42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1832 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_1832  glycoside-Pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  100 
 
 		 353 aa  701    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0846  glycoside-Pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  66.06 
 
 		 416 aa  455  1e-127  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02710  Major Facilitator Superfamily transporter  30.46 
 
 		 428 aa  142  7e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2979  major facilitator superfamily MFS_1  36.61 
 
 		 421 aa  138  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0876079  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0506  putative permease  47.58 
 
 		 210 aa  113  5e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0427  major facilitator superfamily MFS_1  26.4 
 
 		 426 aa  99.4  9e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1988  major facilitator superfamily MFS_1  25.84 
 
 		 425 aa  94.4  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1330  Na+/sugar symporter  28.68 
 
 		 545 aa  92  1e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3996  major facilitator transporter  30.34 
 
 		 438 aa  90.1  6e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0255  major facilitator transporter  34.19 
 
 		 440 aa  89.4  9e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0034  major facilitator superfamily MFS_1  23.79 
 
 		 435 aa  83.2  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3554  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 423 aa  82.8  0.000000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03160  Na+/melibiose symporter-like transporter  27.49 
 
 		 419 aa  75.9  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1439  major facilitator superfamily MFS_1  24.83 
 
 		 426 aa  74.3  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0835777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2534  major facilitator superfamily MFS_1  25.51 
 
 		 446 aa  71.6  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3775  major facilitator superfamily MFS_1  30.89 
 
 		 425 aa  71.2  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0806  major facilitator transporter  26.82 
 
 		 419 aa  68.2  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4281  major facilitator superfamily MFS_1  25.37 
 
 		 423 aa  67.4  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.502977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3267  major facilitator transporter  22.98 
 
 		 415 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0780681  normal  0.364964 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4387  major facilitator superfamily MFS_1  24.62 
 
 		 429 aa  65.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.591192  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2528  major facilitator superfamily MFS_1  25.31 
 
 		 451 aa  63.2  0.000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6833  transporter, major facilitator superfamily  25.35 
 
 		 423 aa  60.8  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.821608  normal  0.570568 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14174  predicted protein  24.59 
 
 		 405 aa  58.5  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0892  major facilitator transporter  24.91 
 
 		 424 aa  55.1  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.805867  normal  0.497197 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1610  major facilitator transporter  32.32 
 
 		 404 aa  50.1  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3224  major facilitator superfamily MFS_1  26.13 
 
 		 433 aa  48.1  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0454  major facilitator superfamily MFS_1  20.82 
 
 		 404 aa  48.1  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.1922  normal  0.684757 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2594  major facilitator transporter  26.69 
 
 		 395 aa  48.5  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1886  major facilitator transporter  24.73 
 
 		 501 aa  48.1  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.156331  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2738  major facilitator transporter  25.49 
 
 		 510 aa  47  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.934726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1278  citrate-proton symport  26.47 
 
 		 456 aa  46.2  0.0009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.258621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2955  major facilitator superfamily MFS_1  23.38 
 
 		 405 aa  45.4  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1469  major facilitator family transporter  27.21 
 
 		 438 aa  45.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0457955  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0921  major facilitator transporter  28.79 
 
 		 402 aa  45.1  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3149  major facilitator superfamily MFS_1  24.71 
 
 		 460 aa  44.7  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0199  cis,cis-muconate transport protein MucK  24.34 
 
 		 427 aa  44.7  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.217293  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1015  general substrate transporter  25.74 
 
 		 438 aa  44.7  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0219  cis,cis-muconate transport protein MucK  24.63 
 
 		 427 aa  43.9  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3944  major facilitator transporter  25.66 
 
 		 401 aa  43.5  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0894  putative GPH family sugar transporter  25.86 
 
 		 451 aa  43.1  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.351001  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2906  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  29.59 
 
 		 460 aa  42.7  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1599  major facilitator transporter  24.48 
 
 		 421 aa  42.7  0.01  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>