110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1836 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1836  major facilitator transporter  100 
 
 		 440 aa  855    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.860837  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2534  major facilitator superfamily MFS_1  34.29 
 
 		 446 aa  216  7e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2528  major facilitator superfamily MFS_1  34.45 
 
 		 451 aa  207  3e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0806  major facilitator transporter  32.78 
 
 		 419 aa  205  1e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1988  major facilitator superfamily MFS_1  31.95 
 
 		 425 aa  195  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0427  major facilitator superfamily MFS_1  31.34 
 
 		 426 aa  183  5.0000000000000004e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3554  major facilitator transporter  31.48 
 
 		 423 aa  175  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3996  major facilitator transporter  31 
 
 		 438 aa  166  6.9999999999999995e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4281  major facilitator superfamily MFS_1  31.46 
 
 		 423 aa  163  5.0000000000000005e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.502977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3775  major facilitator superfamily MFS_1  32.22 
 
 		 425 aa  157  3e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0034  major facilitator superfamily MFS_1  30.86 
 
 		 435 aa  157  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0255  major facilitator transporter  29.19 
 
 		 440 aa  152  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4387  major facilitator superfamily MFS_1  31.27 
 
 		 429 aa  147  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.591192  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2779  major facilitator transporter  30.96 
 
 		 443 aa  144  3e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.617635  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3267  major facilitator transporter  28.93 
 
 		 415 aa  144  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0780681  normal  0.364964 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6833  transporter, major facilitator superfamily  30.28 
 
 		 423 aa  129  8.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.821608  normal  0.570568 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0454  major facilitator superfamily MFS_1  31.38 
 
 		 404 aa  120  3e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.1922  normal  0.684757 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02710  Major Facilitator Superfamily transporter  30.3 
 
 		 428 aa  119  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199882  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3224  major facilitator superfamily MFS_1  31.98 
 
 		 433 aa  113  7.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0846  glycoside-Pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  25.89 
 
 		 416 aa  112  9e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03160  Na+/melibiose symporter-like transporter  30.4 
 
 		 419 aa  110  5e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2450  major facilitator superfamily MFS_1  30.71 
 
 		 407 aa  108  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.557384  normal  0.479748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1439  major facilitator superfamily MFS_1  28.21 
 
 		 426 aa  109  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0835777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2979  major facilitator superfamily MFS_1  28.33 
 
 		 421 aa  100  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0876079  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0892  major facilitator transporter  31.03 
 
 		 424 aa  80.5  0.00000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.805867  normal  0.497197 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2955  major facilitator superfamily MFS_1  28.4 
 
 		 405 aa  79.7  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1330  Na+/sugar symporter  23.44 
 
 		 545 aa  71.6  0.00000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1832  glycoside-Pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  23.85 
 
 		 353 aa  70.9  0.00000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1610  major facilitator transporter  26.6 
 
 		 404 aa  67.4  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5086  major facilitator superfamily MFS_1  31.61 
 
 		 457 aa  61.2  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0501179  normal  0.911731 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1657  major facilitator transporter  27.67 
 
 		 518 aa  59.3  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  26.57 
 
 		 440 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14174  predicted protein  21.72 
 
 		 405 aa  59.3  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0506  putative permease  25.64 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05075  putative sugar transporter  29.45 
 
 		 507 aa  55.8  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0544446  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2738  major facilitator transporter  29.49 
 
 		 510 aa  55.1  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.934726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4405  major facilitator transporter  29.18 
 
 		 421 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.9798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0290  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  38.57 
 
 		 472 aa  55.8  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000222424  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2003  major facilitator transporter  29 
 
 		 530 aa  54.7  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45818  predicted protein  24.89 
 
 		 583 aa  53.9  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0729495  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1403  major facilitator transporter  35 
 
 		 505 aa  53.9  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.206645  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1015  major facilitator transporter  31.07 
 
 		 502 aa  53.9  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0599  transporter, putative  27.52 
 
 		 501 aa  52.8  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.870524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1776  major facilitator transporter  28 
 
 		 519 aa  52.4  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0516559  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3461  major facilitator superfamily MFS_1  27 
 
 		 405 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01510  conserved hypothetical protein  34.72 
 
 		 459 aa  52.4  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2347  major facilitator transporter  27 
 
 		 551 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2336  major facilitator transporter  27 
 
 		 551 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2452  major facilitator transporter  27 
 
 		 551 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2011  major facilitator superfamily MFS_1  27 
 
 		 551 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000990966  hitchhiker  0.000202625 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3220  major facilitator superfamily MFS_1  25.77 
 
 		 463 aa  52  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0542188  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  26.87 
 
 		 416 aa  51.2  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  25.37 
 
 		 435 aa  51.6  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3525  major facilitator superfamily MFS_1  26.41 
 
 		 404 aa  51.2  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.63708  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1886  major facilitator transporter  31.07 
 
 		 501 aa  49.7  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.156331  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1500  major facilitator transporter  32.69 
 
 		 448 aa  49.3  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.21091 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5520  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.2 
 
 		 502 aa  49.3  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4087  major facilitator transporter  27.01 
 
 		 514 aa  49.3  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2458  transporter, putative  28 
 
 		 529 aa  48.9  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2859  major facilitator transporter  34.34 
 
 		 381 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1870  major facilitator transporter  27 
 
 		 531 aa  48.9  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2108  major facilitator transporter  27 
 
 		 531 aa  48.9  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.753085 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1925  major facilitator transporter  27 
 
 		 531 aa  49.3  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3264  hypothetical protein  24.65 
 
 		 408 aa  48.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0864  major facilitator transporter  34.41 
 
 		 441 aa  48.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1408  major facilitator superfamily MFS_1  27.78 
 
 		 401 aa  48.5  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4340  major facilitator transporter  23.19 
 
 		 480 aa  47.8  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.199167  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2202  major facilitator transporter  27.47 
 
 		 551 aa  47.8  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000401875 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02413  sugar transporter  39.66 
 
 		 443 aa  47.8  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01889  sugar transporter  29.59 
 
 		 493 aa  47.8  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.660327  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5716  major facilitator transporter  28.45 
 
 		 482 aa  47  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1874  major facilitator transporter  31.03 
 
 		 524 aa  47.4  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322942  normal  0.129685 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3282  major facilitator superfamily MFS_1  30.94 
 
 		 424 aa  47  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.395947 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0682  major facilitator superfamily MFS_1  26.46 
 
 		 397 aa  46.6  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2461  major facilitator superfamily MFS_1  29.49 
 
 		 424 aa  46.6  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.23997  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3378  major facilitator transporter  26.5 
 
 		 400 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0921  major facilitator transporter  25.72 
 
 		 402 aa  46.6  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1729  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 423 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0041  major facilitator superfamily permease  35 
 
 		 471 aa  45.8  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000141077  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1776  major facilitator superfamily transporter  27.27 
 
 		 423 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1708  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 423 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.841617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0287  major facilitator superfamily MFS_1  29.88 
 
 		 455 aa  46.2  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1877  major facilitator transporter  30.21 
 
 		 458 aa  45.8  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6139  major facilitator superfamily permease  29.67 
 
 		 426 aa  45.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2187  major facilitator transporter  27.34 
 
 		 502 aa  45.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1387  major facilitator superfamily transport protein  34.48 
 
 		 468 aa  45.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0294045  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04316  MFS myo-inositol transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06080)  29.85 
 
 		 517 aa  45.1  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.38765  normal  0.214777 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0248  major facilitator transporter  41.07 
 
 		 486 aa  45.1  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.135747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3120  major facilitator transporter  31.52 
 
 		 472 aa  44.7  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.448872  normal  0.243798 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5071  major facilitator transporter  28.69 
 
 		 470 aa  44.7  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844572  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0200  major facilitator superfamily MFS_1  22.61 
 
 		 415 aa  44.7  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  27.13 
 
 		 391 aa  44.7  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_91253  glucose transporter/sensor  32.86 
 
 		 528 aa  44.7  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2885  major facilitator transporter  37.29 
 
 		 432 aa  44.3  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00035649  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01240  sugar transporter  34.85 
 
 		 428 aa  44.3  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.686511  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1522  major facilitator superfamily MFS_1  23.39 
 
 		 426 aa  44.7  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.101861  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6851  amino acid/peptide transporter  37.38 
 
 		 498 aa  44.3  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0689877 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0134  amino acid/peptide transporter  33.97 
 
 		 489 aa  43.9  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3528  major facilitator transporter  28.69 
 
 		 468 aa  43.9  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2441  transporter, putative  35.29 
 
 		 453 aa  43.9  0.006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0973262  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>