169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1599 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_1599  major facilitator transporter  100 
 
 		 421 aa  816    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0523  major facilitator transporter  56.65 
 
 		 416 aa  438  9.999999999999999e-123  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0200  major facilitator superfamily MFS_1  41.24 
 
 		 415 aa  303  5.000000000000001e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1406  major facilitator transporter  42.13 
 
 		 401 aa  290  4e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000773977  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2885  major facilitator transporter  33.72 
 
 		 432 aa  237  2e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00035649  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0798  transporter, putative  33.96 
 
 		 442 aa  228  2e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4675  major facilitator superfamily MFS_1  29.27 
 
 		 411 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3289  major facilitator superfamily MFS_1  26.87 
 
 		 416 aa  77.4  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01510  conserved hypothetical protein  27.51 
 
 		 459 aa  72  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0654  major facilitator transporter  25.97 
 
 		 399 aa  70.5  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0842351 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0146  major facilitator superfamily MFS_1  26.34 
 
 		 414 aa  70.5  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.243784  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02710  Major Facilitator Superfamily transporter  25.07 
 
 		 428 aa  70.1  0.00000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1500  major facilitator transporter  23.16 
 
 		 448 aa  68.9  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.21091 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2622  sugar transporter, glycoside-pentoside-hexuronide  33.78 
 
 		 479 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.455215  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0616  major facilitator superfamily MFS_1  24.61 
 
 		 443 aa  67.4  0.0000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0461422  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0041  major facilitator superfamily permease  26.29 
 
 		 471 aa  67.4  0.0000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000141077  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1015  major facilitator transporter  24.41 
 
 		 502 aa  67  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0975  hypothetical protein  27.23 
 
 		 498 aa  67  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.798408  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1886  major facilitator transporter  27.88 
 
 		 501 aa  66.6  0.0000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.156331  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5086  major facilitator superfamily MFS_1  25.4 
 
 		 457 aa  66.2  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0501179  normal  0.911731 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2049  Na+/melibiose symporter and related transporters-like protein  26.42 
 
 		 469 aa  65.9  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal  0.648168 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2011  major facilitator superfamily MFS_1  26.29 
 
 		 551 aa  65.5  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000990966  hitchhiker  0.000202625 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2347  major facilitator transporter  26.29 
 
 		 551 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2336  major facilitator transporter  26.29 
 
 		 551 aa  65.5  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2452  major facilitator transporter  26.29 
 
 		 551 aa  65.5  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2187  major facilitator transporter  29.14 
 
 		 502 aa  64.3  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2003  major facilitator transporter  26.49 
 
 		 530 aa  63.9  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2202  major facilitator transporter  25.84 
 
 		 551 aa  63.9  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000401875 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4087  major facilitator transporter  28.48 
 
 		 514 aa  63.5  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3149  major facilitator superfamily MFS_1  32.37 
 
 		 460 aa  63.2  0.000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1870  major facilitator transporter  26.49 
 
 		 531 aa  62.8  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2108  major facilitator transporter  26.49 
 
 		 531 aa  62.8  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.753085 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1776  major facilitator transporter  25.83 
 
 		 519 aa  62.8  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0516559  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1925  major facilitator transporter  26.49 
 
 		 531 aa  62.8  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3738  hypothetical protein  25.6 
 
 		 467 aa  61.6  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00183877  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01889  sugar transporter  24.47 
 
 		 493 aa  62  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.660327  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0729  major facilitator transporter  25.47 
 
 		 420 aa  62  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.463384  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1865  major facilitator transporter  26.57 
 
 		 401 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.418414  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02289  sucrose transporter, putative (Eurofung)  25.43 
 
 		 635 aa  60.8  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1657  major facilitator transporter  26.17 
 
 		 518 aa  60.8  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0999  major facilitator transporter  24.67 
 
 		 390 aa  60.5  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0123393 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1874  major facilitator transporter  27.52 
 
 		 524 aa  60.1  0.00000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322942  normal  0.129685 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0892  major facilitator transporter  27.24 
 
 		 424 aa  59.3  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.805867  normal  0.497197 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1403  major facilitator transporter  25.1 
 
 		 505 aa  59.3  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.206645  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2458  transporter, putative  25.83 
 
 		 529 aa  58.5  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3858  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  21.71 
 
 		 469 aa  58.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.784369  normal  0.0678057 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2738  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 510 aa  58.5  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.934726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1831  major facilitator transporter  26.3 
 
 		 430 aa  58.5  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.612991  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05075  putative sugar transporter  27.91 
 
 		 507 aa  58.2  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0544446  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0864  major facilitator transporter  27.21 
 
 		 441 aa  58.2  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0599  transporter, putative  26.49 
 
 		 501 aa  58.2  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.870524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1071  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  26.02 
 
 		 445 aa  57  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3264  hypothetical protein  24.28 
 
 		 408 aa  57  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2528  major facilitator superfamily MFS_1  26.77 
 
 		 451 aa  56.2  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1330  Na+/sugar symporter  23.63 
 
 		 545 aa  55.8  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3939  major facilitator superfamily MFS_1  27.92 
 
 		 407 aa  55.5  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4367  major facilitator transporter  24.12 
 
 		 493 aa  55.1  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2284  putative cation symporter  34.88 
 
 		 461 aa  54.3  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974122 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0846  glycoside-Pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  21.92 
 
 		 416 aa  54.3  0.000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0084  major facilitator transporter  22.28 
 
 		 461 aa  54.3  0.000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380135  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0575  major facilitator transporter  26.18 
 
 		 461 aa  54.3  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2744  major facilitator family transporter  24.48 
 
 		 393 aa  53.9  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0893  major facilitator superfamily permease  27.92 
 
 		 450 aa  53.5  0.000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1406  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  26.34 
 
 		 471 aa  53.5  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.455319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0994  major facilitator superfamily permease  27.92 
 
 		 450 aa  53.1  0.000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.211502  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2335  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  21.9 
 
 		 476 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0805  major facilitator family transporter  24.41 
 
 		 417 aa  52.4  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.03228  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2441  transporter, putative  25.84 
 
 		 453 aa  52.4  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0973262  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2315  hypothetical protein  27.46 
 
 		 511 aa  51.6  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.276879  normal  0.0219591 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0682  major facilitator superfamily MFS_1  27.87 
 
 		 397 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0873  major facilitator superfamily MFS_1  25.43 
 
 		 398 aa  51.6  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3868  sugar transporter  27.92 
 
 		 450 aa  51.6  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1614  major facilitator transporter  23.87 
 
 		 448 aa  51.2  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000115723  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_709  permease of the major facilitator superfamily  24.17 
 
 		 420 aa  51.2  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.768296  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3985  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  33.33 
 
 		 476 aa  50.8  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.439786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4415  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  29.41 
 
 		 552 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4479  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  29.41 
 
 		 552 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.176062 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1474  putative permease  23.04 
 
 		 432 aa  50.8  0.00005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  28.73 
 
 		 424 aa  50.8  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0137  major facilitator transporter  27.43 
 
 		 386 aa  50.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0342299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3497  major facilitator transporter  25.12 
 
 		 399 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.405337  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2069  major facilitator superfamily MFS_1  27.31 
 
 		 432 aa  50.1  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350858  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0571  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  23.03 
 
 		 457 aa  50.1  0.00008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.74034  normal  0.0218606 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14174  predicted protein  22.6 
 
 		 405 aa  50.1  0.00008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0427  major facilitator superfamily MFS_1  25.85 
 
 		 426 aa  49.7  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1832  glycoside-Pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  24.48 
 
 		 353 aa  49.3  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0898  major facilitator superfamily permease  23.58 
 
 		 454 aa  49.3  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.880726  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  30.39 
 
 		 423 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1019  major facilitator transporter  27.18 
 
 		 500 aa  49.7  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2191  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  27.1 
 
 		 445 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0290  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  23.65 
 
 		 472 aa  49.3  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000222424  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  29.41 
 
 		 423 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0907  Na+/melibiose symporter and related transporters-like  33.77 
 
 		 538 aa  48.9  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000225717  decreased coverage  0.000000181101 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1354  multidrug-efflux transporter  24.47 
 
 		 370 aa  48.9  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3032  major facilitator transporter  28.19 
 
 		 428 aa  48.5  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0832  major facilitator superfamily permease  25.95 
 
 		 453 aa  48.9  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000561592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0053  major facilitator transporter  24.85 
 
 		 449 aa  48.5  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000090495  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0454  major facilitator superfamily MFS_1  31.53 
 
 		 404 aa  48.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.1922  normal  0.684757 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2095  GPH family sugar transporter  27.35 
 
 		 442 aa  48.1  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1619  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  47.83 
 
 		 436 aa  48.1  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>