93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2450 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_2450  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
407 aa  794    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.557384  normal  0.479748 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2955  major facilitator superfamily MFS_1  42.54 
 
 
405 aa  268  1e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0892  major facilitator transporter  41.69 
 
 
424 aa  263  4e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.805867  normal  0.497197 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0454  major facilitator superfamily MFS_1  36.52 
 
 
404 aa  253  4.0000000000000004e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.1922  normal  0.684757 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0255  major facilitator transporter  31.46 
 
 
440 aa  127  3e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3996  major facilitator transporter  29.97 
 
 
438 aa  121  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1988  major facilitator superfamily MFS_1  28.78 
 
 
425 aa  117  5e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3775  major facilitator superfamily MFS_1  29.2 
 
 
425 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3267  major facilitator transporter  29.73 
 
 
415 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0780681  normal  0.364964 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0806  major facilitator transporter  28.64 
 
 
419 aa  109  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1439  major facilitator superfamily MFS_1  30.05 
 
 
426 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0835777  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0427  major facilitator superfamily MFS_1  31.2 
 
 
426 aa  105  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4281  major facilitator superfamily MFS_1  29.43 
 
 
423 aa  104  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.502977  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0034  major facilitator superfamily MFS_1  26.24 
 
 
435 aa  103  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2979  major facilitator superfamily MFS_1  27.54 
 
 
421 aa  100  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0876079  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3224  major facilitator superfamily MFS_1  30.74 
 
 
433 aa  100  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6833  transporter, major facilitator superfamily  28.28 
 
 
423 aa  99.8  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.821608  normal  0.570568 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3554  major facilitator transporter  27.49 
 
 
423 aa  99.4  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02710  Major Facilitator Superfamily transporter  27.39 
 
 
428 aa  92  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199882  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1836  major facilitator transporter  29.92 
 
 
440 aa  90.9  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.860837  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2779  major facilitator transporter  28.94 
 
 
443 aa  90.5  5e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.617635  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2528  major facilitator superfamily MFS_1  25.37 
 
 
451 aa  87.8  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14174  predicted protein  22.62 
 
 
405 aa  81.6  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0846  glycoside-Pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  25.89 
 
 
416 aa  81.3  0.00000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03160  Na+/melibiose symporter-like transporter  25.94 
 
 
419 aa  73.9  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2534  major facilitator superfamily MFS_1  27.42 
 
 
446 aa  73.6  0.000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1610  major facilitator transporter  26 
 
 
404 aa  71.6  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0616  major facilitator superfamily MFS_1  23.45 
 
 
443 aa  67  0.0000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0461422  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02413  sugar transporter  28.5 
 
 
443 aa  62.4  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4387  major facilitator superfamily MFS_1  24.32 
 
 
429 aa  61.2  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.591192  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0805  major facilitator family transporter  22.76 
 
 
417 aa  61.2  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.03228  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1620  major facilitator superfamily MFS_1  25.29 
 
 
419 aa  55.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00719862  normal  0.0630669 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5086  major facilitator superfamily MFS_1  23.47 
 
 
457 aa  53.9  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0501179  normal  0.911731 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1472  major facilitator superfamily MFS_1  23.15 
 
 
419 aa  53.9  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.905727  normal  0.384031 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0506  putative permease  24.44 
 
 
210 aa  53.9  0.000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01240  sugar transporter  26.18 
 
 
428 aa  53.5  0.000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.686511  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0601  major facilitator superfamily MFS_1  23.53 
 
 
406 aa  53.5  0.000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1700  major facilitator superfamily MFS_1  22.48 
 
 
391 aa  53.1  0.000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1056  major facilitator transporter  24.43 
 
 
396 aa  53.1  0.000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0999083  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45818  predicted protein  24.83 
 
 
583 aa  52.8  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0729495  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3497  major facilitator transporter  25 
 
 
399 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.405337  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0921  major facilitator transporter  21.11 
 
 
402 aa  53.1  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2064  major facilitator transporter  26.38 
 
 
403 aa  52  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0729  major facilitator transporter  21.74 
 
 
420 aa  52  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.463384  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_709  permease of the major facilitator superfamily  21.8 
 
 
420 aa  52  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.768296  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1865  major facilitator transporter  27.41 
 
 
401 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.418414  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1654  major facilitator transporter  21.33 
 
 
416 aa  49.7  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1765  major facilitator transporter  22.82 
 
 
376 aa  48.5  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0023  major facilitator transporter  25.78 
 
 
409 aa  48.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1522  major facilitator superfamily MFS_1  22.22 
 
 
426 aa  47.8  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.101861  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3447  major facilitator transporter  31.82 
 
 
476 aa  47  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2223  major facilitator superfamily MFS_1  29.61 
 
 
445 aa  47  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00013617  hitchhiker  0.000156735 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3862  major facilitator transporter  26.15 
 
 
453 aa  46.6  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0984  major facilitator transporter  23.73 
 
 
404 aa  47  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2594  major facilitator transporter  25.45 
 
 
395 aa  46.6  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2241  major facilitator family transporter  24.31 
 
 
418 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113649  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0744  major facilitator transporter  24.32 
 
 
433 aa  45.8  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0364296  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0698  major facilitator transporter  24.34 
 
 
447 aa  45.8  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1015  major facilitator transporter  29.31 
 
 
502 aa  45.8  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2524  major facilitator transporter  25 
 
 
661 aa  45.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.588333  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0749  major facilitator family transporter  24.34 
 
 
505 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000682732  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0697  quinolone resistence protein NorA  24.34 
 
 
506 aa  45.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000944811  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0684  quinolone resistence protein  24.34 
 
 
506 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00565548  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1824  major facilitator superfamily MFS_1  24.92 
 
 
385 aa  45.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000433141  normal  0.0989924 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3583  galactoside symporter  22.25 
 
 
475 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.012026 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0787  major facilitator family transporter  24.34 
 
 
399 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000257301  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1166  major facilitator transporter  24.39 
 
 
421 aa  45.1  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1657  major facilitator transporter  25.23 
 
 
518 aa  45.4  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0881  major facilitator family transporter  24.34 
 
 
400 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19471e-35 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1850  major facilitator superfamily MFS_1  32.89 
 
 
417 aa  45.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2007  major facilitator transporter  24.36 
 
 
423 aa  45.1  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.28785 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4843  major facilitator transporter  35.71 
 
 
442 aa  44.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000178164  normal  0.0122394 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1403  major facilitator transporter  24.36 
 
 
505 aa  44.7  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.206645  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1607  major facilitator transporter  35.71 
 
 
442 aa  44.7  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.164124 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5349  major facilitator superfamily MFS_1  31.91 
 
 
394 aa  45.1  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal  0.784079 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1550  major facilitator superfamily transporter  24.83 
 
 
426 aa  44.3  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00464954 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2003  major facilitator transporter  24.46 
 
 
530 aa  44.3  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3161  major facilitator superfamily MFS_1  32.46 
 
 
442 aa  44.3  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.586334 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2454  major facilitator transporter  26.32 
 
 
389 aa  44.3  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117931  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1588  major facilitator transporter  35.71 
 
 
442 aa  44.3  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1790  major facilitator transporter  29.03 
 
 
403 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1832  glycoside-Pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  21.45 
 
 
353 aa  43.9  0.005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1653  major facilitator transporter  22.97 
 
 
388 aa  43.9  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1174  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
409 aa  43.9  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.148034  normal  0.0846365 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1735  major facilitator transporter  33.61 
 
 
443 aa  43.5  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320526  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6190  major facilitator transporter  24.88 
 
 
398 aa  43.5  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2985  major facilitator superfamily MFS_1  33.06 
 
 
424 aa  43.5  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.124537 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0950  major facilitator family transporter  24.19 
 
 
400 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000143189  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  26.5 
 
 
387 aa  43.1  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2281  major facilitator superfamily MFS_1  22.78 
 
 
392 aa  43.1  0.008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.976851  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2676  major facilitator transporter  22.49 
 
 
396 aa  43.1  0.009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.149282  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2117  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 
391 aa  43.1  0.009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000191868  normal  0.363164 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0879  major facilitator family transporter  24.19 
 
 
400 aa  43.1  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000268355  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>