171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0427 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0427  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 426 aa  827    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1988  major facilitator superfamily MFS_1  62.91 
 
 		 425 aa  524  1e-147  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0806  major facilitator transporter  38.77 
 
 		 419 aa  248  1e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3267  major facilitator transporter  35.66 
 
 		 415 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0780681  normal  0.364964 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2534  major facilitator superfamily MFS_1  34.6 
 
 		 446 aa  211  2e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2528  major facilitator superfamily MFS_1  33.58 
 
 		 451 aa  210  4e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3554  major facilitator transporter  37.36 
 
 		 423 aa  208  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4281  major facilitator superfamily MFS_1  34.46 
 
 		 423 aa  205  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.502977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0255  major facilitator transporter  36.94 
 
 		 440 aa  204  3e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3996  major facilitator transporter  37.47 
 
 		 438 aa  202  9e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0034  major facilitator superfamily MFS_1  35.19 
 
 		 435 aa  199  7.999999999999999e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6833  transporter, major facilitator superfamily  37.24 
 
 		 423 aa  189  5.999999999999999e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.821608  normal  0.570568 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3775  major facilitator superfamily MFS_1  35.5 
 
 		 425 aa  178  2e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4387  major facilitator superfamily MFS_1  34.36 
 
 		 429 aa  177  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.591192  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02710  Major Facilitator Superfamily transporter  33.25 
 
 		 428 aa  177  4e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2779  major facilitator transporter  34.97 
 
 		 443 aa  176  6e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.617635  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1439  major facilitator superfamily MFS_1  35.93 
 
 		 426 aa  173  5e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0835777  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3224  major facilitator superfamily MFS_1  37.91 
 
 		 433 aa  170  6e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2979  major facilitator superfamily MFS_1  35.61 
 
 		 421 aa  164  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0876079  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0846  glycoside-Pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  30.05 
 
 		 416 aa  155  2e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03160  Na+/melibiose symporter-like transporter  32.88 
 
 		 419 aa  146  6e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1836  major facilitator transporter  31.34 
 
 		 440 aa  146  9e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.860837  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2955  major facilitator superfamily MFS_1  29.3 
 
 		 405 aa  105  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0454  major facilitator superfamily MFS_1  26.3 
 
 		 404 aa  104  4e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.1922  normal  0.684757 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2450  major facilitator superfamily MFS_1  30.21 
 
 		 407 aa  100  4e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.557384  normal  0.479748 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0892  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 424 aa  99.8  9e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.805867  normal  0.497197 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1832  glycoside-Pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  26.4 
 
 		 353 aa  99.4  1e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14174  predicted protein  25.63 
 
 		 405 aa  82.4  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0506  putative permease  23.56 
 
 		 210 aa  82.4  0.00000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1610  major facilitator transporter  25.91 
 
 		 404 aa  70.5  0.00000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1330  Na+/sugar symporter  27.2 
 
 		 545 aa  67.4  0.0000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0921  major facilitator transporter  24.81 
 
 		 402 aa  66.2  0.0000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2885  major facilitator transporter  26.58 
 
 		 432 aa  55.1  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00035649  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0523  major facilitator transporter  30.1 
 
 		 416 aa  54.7  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.78 
 
 		 478 aa  53.1  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45818  predicted protein  27.84 
 
 		 583 aa  53.1  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0729495  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0394  major facilitator transporter  26.88 
 
 		 414 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2323  transporter transmembrane protein  29.13 
 
 		 521 aa  50.8  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.13437 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2202  major facilitator transporter  31.67 
 
 		 551 aa  50.4  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000401875 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  27.1 
 
 		 387 aa  50.4  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0616  major facilitator superfamily MFS_1  21.86 
 
 		 443 aa  50.1  0.00008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0461422  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1693  major facilitator transporter  24.44 
 
 		 444 aa  49.7  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5122  major facilitator transporter  24.93 
 
 		 414 aa  50.1  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3161  major facilitator superfamily MFS_1  33 
 
 		 442 aa  49.3  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.586334 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4077  major facilitator superfamily MFS_1  28.24 
 
 		 574 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5072  major facilitator family transporter  26.15 
 
 		 425 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.348741  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0219  cis,cis-muconate transport protein MucK  30.29 
 
 		 427 aa  48.5  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2237  general substrate transporter  28.67 
 
 		 444 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0866984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0199  cis,cis-muconate transport protein MucK  30.29 
 
 		 427 aa  48.5  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.217293  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1176  major facilitator superfamily MFS_1  28.89 
 
 		 450 aa  48.5  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0522954 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1718  major facilitator transporter  25.18 
 
 		 406 aa  48.5  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.658229  hitchhiker  0.000872615 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3666  major facilitator transporter  28.67 
 
 		 444 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.262449 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5782  major facilitator superfamily MFS_1  25.41 
 
 		 454 aa  48.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0529  major facilitator superfamily drug efflux transporter  28.24 
 
 		 543 aa  48.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.794253 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0015  major facilitator superfamily MFS_1  26.88 
 
 		 456 aa  48.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.170297  normal  0.0989418 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4945  major facilitator transporter  25.57 
 
 		 414 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.395119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2305  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.32 
 
 		 613 aa  48.1  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.18 
 
 		 522 aa  48.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0759  major facilitator transporter  30.85 
 
 		 403 aa  48.1  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3378  major facilitator transporter  25.3 
 
 		 412 aa  47.8  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0191855  normal  0.504281 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3476  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  29.2 
 
 		 402 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0362049  normal  0.593625 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2910  major facilitator transporter  32.6 
 
 		 405 aa  47.4  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2063  major facilitator transporter  27.92 
 
 		 444 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.667333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2003  major facilitator transporter  30.83 
 
 		 530 aa  47.4  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1870  major facilitator transporter  31.67 
 
 		 531 aa  47  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2108  major facilitator transporter  31.67 
 
 		 531 aa  47  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.753085 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1925  major facilitator transporter  31.67 
 
 		 531 aa  47  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0993  major facilitator transporter  34.62 
 
 		 497 aa  47  0.0006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000427964  normal  0.0333525 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2233  general substrate transporter  28.48 
 
 		 444 aa  47  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.527639 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0798  transporter, putative  27.27 
 
 		 442 aa  47  0.0007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  36.59 
 
 		 477 aa  47  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1056  major facilitator transporter  25 
 
 		 406 aa  47  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1536  major facilitator transporter  25 
 
 		 406 aa  47  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1512  major facilitator transporter  25 
 
 		 406 aa  47  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075206 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  42.67 
 
 		 473 aa  46.6  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3702  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.15 
 
 		 509 aa  46.6  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4666  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.15 
 
 		 509 aa  46.6  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481677  normal  0.435005 
 
 
-
 
NC_003296  RS02152  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  36.99 
 
 		 407 aa  45.8  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0685  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.17 
 
 		 386 aa  46.2  0.001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0211006  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1776  major facilitator transporter  30.83 
 
 		 519 aa  46.6  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0516559  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0897  major facilitator superfamily MFS_1  34.65 
 
 		 447 aa  45.8  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0894914  normal  0.147269 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  32.14 
 
 		 455 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1673  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.74 
 
 		 530 aa  45.8  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.472299  hitchhiker  0.00171027 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1657  major facilitator transporter  29.66 
 
 		 518 aa  46.2  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4967  major facilitator transporter  26.12 
 
 		 440 aa  46.2  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.880384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2347  major facilitator transporter  30.83 
 
 		 551 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1874  major facilitator transporter  29.2 
 
 		 524 aa  45.8  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322942  normal  0.129685 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1403  major facilitator transporter  26 
 
 		 505 aa  46.2  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.206645  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2011  major facilitator superfamily MFS_1  30.83 
 
 		 551 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000990966  hitchhiker  0.000202625 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2336  major facilitator transporter  30.83 
 
 		 551 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2353  major facilitator transporter  26.47 
 
 		 529 aa  46.2  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.62279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2452  major facilitator transporter  30.83 
 
 		 551 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.41 
 
 		 468 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0962  major facilitator transporter  31.15 
 
 		 415 aa  46.2  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4676  major facilitator transporter  25.4 
 
 		 420 aa  45.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.573448  normal  0.215223 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1157  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.08 
 
 		 504 aa  45.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153598  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.19 
 
 		 485 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1458  major facilitator transporter  25.96 
 
 		 406 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.34861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2289  major facilitator superfamily MFS_1  29.84 
 
 		 483 aa  45.8  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4531  general substrate transporter  29.05 
 
 		 456 aa  45.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>