137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2979 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2979  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 421 aa  811    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0876079  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02710  Major Facilitator Superfamily transporter  51.52 
 
 		 428 aa  404  1e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0846  glycoside-Pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  36.41 
 
 		 416 aa  198  1.0000000000000001e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3775  major facilitator superfamily MFS_1  37.33 
 
 		 425 aa  180  4.999999999999999e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3996  major facilitator transporter  35.47 
 
 		 438 aa  177  4e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1988  major facilitator superfamily MFS_1  35.36 
 
 		 425 aa  173  5.999999999999999e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0034  major facilitator superfamily MFS_1  34.3 
 
 		 435 aa  172  6.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0427  major facilitator superfamily MFS_1  35.73 
 
 		 426 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4281  major facilitator superfamily MFS_1  32.48 
 
 		 423 aa  165  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.502977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3554  major facilitator transporter  36.2 
 
 		 423 aa  160  4e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1832  glycoside-Pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  36.61 
 
 		 353 aa  151  2e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0806  major facilitator transporter  33.16 
 
 		 419 aa  151  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1439  major facilitator superfamily MFS_1  34.34 
 
 		 426 aa  149  8e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0835777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6833  transporter, major facilitator superfamily  33.08 
 
 		 423 aa  147  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.821608  normal  0.570568 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3267  major facilitator transporter  30.86 
 
 		 415 aa  144  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0780681  normal  0.364964 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0255  major facilitator transporter  31.22 
 
 		 440 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03160  Na+/melibiose symporter-like transporter  31.07 
 
 		 419 aa  133  6e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0454  major facilitator superfamily MFS_1  28.67 
 
 		 404 aa  131  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.1922  normal  0.684757 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0506  putative permease  36.36 
 
 		 210 aa  131  3e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2528  major facilitator superfamily MFS_1  30.48 
 
 		 451 aa  127  4.0000000000000003e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2955  major facilitator superfamily MFS_1  29.9 
 
 		 405 aa  124  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3224  major facilitator superfamily MFS_1  30.89 
 
 		 433 aa  120  6e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2779  major facilitator transporter  29.48 
 
 		 443 aa  119  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.617635  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4387  major facilitator superfamily MFS_1  29.94 
 
 		 429 aa  110  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.591192  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2534  major facilitator superfamily MFS_1  31.75 
 
 		 446 aa  104  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2450  major facilitator superfamily MFS_1  28.04 
 
 		 407 aa  99  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.557384  normal  0.479748 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0892  major facilitator transporter  31.4 
 
 		 424 aa  96.3  8e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.805867  normal  0.497197 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0921  major facilitator transporter  27.3 
 
 		 402 aa  93.6  5e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1330  Na+/sugar symporter  28.25 
 
 		 545 aa  89  1e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1610  major facilitator transporter  29.33 
 
 		 404 aa  84.3  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1836  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 440 aa  76.6  0.0000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.860837  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0616  major facilitator superfamily MFS_1  25.33 
 
 		 443 aa  73.6  0.000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0461422  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14174  predicted protein  28.05 
 
 		 405 aa  73.2  0.000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1865  major facilitator transporter  28.84 
 
 		 401 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.418414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0827  major facilitator transporter  28.06 
 
 		 406 aa  56.6  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0216762 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3149  major facilitator superfamily MFS_1  36.19 
 
 		 460 aa  51.2  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2580  major facilitator transporter  25.69 
 
 		 398 aa  51.6  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0171602  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1271  major facilitator transporter  26.11 
 
 		 403 aa  50.8  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.879022 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3497  major facilitator transporter  26.98 
 
 		 399 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.405337  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2241  major facilitator family transporter  26.78 
 
 		 418 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113649  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2396  oxalate:formate antiporter, putative  27.04 
 
 		 400 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.429266  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 435 aa  50.1  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5039  major facilitator transporter  32.03 
 
 		 410 aa  49.3  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.582294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0523  major facilitator transporter  36.63 
 
 		 416 aa  49.3  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0729  major facilitator transporter  26.95 
 
 		 420 aa  48.5  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.463384  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2454  major facilitator transporter  24.61 
 
 		 389 aa  48.5  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4939  major facilitator transporter  25.06 
 
 		 414 aa  48.9  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30660  sugar phosphate permease  31.69 
 
 		 466 aa  48.5  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.488584  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0975  hypothetical protein  23.47 
 
 		 498 aa  48.1  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.798408  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1877  major facilitator transporter  31.78 
 
 		 458 aa  47.8  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1264  major facilitator transporter  26.63 
 
 		 411 aa  48.1  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1056  major facilitator transporter  26.37 
 
 		 396 aa  47.8  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0999083  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2885  major facilitator transporter  21.51 
 
 		 432 aa  48.1  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00035649  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0864  major facilitator transporter  32.69 
 
 		 441 aa  48.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5381  phosphoglycerate transporter family protein  26.16 
 
 		 444 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5109  phosphoglycerate transporter family protein  26.16 
 
 		 444 aa  47.8  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2428  oxalate:formate antiporter (permease)  26.33 
 
 		 402 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.739048  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5500  phosphoglycerate transporter family protein  26.16 
 
 		 444 aa  47.8  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3462  major facilitator transporter  27.05 
 
 		 412 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5573  phosphoglycerate transporter family protein  25.81 
 
 		 444 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5124  major facilitator transporter  30.57 
 
 		 432 aa  47.4  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0473861 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2203  oxalate:formate antiporter  25.32 
 
 		 400 aa  47  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.111639  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0601  major facilitator superfamily MFS_1  22.7 
 
 		 406 aa  47  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2367  oxalate:formate antiporter  25.32 
 
 		 400 aa  47  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.880003  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0805  major facilitator family transporter  26.35 
 
 		 417 aa  47  0.0007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.03228  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5375  phosphoglycerate transporter family protein  26.16 
 
 		 444 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5429  phosphoglycerate transporter family protein  26.16 
 
 		 444 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2718  oxalate:formate antiporter, putative  27 
 
 		 402 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00584048  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2142  oxalate/formate antiporter  25.32 
 
 		 400 aa  46.2  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0401795  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4940  glycerol-3-phosphate transporter  25.81 
 
 		 444 aa  45.8  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2126  oxalate/formate antiporter  25.32 
 
 		 400 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0875766  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4955  glycerol-3-phosphate transporter  25.45 
 
 		 444 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20220  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.69 
 
 		 415 aa  46.2  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.179817 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5349  phosphoglycerate transporter family protein  25.45 
 
 		 444 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2385  putative oxalate:formate antiporter  25.32 
 
 		 400 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06480  Na+/melibiose symporter-like transporter  21.01 
 
 		 460 aa  46.2  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.610657  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3242  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 401 aa  46.2  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2459  major facilitator transporter  27.33 
 
 		 402 aa  45.8  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0169362  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2607  putative oxalate:formate antiporter  27 
 
 		 402 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000121238 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2753  major facilitator superfamily MFS_1  35.77 
 
 		 397 aa  46.6  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45818  predicted protein  28.12 
 
 		 583 aa  46.2  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0729495  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2703  putative oxalate:formate antiporter  27 
 
 		 402 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2495  oxalate:formate antiporter  26.35 
 
 		 402 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116022  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2737  hypothetical protein  30.08 
 
 		 435 aa  45.1  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.55543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2680  oxalate:formate antiporter  26.35 
 
 		 402 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1500  major facilitator transporter  23.6 
 
 		 448 aa  45.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.21091 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0169  major facilitator superfamily permease  26.6 
 
 		 411 aa  45.8  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1982  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.71 
 
 		 416 aa  45.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3790  phosphoglycerate transporter  24.63 
 
 		 446 aa  45.4  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0647  general substrate transporter  29.74 
 
 		 552 aa  45.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.170091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2993  putative oxalate:formate antiporter  25.32 
 
 		 400 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0223405  normal  0.0497096 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2576  general substrate transporter  30.26 
 
 		 552 aa  45.8  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.598337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3204  major facilitator transporter  26.99 
 
 		 401 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2315  hypothetical protein  32.56 
 
 		 511 aa  45.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.276879  normal  0.0219591 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2025  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25 
 
 		 526 aa  45.1  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2456  oxalate/formate antiporter (permease)  26.33 
 
 		 402 aa  45.1  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001991  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3381  major facilitator transporter  28.89 
 
 		 466 aa  44.7  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06902  hypothetical protein  27.75 
 
 		 495 aa  44.7  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0557  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.68 
 
 		 526 aa  44.7  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2746  putative oxalate:formate antiporter  26.33 
 
 		 402 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000311684  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>