More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMAA1424 on replicon NC_006349
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008835  BMA10229_2190  major facilitator family transporter  100 
 
 
430 aa  848    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0466  major facilitator family transporter  100 
 
 
430 aa  848    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.596732  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1424  major facilitator family transporter  100 
 
 
430 aa  848    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5198  major facilitator transporter  84.85 
 
 
436 aa  705    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.721044  normal  0.258081 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1881  major facilitator family transporter  99.77 
 
 
465 aa  844    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0337  major facilitator transporter  84.42 
 
 
435 aa  706    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0564  major facilitator family transporter  100 
 
 
430 aa  848    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2072  major facilitator family transporter  97.21 
 
 
466 aa  806    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.264718  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4557  major facilitator superfamily MFS_1  77.62 
 
 
433 aa  655    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0875  major facilitator family transporter  100 
 
 
430 aa  848    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3413  major facilitator transporter  85.18 
 
 
436 aa  702    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.590366 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0871  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  76.69 
 
 
433 aa  650    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.978569  normal  0.464364 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4959  major facilitator transporter  84.88 
 
 
461 aa  708    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00527291 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3057  major facilitator transporter  84.65 
 
 
458 aa  707    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5310  major facilitator transporter  84.65 
 
 
458 aa  707    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.197637 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4670  major facilitator transporter  84.85 
 
 
436 aa  704    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.637276 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4664  major facilitator transporter  78.29 
 
 
435 aa  667    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.202429  normal  0.532482 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3627  major facilitator transporter  71.76 
 
 
436 aa  598  1e-170  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.943352  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5616  general substrate transporter  68.25 
 
 
432 aa  584  1e-166  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.68439  normal  0.433178 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3950  major facilitator protein family permease  72.46 
 
 
436 aa  586  1e-166  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5330  major facilitator family transporter  68.46 
 
 
429 aa  578  1e-164  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0357971  hitchhiker  0.00453891 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6155  MFS family transporter  67.06 
 
 
438 aa  579  1e-164  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000158885  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70920  major facilitator transporter  67.78 
 
 
438 aa  578  1e-164  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.23886  normal  0.150917 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5238  major facilitator transporter  68.95 
 
 
429 aa  581  1e-164  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.18052  normal  0.198846 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5379  major facilitator transporter  68.95 
 
 
429 aa  580  1e-164  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.40701 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0144  major facilitator transporter  67.47 
 
 
429 aa  578  1e-164  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5042  major facilitator transporter  67.07 
 
 
429 aa  565  1e-160  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.12402 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5488  major facilitator family transporter  66.35 
 
 
445 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0690  major facilitator transporter  68.4 
 
 
435 aa  560  1e-158  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00769628  hitchhiker  0.00253041 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5728  major facilitator transporter  67.06 
 
 
442 aa  558  1e-158  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.815248  normal  0.706105 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6481  major facilitator transporter  66.59 
 
 
442 aa  556  1e-157  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0229436  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0579  major facilitator superfamily MFS_1  66.35 
 
 
437 aa  555  1e-157  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.422736  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0800  major facilitator transporter  66.83 
 
 
466 aa  549  1e-155  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00491576  normal  0.0752982 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50610  General substrate transporter  67.32 
 
 
436 aa  549  1e-155  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.243642  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3469  major facilitator transporter  67.09 
 
 
459 aa  550  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00699451  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3597  major facilitator transporter  66.83 
 
 
462 aa  549  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0572  major facilitator transporter  65.93 
 
 
433 aa  529  1e-149  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1159  major facilitator transporter  60.81 
 
 
435 aa  518  1e-146  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3661  major facilitator superfamily MFS_1  64.49 
 
 
445 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.755106  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3856  major facilitator superfamily MFS_1  63.41 
 
 
445 aa  514  1e-144  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0540  major facilitator superfamily MFS_1  65.36 
 
 
445 aa  503  1e-141  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1058  major facilitator superfamily transporter  62.35 
 
 
442 aa  502  1e-141  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.861696  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1184  major facilitator superfamily MFS_1  62.68 
 
 
447 aa  500  1e-140  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5753  MFS permease  57.91 
 
 
448 aa  484  1e-135  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5507  major facilitator transporter  58.44 
 
 
441 aa  481  1e-135  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.352924 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1267  major facilitator transporter  56.22 
 
 
487 aa  483  1e-135  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1680  major facilitator family transporter  56.06 
 
 
476 aa  477  1e-133  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.311406  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1624  major facilitator family transporter  56.06 
 
 
476 aa  477  1e-133  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.412047  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0311  major facilitator superfamily MFS_1  51.62 
 
 
437 aa  435  1e-121  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00802  prop transport protein  57.64 
 
 
387 aa  422  1e-117  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0278837  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0767  major facilitator superfamily MFS_1  54.98 
 
 
441 aa  402  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.747489  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1612  major facilitator family transporter  51.8 
 
 
438 aa  376  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.170164  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3768  major facilitator transporter  52.49 
 
 
438 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4767  general substrate transporter  50.6 
 
 
450 aa  373  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.138679 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0147  putative transporter, major facilitator superfamily  47 
 
 
436 aa  359  6e-98  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0248  major facilitator superfamily protein  47.12 
 
 
436 aa  355  1e-96  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0300  major facilitator superfamily protein  46.87 
 
 
436 aa  353  2.9999999999999997e-96  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0277  major facilitator superfamily protein  46.62 
 
 
436 aa  352  7e-96  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3530  major facilitator transporter  50.36 
 
 
441 aa  352  1e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0089  conserved hypothetical protein, probable MFS transporter  45.71 
 
 
429 aa  351  2e-95  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.964688  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4206  major facilitator family transporter  49.88 
 
 
441 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3778  major facilitator transporter  49.88 
 
 
441 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1576  proline/betaine transporter, putative, authentic frameshift  43.07 
 
 
431 aa  334  2e-90  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1647  major facilitator transporter  49.88 
 
 
441 aa  325  7e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0539  major facilitator superfamily protein  43.71 
 
 
432 aa  325  1e-87  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.956103  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1000  CjaB protein  36.88 
 
 
415 aa  286  5.999999999999999e-76  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0025  major facilitator family transporter  40 
 
 
438 aa  271  1e-71  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1063  transport protein CjaB  36.43 
 
 
415 aa  271  2e-71  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.148987  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2153  proline/betaine transporter  40 
 
 
443 aa  270  2.9999999999999997e-71  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.877482  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0694  major facilitator family transporter CjaB  36.79 
 
 
407 aa  259  4e-68  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0790  major facilitator transporter  30 
 
 
433 aa  240  2.9999999999999997e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0796  major facilitator transporter  31 
 
 
433 aa  241  2.9999999999999997e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5160  major facilitator superfamily MFS_1  35.24 
 
 
444 aa  239  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  34.14 
 
 
443 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0903  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  36.3 
 
 
443 aa  234  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.760701  normal  0.2203 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2791  major facilitator superfamily MFS_1  34.14 
 
 
443 aa  225  1e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0989  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  35.87 
 
 
439 aa  224  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3403  major facilitator transporter  34.7 
 
 
461 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1522  major facilitator superfamily metabolite (proline/betaine)/H(+) symporter  34.82 
 
 
438 aa  218  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00301403  normal  0.935077 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6582  major facilitator superfamily MFS_1  37.5 
 
 
433 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.512331  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1693  major facilitator transporter  33.33 
 
 
444 aa  217  4e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0930  major facilitator transporter  34.5 
 
 
448 aa  216  8e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3017  major facilitator transporter  34.62 
 
 
440 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.615257 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2818  general substrate transporter  31.36 
 
 
483 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.139895  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6600  major facilitator transporter  38.05 
 
 
434 aa  213  7e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.261111 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1733  major facilitator transporter  30.98 
 
 
435 aa  212  1e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.32022  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1453  general substrate transporter  31.2 
 
 
482 aa  211  2e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0358051  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0292  hypothetical protein  32.21 
 
 
431 aa  210  3e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5767  major facilitator transporter  33.42 
 
 
438 aa  211  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0593  major facilitator transporter  31.7 
 
 
457 aa  210  3e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3018  major facilitator family transporter  31.76 
 
 
485 aa  210  4e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2222  major facilitator family transporter  31.76 
 
 
485 aa  210  4e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000297213 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2237  general substrate transporter  32.65 
 
 
444 aa  210  4e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0866984  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3666  major facilitator transporter  33.16 
 
 
444 aa  209  9e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.262449 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2045  major facilitator transporter  32.78 
 
 
445 aa  209  9e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.817358 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3781  major facilitator transporter  31.37 
 
 
438 aa  209  9e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.243933  decreased coverage  0.00125466 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2807  major facilitator family transporter  31.51 
 
 
485 aa  209  1e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3020  major facilitator family transporter  31.51 
 
 
485 aa  209  1e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3017  major facilitator family transporter  31.51 
 
 
485 aa  209  1e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.352179 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3742  major facilitator transporter  31.37 
 
 
438 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0201656 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>