184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_02710 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_02710  Major Facilitator Superfamily transporter  100 
 
 		 428 aa  824    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2979  major facilitator superfamily MFS_1  51.52 
 
 		 421 aa  391  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0876079  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0846  glycoside-Pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  31.96 
 
 		 416 aa  198  1.0000000000000001e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1988  major facilitator superfamily MFS_1  36.04 
 
 		 425 aa  196  5.000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0427  major facilitator superfamily MFS_1  33.25 
 
 		 426 aa  177  4e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0034  major facilitator superfamily MFS_1  35.37 
 
 		 435 aa  173  3.9999999999999995e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3996  major facilitator transporter  33.77 
 
 		 438 aa  167  4e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3775  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 		 425 aa  157  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4281  major facilitator superfamily MFS_1  33.78 
 
 		 423 aa  151  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.502977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6833  transporter, major facilitator superfamily  35.51 
 
 		 423 aa  149  8e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.821608  normal  0.570568 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03160  Na+/melibiose symporter-like transporter  35 
 
 		 419 aa  147  3e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3267  major facilitator transporter  32.6 
 
 		 415 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0780681  normal  0.364964 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3554  major facilitator transporter  31.48 
 
 		 423 aa  146  6e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1832  glycoside-Pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  30.46 
 
 		 353 aa  142  9e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0506  putative permease  36.67 
 
 		 210 aa  140  6e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0806  major facilitator transporter  31.13 
 
 		 419 aa  139  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0255  major facilitator transporter  33.83 
 
 		 440 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2528  major facilitator superfamily MFS_1  29.22 
 
 		 451 aa  128  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1439  major facilitator superfamily MFS_1  32.11 
 
 		 426 aa  126  8.000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0835777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2779  major facilitator transporter  30.71 
 
 		 443 aa  125  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.617635  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3224  major facilitator superfamily MFS_1  32.47 
 
 		 433 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0454  major facilitator superfamily MFS_1  27.93 
 
 		 404 aa  105  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.1922  normal  0.684757 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2534  major facilitator superfamily MFS_1  29.26 
 
 		 446 aa  105  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2955  major facilitator superfamily MFS_1  28.35 
 
 		 405 aa  97.4  5e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4387  major facilitator superfamily MFS_1  26.68 
 
 		 429 aa  92  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.591192  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1836  major facilitator transporter  29.56 
 
 		 440 aa  90.9  4e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.860837  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1330  Na+/sugar symporter  26.74 
 
 		 545 aa  90.5  5e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2450  major facilitator superfamily MFS_1  26.81 
 
 		 407 aa  87  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.557384  normal  0.479748 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0892  major facilitator transporter  29.03 
 
 		 424 aa  73.2  0.000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.805867  normal  0.497197 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1610  major facilitator transporter  28.25 
 
 		 404 aa  70.5  0.00000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14174  predicted protein  23.3 
 
 		 405 aa  65.1  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0921  major facilitator transporter  25.07 
 
 		 402 aa  64.3  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1877  major facilitator transporter  30.84 
 
 		 458 aa  60.5  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1135  major facilitator transporter  27.39 
 
 		 407 aa  60.5  0.00000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2885  major facilitator transporter  20.62 
 
 		 432 aa  60.5  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00035649  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0798  transporter, putative  25.56 
 
 		 442 aa  58.9  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1599  major facilitator transporter  23.59 
 
 		 421 aa  57.8  0.0000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0864  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 441 aa  57.4  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0599  transporter, putative  26.71 
 
 		 501 aa  56.6  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.870524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2302  major facilitator superfamily MFS_1  28.64 
 
 		 404 aa  56.6  0.0000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3953  major facilitator superfamily MFS_1  33.03 
 
 		 457 aa  56.2  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.210656 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0523  major facilitator transporter  21.05 
 
 		 416 aa  55.8  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0616  major facilitator superfamily MFS_1  22.46 
 
 		 443 aa  55.1  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0461422  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3149  major facilitator superfamily MFS_1  33.06 
 
 		 460 aa  55.8  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2347  major facilitator transporter  23.86 
 
 		 551 aa  53.5  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06034  hypothetical protein  34.48 
 
 		 360 aa  53.5  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0894  major facilitator superfamily MFS_1  26.13 
 
 		 403 aa  53.5  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2336  major facilitator transporter  23.86 
 
 		 551 aa  53.1  0.000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2011  major facilitator superfamily MFS_1  23.86 
 
 		 551 aa  53.1  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000990966  hitchhiker  0.000202625 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2452  major facilitator transporter  23.86 
 
 		 551 aa  53.1  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09090  arabinose efflux permease family protein  26.16 
 
 		 434 aa  52  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0241408  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1870  major facilitator transporter  26.11 
 
 		 531 aa  52  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2108  major facilitator transporter  26.11 
 
 		 531 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.753085 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1925  major facilitator transporter  25.97 
 
 		 531 aa  52.4  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1657  major facilitator transporter  27.89 
 
 		 518 aa  52.4  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3497  major facilitator transporter  27.22 
 
 		 399 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.405337  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4161  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  30.9 
 
 		 433 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.253916 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1403  major facilitator transporter  28.8 
 
 		 505 aa  50.8  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.206645  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1015  major facilitator transporter  26.24 
 
 		 502 aa  50.1  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2458  transporter, putative  24.71 
 
 		 529 aa  50.1  0.00009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0200  major facilitator superfamily MFS_1  22.8 
 
 		 415 aa  50.1  0.00009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02413  sugar transporter  31.13 
 
 		 443 aa  49.3  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2003  major facilitator transporter  25.81 
 
 		 530 aa  49.3  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2187  major facilitator transporter  25.45 
 
 		 502 aa  49.3  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1063  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  30.34 
 
 		 432 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2241  major facilitator family transporter  27.19 
 
 		 418 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0318  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.15 
 
 		 402 aa  48.5  0.0002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4092  protein of unknown function DUF894, DitE  31.87 
 
 		 519 aa  48.9  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.146023  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06019  conserved hypothetical protein  28.57 
 
 		 483 aa  48.5  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00615305 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2816  major facilitator superfamily protein  34.23 
 
 		 459 aa  47.8  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1791  major facilitator superfamily MFS_1  22.3 
 
 		 420 aa  48.1  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0793  major facilitator superfamily MFS_1  28.25 
 
 		 397 aa  48.1  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.351489  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0267  hypothetical protein  29.3 
 
 		 434 aa  47.8  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0806  major facilitator transporter  24.66 
 
 		 396 aa  47.4  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.674294 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2691  general substrate transporter  31.85 
 
 		 445 aa  47.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1500  major facilitator transporter  24.32 
 
 		 448 aa  47.4  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.21091 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1458  metabolite-proton symporter  30.11 
 
 		 432 aa  47  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.202966  normal  0.170493 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1089  major facilitator superfamily MFS_1  30.56 
 
 		 509 aa  47  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.339374  normal  0.270172 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0396  major facilitator superfamily MFS_1  30.63 
 
 		 417 aa  47  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.786385  decreased coverage  4.1004499999999995e-20 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0391  major facilitator superfamily MFS_1  30.63 
 
 		 417 aa  47  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21713  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1406  major facilitator transporter  33.68 
 
 		 401 aa  47  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000773977  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0388  major facilitator superfamily MFS_1  30.63 
 
 		 417 aa  47  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000620465 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3242  major facilitator superfamily MFS_1  28.24 
 
 		 401 aa  47  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.42 
 
 		 474 aa  47  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2202  major facilitator transporter  25.97 
 
 		 551 aa  46.6  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000401875 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0451  major facilitator superfamily transporter  30.63 
 
 		 417 aa  47  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.82484e-20 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05075  putative sugar transporter  27.86 
 
 		 507 aa  47  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0544446  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0729  major facilitator transporter  24.73 
 
 		 420 aa  47  0.0007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.463384  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0409  major facilitator superfamily MFS_1  30.63 
 
 		 417 aa  47  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000062799 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2741  general substrate transporter  28.11 
 
 		 431 aa  46.6  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.879641  normal  0.395533 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3885  major facilitator superfamily MFS_1  30.94 
 
 		 403 aa  46.6  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.37466  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5039  major facilitator transporter  31.52 
 
 		 410 aa  46.6  0.0009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.582294  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4605  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.86 
 
 		 478 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000135395  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4961  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.86 
 
 		 478 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262919  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1241  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein, putative  32.98 
 
 		 408 aa  45.8  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0415  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  22.86 
 
 		 479 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00273768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10470  putative MFS transporter  27.56 
 
 		 402 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2204  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.4 
 
 		 402 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4415  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  38.89 
 
 		 552 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4845  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  22.86 
 
 		 431 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000942514  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>