98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6833 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6833  transporter, major facilitator superfamily  100 
 
 		 423 aa  813    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.821608  normal  0.570568 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4281  major facilitator superfamily MFS_1  58.7 
 
 		 423 aa  457  1e-127  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.502977  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3224  major facilitator superfamily MFS_1  64.56 
 
 		 433 aa  436  1e-121  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0034  major facilitator superfamily MFS_1  52.18 
 
 		 435 aa  363  3e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3996  major facilitator transporter  48.91 
 
 		 438 aa  350  3e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0255  major facilitator transporter  46.14 
 
 		 440 aa  343  2.9999999999999997e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3775  major facilitator superfamily MFS_1  45.04 
 
 		 425 aa  305  8.000000000000001e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3554  major facilitator transporter  37.83 
 
 		 423 aa  267  2e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1439  major facilitator superfamily MFS_1  40.53 
 
 		 426 aa  247  3e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0835777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0806  major facilitator transporter  36.79 
 
 		 419 aa  223  7e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0427  major facilitator superfamily MFS_1  37.24 
 
 		 426 aa  220  3e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1988  major facilitator superfamily MFS_1  36.49 
 
 		 425 aa  207  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3267  major facilitator transporter  33.09 
 
 		 415 aa  188  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0780681  normal  0.364964 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02710  Major Facilitator Superfamily transporter  36.55 
 
 		 428 aa  181  1e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2979  major facilitator superfamily MFS_1  33.68 
 
 		 421 aa  170  4e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0876079  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4387  major facilitator superfamily MFS_1  34.59 
 
 		 429 aa  168  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.591192  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2779  major facilitator transporter  32.9 
 
 		 443 aa  159  9e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.617635  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03160  Na+/melibiose symporter-like transporter  34.73 
 
 		 419 aa  157  3e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2528  major facilitator superfamily MFS_1  31.35 
 
 		 451 aa  155  1e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0454  major facilitator superfamily MFS_1  32.4 
 
 		 404 aa  151  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.1922  normal  0.684757 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2534  major facilitator superfamily MFS_1  31.16 
 
 		 446 aa  151  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2955  major facilitator superfamily MFS_1  31.41 
 
 		 405 aa  135  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1836  major facilitator transporter  31.24 
 
 		 440 aa  132  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.860837  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0846  glycoside-Pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  29.18 
 
 		 416 aa  130  5.0000000000000004e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0892  major facilitator transporter  33.49 
 
 		 424 aa  129  9.000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.805867  normal  0.497197 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2450  major facilitator superfamily MFS_1  29.08 
 
 		 407 aa  124  3e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.557384  normal  0.479748 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0921  major facilitator transporter  27.84 
 
 		 402 aa  88.6  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1832  glycoside-Pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  25.89 
 
 		 353 aa  84.7  0.000000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14174  predicted protein  26.86 
 
 		 405 aa  84.7  0.000000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1330  Na+/sugar symporter  26.75 
 
 		 545 aa  80.5  0.00000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0506  putative permease  28.8 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1610  major facilitator transporter  27.96 
 
 		 404 aa  77.4  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45818  predicted protein  28.16 
 
 		 583 aa  59.7  0.00000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0729495  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  26.29 
 
 		 391 aa  58.5  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1877  major facilitator transporter  31.37 
 
 		 458 aa  56.6  0.0000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1089  major facilitator superfamily MFS_1  34.53 
 
 		 509 aa  55.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.339374  normal  0.270172 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1886  major facilitator transporter  34.68 
 
 		 501 aa  55.1  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.156331  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0684  quinolone resistence protein  23.92 
 
 		 506 aa  53.5  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00565548  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0950  major facilitator family transporter  23.92 
 
 		 400 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000143189  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0881  major facilitator family transporter  23.92 
 
 		 400 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19471e-35 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0744  major facilitator transporter  25.86 
 
 		 433 aa  52.4  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0364296  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0697  quinolone resistence protein NorA  23.92 
 
 		 506 aa  51.6  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000944811  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0841  major facilitator family transporter  23.68 
 
 		 400 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00299381  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5086  major facilitator superfamily MFS_1  23.21 
 
 		 457 aa  51.2  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0501179  normal  0.911731 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4495  major facilitator family transporter  23.68 
 
 		 400 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000363259  decreased coverage  0.0000000000000205787 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4087  major facilitator transporter  32 
 
 		 514 aa  50.8  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0879  major facilitator family transporter  23.68 
 
 		 400 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000268355  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0523  major facilitator transporter  29.57 
 
 		 416 aa  50.8  0.00005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0787  major facilitator family transporter  24.07 
 
 		 399 aa  50.4  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000257301  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0698  major facilitator transporter  23.68 
 
 		 447 aa  50.1  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0749  major facilitator family transporter  24.07 
 
 		 505 aa  49.7  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000682732  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2003  major facilitator transporter  28.38 
 
 		 530 aa  48.5  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2885  major facilitator transporter  26.56 
 
 		 432 aa  48.9  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00035649  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  35.59 
 
 		 394 aa  48.5  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1403  major facilitator transporter  28.06 
 
 		 505 aa  48.9  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.206645  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0287  major facilitator superfamily MFS_1  36.63 
 
 		 455 aa  48.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2011  major facilitator superfamily MFS_1  35.71 
 
 		 551 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000990966  hitchhiker  0.000202625 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2336  major facilitator transporter  35.71 
 
 		 551 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2465  major facilitator superfamily MFS_1  23.26 
 
 		 417 aa  48.1  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.18795  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2452  major facilitator transporter  35.71 
 
 		 551 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2738  major facilitator transporter  37.8 
 
 		 510 aa  48.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.934726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0599  transporter, putative  27.97 
 
 		 501 aa  47.8  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.870524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2347  major facilitator transporter  35.71 
 
 		 551 aa  47.8  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1500  major facilitator transporter  34.31 
 
 		 448 aa  47.4  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.21091 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0864  major facilitator transporter  27.72 
 
 		 441 aa  47.4  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2202  major facilitator transporter  36.59 
 
 		 551 aa  47.4  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000401875 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3953  major facilitator superfamily MFS_1  30.23 
 
 		 457 aa  47  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.210656 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1765  major facilitator transporter  22.47 
 
 		 376 aa  46.6  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2187  major facilitator transporter  30.53 
 
 		 502 aa  46.6  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0459  major facilitator superfamily MFS_1  32.63 
 
 		 503 aa  46.6  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.492782  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4524  major facilitator transporter  26.73 
 
 		 441 aa  46.6  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.281062  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1874  major facilitator transporter  35.8 
 
 		 524 aa  46.6  0.0009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322942  normal  0.129685 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1657  major facilitator transporter  35.23 
 
 		 518 aa  46.2  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1369  major facilitator superfamily MFS_1  30.53 
 
 		 521 aa  45.8  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.845322  normal  0.437127 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2223  major facilitator superfamily MFS_1  28.78 
 
 		 445 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00013617  hitchhiker  0.000156735 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.63 
 
 		 485 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  30.43 
 
 		 426 aa  46.2  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1702  major facilitator superfamily MFS_1  29.26 
 
 		 438 aa  46.2  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.101015  normal  0.0466104 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0427  transporter, putative  28.4 
 
 		 412 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0975  hypothetical protein  31.03 
 
 		 498 aa  46.2  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.798408  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2441  transporter, putative  32.14 
 
 		 453 aa  46.2  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0973262  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9283  major facilitator superfamily MFS_1  28.04 
 
 		 511 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.985351 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2614  major facilitator transporter  28.97 
 
 		 463 aa  45.1  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.106443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6139  major facilitator superfamily permease  31.07 
 
 		 426 aa  45.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1870  major facilitator transporter  35.71 
 
 		 531 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2108  major facilitator transporter  35.71 
 
 		 531 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.753085 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1925  major facilitator transporter  35.71 
 
 		 531 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1262  major facilitator transporter  31.85 
 
 		 421 aa  44.7  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0631224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01889  sugar transporter  32.18 
 
 		 493 aa  44.3  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.660327  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1387  major facilitator superfamily transport protein  34.92 
 
 		 468 aa  43.9  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0294045  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2458  transporter, putative  35.71 
 
 		 529 aa  43.9  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1015  major facilitator transporter  29.76 
 
 		 502 aa  43.9  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05075  putative sugar transporter  30.38 
 
 		 507 aa  43.9  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0544446  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1649  major facilitator superfamily MFS_1  31.67 
 
 		 425 aa  43.5  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2816  major facilitator superfamily protein  30 
 
 		 459 aa  43.5  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1919  major facilitator transporter  28.1 
 
 		 461 aa  43.5  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1862  major facilitator transporter  30.63 
 
 		 440 aa  43.1  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.144262  normal  0.586915 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0532  major facilitator superfamily MFS_1  33.66 
 
 		 428 aa  43.1  0.01  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>