96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0616 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_0616  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 443 aa  874    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0461422  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0200  major facilitator superfamily MFS_1  25.94 
 
 		 415 aa  96.7  8e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2885  major facilitator transporter  24.09 
 
 		 432 aa  87.8  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00035649  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0523  major facilitator transporter  25.94 
 
 		 416 aa  87  5e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1406  major facilitator transporter  25.24 
 
 		 401 aa  77.8  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000773977  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2979  major facilitator superfamily MFS_1  26.36 
 
 		 421 aa  78.2  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0876079  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2450  major facilitator superfamily MFS_1  24.04 
 
 		 407 aa  72  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.557384  normal  0.479748 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1599  major facilitator transporter  25.28 
 
 		 421 aa  72.4  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0084  major facilitator transporter  23.15 
 
 		 461 aa  69.3  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380135  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1988  major facilitator superfamily MFS_1  24.38 
 
 		 425 aa  67.8  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02710  Major Facilitator Superfamily transporter  23.37 
 
 		 428 aa  66.2  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3775  major facilitator superfamily MFS_1  24.87 
 
 		 425 aa  65.1  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0892  major facilitator transporter  21.97 
 
 		 424 aa  63.5  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.805867  normal  0.497197 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0427  major facilitator superfamily MFS_1  23.3 
 
 		 426 aa  62.8  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5086  major facilitator superfamily MFS_1  22.63 
 
 		 457 aa  62.4  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0501179  normal  0.911731 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0893  major facilitator superfamily permease  21.46 
 
 		 450 aa  61.6  0.00000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0454  major facilitator superfamily MFS_1  23.92 
 
 		 404 aa  58.9  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.1922  normal  0.684757 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0303  major facilitator superfamily MFS_1  27.85 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.394138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3996  major facilitator transporter  22.95 
 
 		 438 aa  57.8  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0798  transporter, putative  23.73 
 
 		 442 aa  55.5  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3289  major facilitator superfamily MFS_1  25.06 
 
 		 416 aa  55.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0506  putative permease  25.97 
 
 		 210 aa  54.7  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0994  major facilitator superfamily permease  22.39 
 
 		 450 aa  53.9  0.000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.211502  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1614  major facilitator transporter  20.04 
 
 		 448 aa  52  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000115723  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1716  major facilitator transporter  24.21 
 
 		 410 aa  52.4  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354748  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1674  multidrug resistance protein B  23.41 
 
 		 404 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1943  major facilitator family transporter  23.41 
 
 		 404 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1858  major facilitator family transporter  23.41 
 
 		 404 aa  51.6  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.817955  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1859  major facilitator family transporter  23.62 
 
 		 404 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.757692  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1722  major facilitator family transporter  23.41 
 
 		 404 aa  51.6  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.636951  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0053  major facilitator transporter  21.13 
 
 		 449 aa  51.2  0.00004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000090495  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1699  multidrug resistance protein B  23.02 
 
 		 404 aa  51.2  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1896  major facilitator family transporter  22.62 
 
 		 404 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2758  major facilitator transporter  23.54 
 
 		 447 aa  51.2  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0165  major facilitator transporter  25.58 
 
 		 415 aa  50.8  0.00005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000668995  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0846  glycoside-Pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  21.23 
 
 		 416 aa  50.4  0.00006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3483  major facilitator family transporter  25.2 
 
 		 404 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1455  major facilitator transporter  24.27 
 
 		 404 aa  50.4  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0805  major facilitator family transporter  24.73 
 
 		 417 aa  49.3  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.03228  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3237  major facilitator superfamily MFS_1  28 
 
 		 456 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0167  major facilitator transporter  24.37 
 
 		 415 aa  49.3  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000230184  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0975  hypothetical protein  25.4 
 
 		 498 aa  49.3  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.798408  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0729  major facilitator transporter  24.54 
 
 		 420 aa  48.9  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.463384  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4300  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.33 
 
 		 504 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1015  major facilitator transporter  25.11 
 
 		 502 aa  48.5  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1974  major facilitator family transporter  23.02 
 
 		 404 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1928  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 539 aa  48.5  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00178599  normal  0.278275 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0898  major facilitator superfamily permease  21.29 
 
 		 454 aa  48.5  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.880726  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4004  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.5 
 
 		 498 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.074494 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2528  major facilitator superfamily MFS_1  23.04 
 
 		 451 aa  47.4  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0647  major facilitator superfamily MFS_1  31.43 
 
 		 451 aa  47  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4054  major facilitator transporter  29.27 
 
 		 437 aa  47  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0519542 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03040  putative MFS transporter  26.09 
 
 		 501 aa  47  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.479989  hitchhiker  0.0000743098 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1184  major facilitator superfamily MFS_1  26.78 
 
 		 447 aa  47  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1592  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  22.16 
 
 		 464 aa  46.6  0.0008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00442608  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1883  major facilitator superfamily MFS_1  23.31 
 
 		 421 aa  45.8  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1406  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  23.81 
 
 		 471 aa  46.2  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.455319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2242  major facilitator transporter  28.43 
 
 		 432 aa  45.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2955  major facilitator superfamily MFS_1  22.7 
 
 		 405 aa  46.2  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5507  major facilitator transporter  26.72 
 
 		 441 aa  46.2  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.352924 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05075  putative sugar transporter  25.22 
 
 		 507 aa  46.2  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0544446  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0871  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  25.37 
 
 		 433 aa  45.8  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.978569  normal  0.464364 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0144  major facilitator transporter  26.06 
 
 		 429 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1403  major facilitator transporter  25.68 
 
 		 505 aa  45.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.206645  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1527  Na+/xyloside symporter  20.7 
 
 		 444 aa  45.1  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5330  major facilitator family transporter  26.06 
 
 		 429 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0357971  hitchhiker  0.00453891 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5238  major facilitator transporter  25.93 
 
 		 429 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.18052  normal  0.198846 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0861  major facilitator superfamily MFS_1  26.29 
 
 		 483 aa  45.8  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4340  major facilitator transporter  31.97 
 
 		 480 aa  45.8  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.199167  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2072  major facilitator family transporter  25.57 
 
 		 466 aa  45.1  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.264718  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3210  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 540 aa  45.1  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1071  normal  0.711743 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2187  major facilitator transporter  25.49 
 
 		 502 aa  45.1  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1831  major facilitator transporter  21.74 
 
 		 430 aa  45.1  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.612991  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3554  major facilitator transporter  23.79 
 
 		 423 aa  45.1  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3462  major facilitator transporter  26.79 
 
 		 412 aa  44.3  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1874  major facilitator transporter  24.91 
 
 		 524 aa  44.3  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322942  normal  0.129685 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5379  major facilitator transporter  25.93 
 
 		 429 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40701 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_709  permease of the major facilitator superfamily  31.72 
 
 		 420 aa  43.9  0.006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.768296  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1385  major facilitator superfamily MFS_1  24.92 
 
 		 429 aa  43.9  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0331  MFS family transporter  27.27 
 
 		 515 aa  43.5  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2190  major facilitator family transporter  24.08 
 
 		 430 aa  43.5  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4557  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 433 aa  43.5  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0875  major facilitator family transporter  24.08 
 
 		 430 aa  43.5  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  27.14 
 
 		 433 aa  43.5  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0466  major facilitator family transporter  24.08 
 
 		 430 aa  43.5  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.596732  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0564  major facilitator family transporter  24.08 
 
 		 430 aa  43.5  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01889  sugar transporter  27.03 
 
 		 493 aa  43.5  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.660327  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1424  major facilitator family transporter  24.08 
 
 		 430 aa  43.5  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08630  benzoate transporter  28.26 
 
 		 443 aa  43.1  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.866353  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1657  major facilitator transporter  29.8 
 
 		 518 aa  43.1  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0153  tetracycline resistance protein, class A  22.46 
 
 		 424 aa  43.1  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3350  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  20.89 
 
 		 477 aa  43.1  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4800  multidrug resistance protein D  28.23 
 
 		 394 aa  43.1  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000558719 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3597  major facilitator transporter  25.17 
 
 		 462 aa  43.1  0.01  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0800  major facilitator transporter  25.17 
 
 		 466 aa  43.1  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00491576  normal  0.0752982 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0042  tetracycline repressor protein TetA, class A  22.46 
 
 		 424 aa  43.1  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>