28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0921 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0921  major facilitator transporter  100 
 
 		 402 aa  775    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1610  major facilitator transporter  51.09 
 
 		 404 aa  324  2e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3554  major facilitator transporter  27.11 
 
 		 423 aa  120  4.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2979  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 		 421 aa  91.3  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0876079  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3267  major facilitator transporter  26.02 
 
 		 415 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0780681  normal  0.364964 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4281  major facilitator superfamily MFS_1  26.8 
 
 		 423 aa  78.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.502977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1988  major facilitator superfamily MFS_1  26.89 
 
 		 425 aa  78.2  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3775  major facilitator superfamily MFS_1  30.25 
 
 		 425 aa  77.8  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0034  major facilitator superfamily MFS_1  28.99 
 
 		 435 aa  76.6  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2955  major facilitator superfamily MFS_1  26.14 
 
 		 405 aa  74.7  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0255  major facilitator transporter  25.41 
 
 		 440 aa  72  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3996  major facilitator transporter  27.03 
 
 		 438 aa  72  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4387  major facilitator superfamily MFS_1  28.12 
 
 		 429 aa  68.2  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.591192  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0427  major facilitator superfamily MFS_1  24.81 
 
 		 426 aa  67  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02710  Major Facilitator Superfamily transporter  25.07 
 
 		 428 aa  66.2  0.0000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6833  transporter, major facilitator superfamily  26.76 
 
 		 423 aa  65.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.821608  normal  0.570568 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0846  glycoside-Pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  24.3 
 
 		 416 aa  65.9  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0454  major facilitator superfamily MFS_1  26.58 
 
 		 404 aa  62.8  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.1922  normal  0.684757 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2450  major facilitator superfamily MFS_1  21.11 
 
 		 407 aa  56.6  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.557384  normal  0.479748 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2779  major facilitator transporter  31.25 
 
 		 443 aa  53.5  0.000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.617635  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3224  major facilitator superfamily MFS_1  26.18 
 
 		 433 aa  52.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1832  glycoside-Pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  31.06 
 
 		 353 aa  49.7  0.00009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2528  major facilitator superfamily MFS_1  25.58 
 
 		 451 aa  49.3  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0892  major facilitator transporter  26.06 
 
 		 424 aa  47.8  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.805867  normal  0.497197 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03160  Na+/melibiose symporter-like transporter  25.33 
 
 		 419 aa  46.6  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0806  major facilitator transporter  25.78 
 
 		 419 aa  46.6  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6134  major facilitator transporter  25.46 
 
 		 554 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6422  major facilitator transporter  25.09 
 
 		 554 aa  44.7  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.726262 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>