71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1403 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_05075  putative sugar transporter  71.88 
 
 		 507 aa  769    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0544446  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1403  major facilitator transporter  100 
 
 		 505 aa  1014    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.206645  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1874  major facilitator transporter  59.72 
 
 		 524 aa  608  1e-173  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322942  normal  0.129685 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2347  major facilitator transporter  58.5 
 
 		 551 aa  597  1e-169  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1925  major facilitator transporter  57.26 
 
 		 531 aa  596  1e-169  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2452  major facilitator transporter  58.5 
 
 		 551 aa  597  1e-169  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2011  major facilitator superfamily MFS_1  58.5 
 
 		 551 aa  597  1e-169  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000990966  hitchhiker  0.000202625 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2458  transporter, putative  56.69 
 
 		 529 aa  596  1e-169  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2336  major facilitator transporter  58.3 
 
 		 551 aa  593  1e-168  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1870  major facilitator transporter  57.62 
 
 		 531 aa  589  1e-167  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2108  major facilitator transporter  57.06 
 
 		 531 aa  591  1e-167  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.753085 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2187  major facilitator transporter  58.03 
 
 		 502 aa  587  1e-166  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1776  major facilitator transporter  56.12 
 
 		 519 aa  580  1e-164  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0516559  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2003  major facilitator transporter  55.3 
 
 		 530 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1657  major facilitator transporter  55.84 
 
 		 518 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2202  major facilitator transporter  55.92 
 
 		 551 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000401875 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1015  major facilitator transporter  54.42 
 
 		 502 aa  565  1e-160  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0599  transporter, putative  53.72 
 
 		 501 aa  533  1e-150  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.870524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2738  major facilitator transporter  53.95 
 
 		 510 aa  525  1e-148  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.934726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1021  major facilitator superfamily MFS_1  54.91 
 
 		 495 aa  514  1e-144  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4087  major facilitator transporter  53.71 
 
 		 514 aa  488  1e-136  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1886  major facilitator transporter  49.47 
 
 		 501 aa  468  9.999999999999999e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.156331  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0596  major facilitator transporter  46.23 
 
 		 500 aa  411  1e-113  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.377823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01889  sugar transporter  38.12 
 
 		 493 aa  372  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.660327  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0975  hypothetical protein  36.62 
 
 		 498 aa  346  5e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.798408  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1089  major facilitator superfamily MFS_1  38.31 
 
 		 509 aa  345  2e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.339374  normal  0.270172 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5086  major facilitator superfamily MFS_1  55.46 
 
 		 457 aa  281  2e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0501179  normal  0.911731 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0864  major facilitator transporter  58.74 
 
 		 441 aa  275  2.0000000000000002e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1500  major facilitator transporter  59.35 
 
 		 448 aa  266  7e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.21091 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0994  major facilitator superfamily permease  42.5 
 
 		 450 aa  195  2e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.211502  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0893  major facilitator superfamily permease  43.3 
 
 		 450 aa  191  2.9999999999999997e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0053  major facilitator transporter  39.48 
 
 		 449 aa  187  3e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000090495  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0087  major facilitator transporter  39.47 
 
 		 457 aa  184  5.0000000000000004e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000315537  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01240  sugar transporter  44.85 
 
 		 428 aa  177  3e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.686511  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1877  major facilitator transporter  41.1 
 
 		 458 aa  176  7e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1614  major facilitator transporter  40.09 
 
 		 448 aa  175  9.999999999999999e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000115723  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0832  major facilitator superfamily permease  36.84 
 
 		 453 aa  167  4e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000561592  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2441  transporter, putative  37.21 
 
 		 453 aa  166  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0973262  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0041  major facilitator superfamily permease  36.91 
 
 		 471 aa  166  1.0000000000000001e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000141077  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3953  major facilitator superfamily MFS_1  42.2 
 
 		 457 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.210656 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0898  major facilitator superfamily permease  36.56 
 
 		 454 aa  159  1e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.880726  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0084  major facilitator transporter  35.53 
 
 		 461 aa  159  1e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380135  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02413  sugar transporter  38.2 
 
 		 443 aa  159  1e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01510  conserved hypothetical protein  30.41 
 
 		 459 aa  76.3  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0200  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 415 aa  65.1  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02289  sucrose transporter, putative (Eurofung)  24.73 
 
 		 635 aa  62.8  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0034  major facilitator superfamily MFS_1  38.46 
 
 		 435 aa  58.5  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1599  major facilitator transporter  28.03 
 
 		 421 aa  57.4  0.0000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1610  major facilitator transporter  34.07 
 
 		 404 aa  55.1  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0290  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.62 
 
 		 472 aa  51.2  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000222424  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0846  glycoside-Pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  27.43 
 
 		 416 aa  51.6  0.00004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2049  Na+/melibiose symporter and related transporters-like protein  25 
 
 		 469 aa  51.2  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal  0.648168 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02710  Major Facilitator Superfamily transporter  28.8 
 
 		 428 aa  50.8  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0523  major facilitator transporter  26.7 
 
 		 416 aa  50.8  0.00006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01690  conserved hypothetical protein  25.82 
 
 		 674 aa  50.4  0.00007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.887535  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0454  major facilitator superfamily MFS_1  26.83 
 
 		 404 aa  50.4  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.1922  normal  0.684757 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0575  major facilitator transporter  26.16 
 
 		 461 aa  48.5  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1406  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  28.66 
 
 		 471 aa  47.8  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.455319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1406  major facilitator transporter  24.16 
 
 		 401 aa  47  0.0009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000773977  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0427  major facilitator superfamily MFS_1  26 
 
 		 426 aa  46.2  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02748  cation symporter  26.11 
 
 		 462 aa  45.4  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2622  sugar transporter, glycoside-pentoside-hexuronide  35.38 
 
 		 479 aa  45.8  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.455215  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2885  major facilitator transporter  21.61 
 
 		 432 aa  45.1  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00035649  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3267  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 415 aa  44.7  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0780681  normal  0.364964 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2450  major facilitator superfamily MFS_1  24.36 
 
 		 407 aa  44.7  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.557384  normal  0.479748 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0248  major facilitator transporter  33.78 
 
 		 486 aa  44.7  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.135747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3554  major facilitator transporter  33.68 
 
 		 423 aa  44.7  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1245  Na+/xyloside symporter related transporter  29.51 
 
 		 467 aa  44.7  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3149  major facilitator superfamily MFS_1  25.6 
 
 		 460 aa  44.3  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3996  major facilitator transporter  31.45 
 
 		 438 aa  44.7  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14174  predicted protein  25.81 
 
 		 405 aa  43.9  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>