37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNH01690 on replicon NC_006693
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006693  CNH01690  conserved hypothetical protein  100 
 
 
674 aa  1385    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.887535  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02289  sucrose transporter, putative (Eurofung)  31.3 
 
 
635 aa  288  2e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01510  conserved hypothetical protein  35.65 
 
 
459 aa  191  5e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02982  sucrose transporter, putative (Eurofung)  22.5 
 
 
516 aa  92.8  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5086  major facilitator superfamily MFS_1  23.36 
 
 
457 aa  67  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0501179  normal  0.911731 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1500  major facilitator transporter  24.43 
 
 
448 aa  61.6  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.21091 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0975  hypothetical protein  22.15 
 
 
498 aa  60.1  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.798408  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01889  sugar transporter  23.9 
 
 
493 aa  59.3  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.660327  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0864  major facilitator transporter  21.52 
 
 
441 aa  59.3  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1657  major facilitator transporter  29.55 
 
 
518 aa  53.5  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1015  major facilitator transporter  24.62 
 
 
502 aa  52  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1886  major facilitator transporter  29.41 
 
 
501 aa  51.2  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.156331  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1089  major facilitator superfamily MFS_1  34.09 
 
 
509 aa  50.8  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.339374  normal  0.270172 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1403  major facilitator transporter  25.82 
 
 
505 aa  50.1  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.206645  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1877  major facilitator transporter  29.36 
 
 
458 aa  50.1  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0084  major facilitator transporter  20.44 
 
 
461 aa  49.7  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380135  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4087  major facilitator transporter  32.26 
 
 
514 aa  49.3  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2202  major facilitator transporter  25.49 
 
 
551 aa  49.7  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000401875 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2441  transporter, putative  23.65 
 
 
453 aa  49.7  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0973262  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1874  major facilitator transporter  20.23 
 
 
524 aa  48.5  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322942  normal  0.129685 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2187  major facilitator transporter  30.38 
 
 
502 aa  48.1  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0599  transporter, putative  29.73 
 
 
501 aa  47.8  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.870524  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1614  major facilitator transporter  22.06 
 
 
448 aa  47.4  0.0008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000115723  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2003  major facilitator transporter  26.19 
 
 
530 aa  47.4  0.0008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2011  major facilitator superfamily MFS_1  23 
 
 
551 aa  47  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000990966  hitchhiker  0.000202625 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3953  major facilitator superfamily MFS_1  24.01 
 
 
457 aa  47  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.210656 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2347  major facilitator transporter  23 
 
 
551 aa  46.6  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2452  major facilitator transporter  23 
 
 
551 aa  47  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2336  major facilitator transporter  23 
 
 
551 aa  47  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02413  sugar transporter  28.85 
 
 
443 aa  46.2  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1925  major facilitator transporter  26.83 
 
 
531 aa  46.2  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2108  major facilitator transporter  26.83 
 
 
531 aa  46.2  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.753085 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1870  major facilitator transporter  26.83 
 
 
531 aa  45.8  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01240  sugar transporter  51.22 
 
 
428 aa  45.8  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.686511  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1776  major facilitator transporter  28.41 
 
 
519 aa  45.1  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0516559  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05075  putative sugar transporter  27.27 
 
 
507 aa  44.7  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0544446  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0898  major facilitator superfamily permease  22.22 
 
 
454 aa  44.7  0.006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.880726  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>