225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2955 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2955  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 405 aa  789    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0454  major facilitator superfamily MFS_1  61.98 
 
 		 404 aa  483  1e-135  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.1922  normal  0.684757 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2450  major facilitator superfamily MFS_1  42.54 
 
 		 407 aa  272  8.000000000000001e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.557384  normal  0.479748 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0892  major facilitator transporter  41.69 
 
 		 424 aa  250  3e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.805867  normal  0.497197 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2979  major facilitator superfamily MFS_1  29.81 
 
 		 421 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0876079  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3554  major facilitator transporter  32.34 
 
 		 423 aa  125  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4281  major facilitator superfamily MFS_1  31.91 
 
 		 423 aa  123  7e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.502977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3996  major facilitator transporter  31.43 
 
 		 438 aa  120  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0427  major facilitator superfamily MFS_1  29.24 
 
 		 426 aa  116  7.999999999999999e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0806  major facilitator transporter  29.06 
 
 		 419 aa  114  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02710  Major Facilitator Superfamily transporter  29.08 
 
 		 428 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3267  major facilitator transporter  28.97 
 
 		 415 aa  110  5e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0780681  normal  0.364964 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6833  transporter, major facilitator superfamily  32.49 
 
 		 423 aa  109  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.821608  normal  0.570568 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0255  major facilitator transporter  29.81 
 
 		 440 aa  109  9.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3775  major facilitator superfamily MFS_1  29.24 
 
 		 425 aa  108  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1988  major facilitator superfamily MFS_1  27.63 
 
 		 425 aa  105  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3224  major facilitator superfamily MFS_1  30.42 
 
 		 433 aa  101  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0034  major facilitator superfamily MFS_1  28.93 
 
 		 435 aa  101  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2779  major facilitator transporter  31.41 
 
 		 443 aa  95.9  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.617635  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1439  major facilitator superfamily MFS_1  29.81 
 
 		 426 aa  94  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0835777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4387  major facilitator superfamily MFS_1  28.8 
 
 		 429 aa  88.2  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.591192  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0846  glycoside-Pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  23.36 
 
 		 416 aa  86.7  6e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03160  Na+/melibiose symporter-like transporter  28.15 
 
 		 419 aa  86.7  7e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14174  predicted protein  25.13 
 
 		 405 aa  84.7  0.000000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2534  major facilitator superfamily MFS_1  28.06 
 
 		 446 aa  81.3  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2528  major facilitator superfamily MFS_1  26.42 
 
 		 451 aa  81.3  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0921  major facilitator transporter  26.21 
 
 		 402 aa  78.6  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1836  major facilitator transporter  27.45 
 
 		 440 aa  67.4  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.860837  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1610  major facilitator transporter  26.92 
 
 		 404 aa  65.1  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45818  predicted protein  29.21 
 
 		 583 aa  64.7  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0729495  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2559  major facilitator superfamily MFS_1  30.07 
 
 		 400 aa  63.2  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.71803  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1614  major facilitator transporter  24.09 
 
 		 448 aa  62.4  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000115723  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0601  major facilitator superfamily MFS_1  23.37 
 
 		 406 aa  61.6  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1620  major facilitator superfamily MFS_1  25.31 
 
 		 419 aa  60.8  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00719862  normal  0.0630669 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0952  General substrate transporter  26.32 
 
 		 430 aa  57.4  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1832  glycoside-Pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  22.18 
 
 		 353 aa  57  0.0000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1330  Na+/sugar symporter  24.24 
 
 		 545 aa  57  0.0000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0506  putative permease  25.87 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4724  tetracycline resistance protein, class B  28.46 
 
 		 401 aa  56.6  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2678  major facilitator superfamily MFS_1  30.07 
 
 		 408 aa  55.1  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0852  major facilitator transporter  25.08 
 
 		 410 aa  55.1  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.133449 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5122  major facilitator transporter  25.34 
 
 		 414 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0478  major facilitator superfamily transporter  25.5 
 
 		 403 aa  53.9  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0850  major facilitator superfamily MFS_1  24.46 
 
 		 406 aa  53.9  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2577  major facilitator superfamily MFS_1  26.22 
 
 		 395 aa  53.9  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363231  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1351  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  26.71 
 
 		 416 aa  53.9  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0854503  normal  0.0233504 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2463  multidrug resistance protein, putative  22.54 
 
 		 398 aa  53.9  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.190584  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0418  major facilitator superfamily MFS_1  25.5 
 
 		 403 aa  53.5  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0693  major facilitator superfamily permease  22.73 
 
 		 405 aa  53.5  0.000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.883245  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0216  hypothetical protein  25.57 
 
 		 393 aa  53.9  0.000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2757  major facilitator superfamily MFS_1  28.1 
 
 		 409 aa  53.5  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0424  major facilitator superfamily MFS_1  25.75 
 
 		 403 aa  53.1  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.477286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0436  major facilitator superfamily MFS_1  25.75 
 
 		 403 aa  53.1  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.263395  normal  0.769414 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  26.62 
 
 		 440 aa  53.1  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1478  major facilitator superfamily MFS_1  27.84 
 
 		 399 aa  52.4  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.311538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2528  multidrug resistance protein  23.12 
 
 		 398 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000149033  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  29.7 
 
 		 387 aa  52.4  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5072  major facilitator family transporter  25 
 
 		 425 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.348741  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2441  transporter, putative  32.33 
 
 		 453 aa  52  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0973262  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  33.06 
 
 		 423 aa  52  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0994  major facilitator superfamily permease  21.27 
 
 		 450 aa  51.6  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.211502  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1653  major facilitator transporter  24.12 
 
 		 388 aa  51.6  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1056  major facilitator transporter  25.08 
 
 		 396 aa  51.6  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0999083  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1921  PUCC protein  28.3 
 
 		 427 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.824161 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4945  major facilitator transporter  25 
 
 		 414 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.395119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0084  major facilitator transporter  28.93 
 
 		 461 aa  51.6  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380135  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2885  major facilitator transporter  26.35 
 
 		 432 aa  51.2  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00035649  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0041  major facilitator superfamily permease  21.73 
 
 		 471 aa  51.6  0.00003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000141077  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00896  transport transmembrane protein  25.5 
 
 		 406 aa  50.8  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1765  major facilitator transporter  23.45 
 
 		 376 aa  50.8  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  31.67 
 
 		 389 aa  50.8  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1406  major facilitator transporter  22.35 
 
 		 401 aa  50.8  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000773977  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0894  major facilitator superfamily MFS_1  23.85 
 
 		 403 aa  50.8  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0840  major facilitator superfamily MFS_1  26.22 
 
 		 413 aa  50.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1482  major facilitator superfamily MFS_1  27.67 
 
 		 403 aa  50.4  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000899768  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0806  major facilitator transporter  24.76 
 
 		 396 aa  50.1  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.674294 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0805  major facilitator superfamily MFS_1  22.84 
 
 		 408 aa  50.1  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.659867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0523  major facilitator transporter  22.82 
 
 		 416 aa  50.1  0.00008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0278  putative light-harvesting 1 (B870) complex assembly protein PucC  28.03 
 
 		 427 aa  49.7  0.00009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0710  major facilitator superfamily MFS_1  27.24 
 
 		 404 aa  49.7  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2454  major facilitator transporter  24.54 
 
 		 389 aa  49.7  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117931  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0773  multidrug resistance protein, putative  25.33 
 
 		 399 aa  49.3  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0889  major facilitator transporter  25.73 
 
 		 447 aa  49.7  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.242663  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5664  major facilitator transporter  24.2 
 
 		 431 aa  49.3  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  26.78 
 
 		 394 aa  49.7  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0960  major facilitator superfamily MFS_1  26.22 
 
 		 413 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.272153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0394  major facilitator transporter  24.66 
 
 		 414 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2202  major facilitator transporter  30.1 
 
 		 551 aa  49.7  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000401875 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2255  general substrate transporter  26.59 
 
 		 446 aa  49.3  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000684239  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0893  major facilitator superfamily permease  26.56 
 
 		 450 aa  49.3  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3215  major facilitator transporter  24.32 
 
 		 411 aa  49.7  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0334409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1931  major facilitator transporter  30.14 
 
 		 395 aa  49.3  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0709998  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2540  phosphoglycerate transport: transporter  29.14 
 
 		 463 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2183  multidrug resistance protein  22.83 
 
 		 400 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.532431  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0195  major facilitator transporter  35.35 
 
 		 398 aa  48.9  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000282756  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2588  phosphoglycerate transport: transporter  29.14 
 
 		 463 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3286  major facilitator superfamily MFS_1  22.71 
 
 		 395 aa  48.5  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2759  phosphoglycerate transporter  29.14 
 
 		 463 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0832  major facilitator superfamily permease  23.84 
 
 		 453 aa  48.5  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000561592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1368  major facilitator superfamily permease  22.37 
 
 		 402 aa  48.9  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>