64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0255 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0255  major facilitator transporter  100 
 
 		 440 aa  857    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3996  major facilitator transporter  50.12 
 
 		 438 aa  367  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3775  major facilitator superfamily MFS_1  46.47 
 
 		 425 aa  338  9.999999999999999e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4281  major facilitator superfamily MFS_1  47.95 
 
 		 423 aa  324  2e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.502977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6833  transporter, major facilitator superfamily  45.68 
 
 		 423 aa  322  6e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.821608  normal  0.570568 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0034  major facilitator superfamily MFS_1  47.76 
 
 		 435 aa  311  2e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3224  major facilitator superfamily MFS_1  45.92 
 
 		 433 aa  290  5.0000000000000004e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3554  major facilitator transporter  36.83 
 
 		 423 aa  243  5e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1988  major facilitator superfamily MFS_1  38.13 
 
 		 425 aa  231  2e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0427  major facilitator superfamily MFS_1  36.94 
 
 		 426 aa  222  9.999999999999999e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0806  major facilitator transporter  34.86 
 
 		 419 aa  213  3.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3267  major facilitator transporter  32.15 
 
 		 415 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0780681  normal  0.364964 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1439  major facilitator superfamily MFS_1  32.96 
 
 		 426 aa  193  6e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0835777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2779  major facilitator transporter  32.11 
 
 		 443 aa  160  4e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.617635  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02710  Major Facilitator Superfamily transporter  33.08 
 
 		 428 aa  154  4e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2528  major facilitator superfamily MFS_1  28.05 
 
 		 451 aa  151  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2979  major facilitator superfamily MFS_1  31.22 
 
 		 421 aa  148  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0876079  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2534  major facilitator superfamily MFS_1  30.59 
 
 		 446 aa  147  5e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03160  Na+/melibiose symporter-like transporter  33.6 
 
 		 419 aa  144  3e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4387  major facilitator superfamily MFS_1  34.69 
 
 		 429 aa  144  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.591192  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1836  major facilitator transporter  28.92 
 
 		 440 aa  140  4.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.860837  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2450  major facilitator superfamily MFS_1  30.67 
 
 		 407 aa  138  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.557384  normal  0.479748 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0454  major facilitator superfamily MFS_1  29.65 
 
 		 404 aa  130  6e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.1922  normal  0.684757 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0846  glycoside-Pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  28.41 
 
 		 416 aa  126  7e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2955  major facilitator superfamily MFS_1  30.19 
 
 		 405 aa  121  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0892  major facilitator transporter  31.96 
 
 		 424 aa  112  1.0000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.805867  normal  0.497197 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1832  glycoside-Pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  34.19 
 
 		 353 aa  110  5e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0921  major facilitator transporter  25.41 
 
 		 402 aa  81.3  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1610  major facilitator transporter  25.93 
 
 		 404 aa  80.5  0.00000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0506  putative permease  29.95 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14174  predicted protein  26.4 
 
 		 405 aa  77.4  0.0000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1330  Na+/sugar symporter  23.75 
 
 		 545 aa  68.2  0.0000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0898  major facilitator superfamily permease  23.92 
 
 		 454 aa  60.1  0.00000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.880726  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45818  predicted protein  28.57 
 
 		 583 aa  55.1  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0729495  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0710  major facilitator superfamily MFS_1  24 
 
 		 404 aa  50.8  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2885  major facilitator transporter  28.7 
 
 		 432 aa  49.7  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00035649  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0170  major facilitator superfamily MFS_1  33.59 
 
 		 452 aa  48.9  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0084  major facilitator transporter  20.39 
 
 		 461 aa  48.1  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380135  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3149  major facilitator superfamily MFS_1  38.95 
 
 		 460 aa  48.5  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2738  major facilitator transporter  32.04 
 
 		 510 aa  47.8  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.934726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5803  major facilitator transporter  29.17 
 
 		 430 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2231  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 		 443 aa  47.4  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.495487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5057  major facilitator transporter  29.17 
 
 		 430 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.195392  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2358  major facilitator superfamily MFS_1  31.07 
 
 		 439 aa  46.6  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1369  major facilitator superfamily MFS_1  26.96 
 
 		 521 aa  45.8  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.845322  normal  0.437127 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1056  major facilitator transporter  34.62 
 
 		 396 aa  45.8  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0999083  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1176  major facilitator superfamily MFS_1  29.66 
 
 		 450 aa  45.1  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0522954 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1116  major facilitator superfamily MFS_1  29.17 
 
 		 430 aa  44.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3587  multidrug efflux system protein MdtL  35.58 
 
 		 396 aa  44.7  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.6 
 
 		 525 aa  44.3  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3922  major facilitator transporter  37.27 
 
 		 444 aa  44.3  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0300  nitrite extrusion protein  32.29 
 
 		 895 aa  44.3  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.129473  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4376  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 430 aa  44.7  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2890  nitrite transporter  32.29 
 
 		 912 aa  44.7  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1403  major facilitator transporter  31.65 
 
 		 505 aa  44.7  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.206645  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1877  major facilitator transporter  29.27 
 
 		 458 aa  44.3  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1290  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.71 
 
 		 477 aa  43.9  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5086  major facilitator superfamily MFS_1  21.45 
 
 		 457 aa  43.5  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0501179  normal  0.911731 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3953  major facilitator superfamily MFS_1  29.93 
 
 		 457 aa  43.5  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.210656 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.28 
 
 		 485 aa  43.5  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.68 
 
 		 478 aa  43.5  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  26.96 
 
 		 415 aa  43.1  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1063  major facilitator transporter  24.49 
 
 		 407 aa  43.1  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4021  multidrug efflux system protein MdtL  35.58 
 
 		 396 aa  43.1  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>