73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1015 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1015  major facilitator transporter  100 
 
 		 502 aa  1008    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1403  major facilitator transporter  54.42 
 
 		 505 aa  565  1e-160  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.206645  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05075  putative sugar transporter  55.53 
 
 		 507 aa  564  1.0000000000000001e-159  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0544446  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2187  major facilitator transporter  55.31 
 
 		 502 aa  560  1e-158  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2458  transporter, putative  53.68 
 
 		 529 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1870  major facilitator transporter  54.42 
 
 		 531 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2108  major facilitator transporter  54.6 
 
 		 531 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.753085 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1776  major facilitator transporter  53.92 
 
 		 519 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0516559  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2452  major facilitator transporter  54.4 
 
 		 551 aa  538  1e-151  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2336  major facilitator transporter  54.2 
 
 		 551 aa  535  1e-151  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2011  major facilitator superfamily MFS_1  54.4 
 
 		 551 aa  538  1e-151  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000990966  hitchhiker  0.000202625 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2347  major facilitator transporter  54.4 
 
 		 551 aa  537  1e-151  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2202  major facilitator transporter  53.23 
 
 		 551 aa  537  1e-151  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000401875 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1925  major facilitator transporter  54.89 
 
 		 531 aa  536  1e-151  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1874  major facilitator transporter  54.21 
 
 		 524 aa  535  1e-150  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322942  normal  0.129685 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0599  transporter, putative  54.95 
 
 		 501 aa  533  1e-150  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.870524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1657  major facilitator transporter  54.01 
 
 		 518 aa  529  1e-149  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2003  major facilitator transporter  52.2 
 
 		 530 aa  528  1e-148  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2738  major facilitator transporter  50.3 
 
 		 510 aa  484  1e-135  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.934726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1021  major facilitator superfamily MFS_1  51.41 
 
 		 495 aa  479  1e-134  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1886  major facilitator transporter  51.7 
 
 		 501 aa  472  1e-132  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.156331  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4087  major facilitator transporter  54.31 
 
 		 514 aa  452  1.0000000000000001e-126  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0596  major facilitator transporter  48.32 
 
 		 500 aa  413  1e-114  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.377823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5086  major facilitator superfamily MFS_1  43.03 
 
 		 457 aa  382  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0501179  normal  0.911731 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01889  sugar transporter  35.2 
 
 		 493 aa  330  5.0000000000000004e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.660327  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1089  major facilitator superfamily MFS_1  36.84 
 
 		 509 aa  326  7e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.339374  normal  0.270172 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0975  hypothetical protein  35.32 
 
 		 498 aa  317  2e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.798408  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01240  sugar transporter  34.93 
 
 		 428 aa  266  5.999999999999999e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.686511  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0864  major facilitator transporter  54.35 
 
 		 441 aa  251  3e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1500  major facilitator transporter  54.46 
 
 		 448 aa  249  6e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.21091 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0893  major facilitator superfamily permease  30.22 
 
 		 450 aa  205  1e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0994  major facilitator superfamily permease  31.03 
 
 		 450 aa  205  2e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.211502  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1614  major facilitator transporter  30.55 
 
 		 448 aa  204  3e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000115723  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0898  major facilitator superfamily permease  27.79 
 
 		 454 aa  188  2e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.880726  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0053  major facilitator transporter  38.49 
 
 		 449 aa  176  7e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000090495  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1877  major facilitator transporter  40.99 
 
 		 458 aa  176  9.999999999999999e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0832  major facilitator superfamily permease  40.77 
 
 		 453 aa  175  1.9999999999999998e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000561592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0087  major facilitator transporter  37.5 
 
 		 457 aa  172  1e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000315537  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0041  major facilitator superfamily permease  33.92 
 
 		 471 aa  169  1e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000141077  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0084  major facilitator transporter  37.77 
 
 		 461 aa  169  1e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380135  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2441  transporter, putative  36.24 
 
 		 453 aa  162  9e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0973262  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3953  major facilitator superfamily MFS_1  41.9 
 
 		 457 aa  161  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.210656 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02413  sugar transporter  40.8 
 
 		 443 aa  154  2.9999999999999998e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01510  conserved hypothetical protein  30.72 
 
 		 459 aa  72  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02289  sucrose transporter, putative (Eurofung)  26.32 
 
 		 635 aa  66.2  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1599  major facilitator transporter  26 
 
 		 421 aa  64.3  0.000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2049  Na+/melibiose symporter and related transporters-like protein  29.95 
 
 		 469 aa  64.3  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal  0.648168 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1406  major facilitator transporter  21.54 
 
 		 401 aa  59.3  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000773977  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0523  major facilitator transporter  25.63 
 
 		 416 aa  56.2  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3149  major facilitator superfamily MFS_1  29.14 
 
 		 460 aa  56.6  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0034  major facilitator superfamily MFS_1  29.41 
 
 		 435 aa  55.1  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0200  major facilitator superfamily MFS_1  22.71 
 
 		 415 aa  54.3  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0290  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  27.27 
 
 		 472 aa  53.1  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000222424  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01690  conserved hypothetical protein  24.1 
 
 		 674 aa  52.4  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.887535  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2885  major facilitator transporter  21.79 
 
 		 432 aa  50.8  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00035649  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0454  major facilitator superfamily MFS_1  30.33 
 
 		 404 aa  50.8  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.1922  normal  0.684757 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0575  major facilitator transporter  25 
 
 		 461 aa  50.4  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3738  hypothetical protein  23.76 
 
 		 467 aa  50.1  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00183877  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02710  Major Facilitator Superfamily transporter  26.24 
 
 		 428 aa  50.1  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1610  major facilitator transporter  30.59 
 
 		 404 aa  48.9  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1269  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  28.24 
 
 		 465 aa  49.3  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.727469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0248  major facilitator transporter  31.4 
 
 		 486 aa  48.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.135747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14174  predicted protein  27.06 
 
 		 405 aa  47.8  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4387  major facilitator superfamily MFS_1  26.29 
 
 		 429 aa  47.4  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.591192  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4221  major facilitator transporter  25.12 
 
 		 472 aa  47.4  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.218171  normal  0.657626 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3267  major facilitator transporter  31.72 
 
 		 415 aa  47  0.0009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0780681  normal  0.364964 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0846  glycoside-Pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  26.85 
 
 		 416 aa  47  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02748  cation symporter  28.19 
 
 		 462 aa  46.2  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2450  major facilitator superfamily MFS_1  29.82 
 
 		 407 aa  45.8  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.557384  normal  0.479748 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2464  major facilitator transporter  27.03 
 
 		 417 aa  44.7  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.532974  normal  0.0764442 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1271  major facilitator transporter  32.77 
 
 		 403 aa  44.7  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.879022 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0353  major facilitator transporter  23.43 
 
 		 464 aa  43.9  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.939472  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4939  major facilitator transporter  30 
 
 		 414 aa  43.5  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>