0892  major facilitator transporter  27.12 
 
 		 424 aa  48.5  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.805867  normal  0.497197 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2546  major facilitator transporter  23.67 
 
 		 449 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.146508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0090  major facilitator transporter  28.7 
 
 		 422 aa  47.8  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000497214  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01889  sugar transporter  22.55 
 
 		 493 aa  47.4  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.660327  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2816  major facilitator superfamily protein  42.86 
 
 		 459 aa  46.6  0.0009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0898  major facilitator superfamily permease  22.25 
 
 		 454 aa  45.8  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.880726  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1354  multidrug-efflux transporter  21.3 
 
 		 370 aa  46.6  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0389  General substrate transporter  34.29 
 
 		 430 aa  46.2  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1344  major facilitator transporter  22.9 
 
 		 454 aa  45.8  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05075  putative sugar transporter  27.27 
 
 		 507 aa  45.8  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0544446  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1988  major facilitator superfamily MFS_1  30.91 
 
 		 425 aa  45.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2738  major facilitator transporter  23.56 
 
 		 510 aa  45.8  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.934726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1700  major facilitator superfamily MFS_1  30.09 
 
 		 391 aa  45.4  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1174  major facilitator superfamily MFS_1  24.28 
 
 		 409 aa  45.8  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.148034  normal  0.0846365 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0027  major facilitator superfamily MFS_1  23.75 
 
 		 465 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.453112  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1065  major facilitator transporter  52.38 
 
 		 419 aa  44.7  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.632992  normal  0.786866 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3289  major facilitator superfamily MFS_1  21.28 
 
 		 416 aa  44.7  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4332  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  34.29 
 
 		 430 aa  44.7  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0893  major facilitator superfamily permease  22.13 
 
 		 450 aa  43.9  0.006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0087  major facilitator transporter  22.51 
 
 		 457 aa  43.9  0.006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000315537  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02413  sugar transporter  27.21 
 
 		 443 aa  43.5  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0109  general substrate transporter  35.16 
 
 		 440 aa  43.5  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.942057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0053  major facilitator transporter  23.96 
 
 		 449 aa  43.5  0.008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000090495  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6833  transporter, major facilitator superfamily  29.17 
 
 		 423 aa  43.1  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.821608  normal  0.570568 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1832  glycoside-Pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  28.68 
 
 		 353 aa  43.1  0.01  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3149  major facilitator superfamily MFS_1  24.16 
 
 		 460 aa  43.1  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2979  major facilitator superfamily MFS_1  24.63 
 
 		 421 aa  43.1  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0876079  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1865  major facilitator transporter  26.83 
 
 		 401 aa  43.1  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.418414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1403  major facilitator transporter  26.74 
 
 		 505 aa  43.1  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.206645  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>