106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3775 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3775  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
425 aa  830    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3996  major facilitator transporter  67.79 
 
 
438 aa  525  1e-148  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0255  major facilitator transporter  46.47 
 
 
440 aa  333  3e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0034  major facilitator superfamily MFS_1  45.69 
 
 
435 aa  315  9.999999999999999e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4281  major facilitator superfamily MFS_1  47.94 
 
 
423 aa  315  9.999999999999999e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.502977  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6833  transporter, major facilitator superfamily  45.04 
 
 
423 aa  278  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.821608  normal  0.570568 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3224  major facilitator superfamily MFS_1  44.58 
 
 
433 aa  269  8.999999999999999e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3554  major facilitator transporter  38.41 
 
 
423 aa  249  9e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1439  major facilitator superfamily MFS_1  37.53 
 
 
426 aa  224  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0835777  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1988  major facilitator superfamily MFS_1  35.62 
 
 
425 aa  202  9.999999999999999e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0806  major facilitator transporter  35.18 
 
 
419 aa  197  4.0000000000000005e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0427  major facilitator superfamily MFS_1  35.5 
 
 
426 aa  189  8e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2979  major facilitator superfamily MFS_1  37.77 
 
 
421 aa  189  9e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0876079  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2779  major facilitator transporter  36.41 
 
 
443 aa  183  6e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.617635  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02710  Major Facilitator Superfamily transporter  33.69 
 
 
428 aa  179  5.999999999999999e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199882  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3267  major facilitator transporter  31.07 
 
 
415 aa  163  6e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0780681  normal  0.364964 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03160  Na+/melibiose symporter-like transporter  35.62 
 
 
419 aa  159  9e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2528  major facilitator superfamily MFS_1  28.38 
 
 
451 aa  154  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2534  major facilitator superfamily MFS_1  29.37 
 
 
446 aa  142  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4387  major facilitator superfamily MFS_1  31.83 
 
 
429 aa  140  4.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.591192  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0454  major facilitator superfamily MFS_1  32.73 
 
 
404 aa  134  3e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.1922  normal  0.684757 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1836  major facilitator transporter  32.22 
 
 
440 aa  133  6e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.860837  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0892  major facilitator transporter  33.87 
 
 
424 aa  132  2.0000000000000002e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.805867  normal  0.497197 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0846  glycoside-Pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  28.68 
 
 
416 aa  131  3e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2450  major facilitator superfamily MFS_1  28.83 
 
 
407 aa  117  5e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.557384  normal  0.479748 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2955  major facilitator superfamily MFS_1  29.31 
 
 
405 aa  114  4.0000000000000004e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1610  major facilitator transporter  31.29 
 
 
404 aa  105  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0921  major facilitator transporter  30.52 
 
 
402 aa  87.4  5e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14174  predicted protein  27.95 
 
 
405 aa  85.9  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1832  glycoside-Pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  31.27 
 
 
353 aa  84.7  0.000000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0506  putative permease  30.33 
 
 
210 aa  84  0.000000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1330  Na+/sugar symporter  25.13 
 
 
545 aa  82.8  0.00000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1877  major facilitator transporter  36.36 
 
 
458 aa  69.3  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0616  major facilitator superfamily MFS_1  24.35 
 
 
443 aa  65.5  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0461422  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5086  major facilitator superfamily MFS_1  23.25 
 
 
457 aa  61.2  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0501179  normal  0.911731 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2885  major facilitator transporter  22.62 
 
 
432 aa  60.1  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00035649  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3953  major facilitator superfamily MFS_1  32.11 
 
 
457 aa  59.3  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.210656 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02413  sugar transporter  33.11 
 
 
443 aa  58.2  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45818  predicted protein  26.32 
 
 
583 aa  58.2  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0729495  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0084  major facilitator transporter  22.88 
 
 
461 aa  57.8  0.0000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380135  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01240  sugar transporter  36.08 
 
 
428 aa  57  0.0000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.686511  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0975  hypothetical protein  34.15 
 
 
498 aa  56.2  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.798408  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1403  major facilitator transporter  32.69 
 
 
505 aa  54.3  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.206645  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0523  major facilitator transporter  32.12 
 
 
416 aa  53.9  0.000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0864  major facilitator transporter  36.08 
 
 
441 aa  53.9  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2003  major facilitator transporter  37.97 
 
 
530 aa  52  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05075  putative sugar transporter  30.47 
 
 
507 aa  51.2  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0544446  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1657  major facilitator transporter  30.3 
 
 
518 aa  51.2  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1015  major facilitator transporter  35.29 
 
 
502 aa  50.8  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1314  Na+/xyloside symporter related transporter  22.67 
 
 
470 aa  50.4  0.00006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.313105  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0599  transporter, putative  35.29 
 
 
501 aa  50.1  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.870524  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0898  major facilitator superfamily permease  22.86 
 
 
454 aa  50.1  0.00008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.880726  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3149  major facilitator superfamily MFS_1  40.28 
 
 
460 aa  50.1  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0733  sodium:glactoside symporter family protein  33.33 
 
 
465 aa  48.9  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.958172  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2738  major facilitator transporter  36.71 
 
 
510 aa  48.5  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.934726  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0893  major facilitator superfamily permease  22.31 
 
 
450 aa  48.5  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  24.79 
 
 
391 aa  48.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  25.75 
 
 
435 aa  48.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01889  sugar transporter  31.75 
 
 
493 aa  47.4  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.660327  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1406  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  24.05 
 
 
471 aa  47.8  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.455319  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0682  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
397 aa  47.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260378  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1886  major facilitator transporter  32.5 
 
 
501 aa  47  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.156331  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1776  major facilitator transporter  27.56 
 
 
519 aa  47  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0516559  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2347  major facilitator transporter  26.77 
 
 
551 aa  47  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2452  major facilitator transporter  26.77 
 
 
551 aa  47  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2011  major facilitator superfamily MFS_1  26.77 
 
 
551 aa  47  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000990966  hitchhiker  0.000202625 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0053  major facilitator transporter  23.18 
 
 
449 aa  47  0.0007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000090495  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2336  major facilitator transporter  26.77 
 
 
551 aa  46.6  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2187  major facilitator transporter  26.45 
 
 
502 aa  46.6  0.0009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  23.24 
 
 
381 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1875  major facilitator transporter  30.14 
 
 
459 aa  46.2  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.473892  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1925  major facilitator transporter  28.46 
 
 
531 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1997  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  32.98 
 
 
477 aa  45.8  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4087  major facilitator transporter  27.56 
 
 
514 aa  46.2  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0827  major facilitator transporter  25.21 
 
 
406 aa  45.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0216762 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1500  major facilitator transporter  30.47 
 
 
448 aa  45.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.21091 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1870  major facilitator transporter  26.77 
 
 
531 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2108  major facilitator transporter  26.77 
 
 
531 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.753085 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0994  major facilitator superfamily permease  23.76 
 
 
450 aa  45.1  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.211502  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1614  major facilitator transporter  24.49 
 
 
448 aa  45.1  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000115723  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1592  major facilitator superfamily MFS_1  28.62 
 
 
435 aa  45.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.241693  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2241  major facilitator family transporter  24.75 
 
 
418 aa  45.1  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113649  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2799  major facilitator transporter  33.98 
 
 
407 aa  44.7  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3587  multidrug efflux system protein MdtL  34.45 
 
 
396 aa  44.7  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2049  Na+/melibiose symporter and related transporters-like protein  29.81 
 
 
469 aa  44.7  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal  0.648168 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1089  major facilitator superfamily MFS_1  28.1 
 
 
509 aa  45.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.339374  normal  0.270172 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3004  major facilitator transporter  25 
 
 
421 aa  44.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.42057 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2748  major facilitator transporter  38.24 
 
 
514 aa  44.7  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0813  major facilitator superfamily MFS_1  22.87 
 
 
397 aa  44.3  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2454  major facilitator superfamily MFS_1  31.53 
 
 
490 aa  44.3  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162879  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2246  Na+/xyloside symporter related transporter  29.51 
 
 
462 aa  43.9  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4939  major facilitator transporter  24.19 
 
 
414 aa  43.9  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2202  major facilitator transporter  27.56 
 
 
551 aa  44.3  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000401875 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1874  major facilitator transporter  31.65 
 
 
524 aa  43.5  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322942  normal  0.129685 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3017  major facilitator superfamily MFS_1  38.24 
 
 
513 aa  43.9  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.227562  normal  0.425104 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1505  transporter, putative  36.76 
 
 
514 aa  43.5  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2458  transporter, putative  26.77 
 
 
529 aa  43.5  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4607  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.77 
 
 
522 aa  43.5  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15231  GPH family sugar transporter  30.09 
 
 
448 aa  43.5  0.008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0459  major facilitator superfamily MFS_1  27.03 
 
 
503 aa  43.1  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.492782  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>