65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02413 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_02413  sugar transporter  100 
 
 		 443 aa  889    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1877  major facilitator transporter  50.89 
 
 		 458 aa  450  1e-125  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3953  major facilitator superfamily MFS_1  46.28 
 
 		 457 aa  380  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.210656 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01240  sugar transporter  45.83 
 
 		 428 aa  345  8e-94  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.686511  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1089  major facilitator superfamily MFS_1  39.6 
 
 		 509 aa  303  4.0000000000000003e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.339374  normal  0.270172 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0864  major facilitator transporter  41.57 
 
 		 441 aa  301  2e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1500  major facilitator transporter  37.67 
 
 		 448 aa  293  4e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.21091 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1021  major facilitator superfamily MFS_1  38.24 
 
 		 495 aa  260  4e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5086  major facilitator superfamily MFS_1  33.78 
 
 		 457 aa  242  9e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0501179  normal  0.911731 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2738  major facilitator transporter  34.07 
 
 		 510 aa  233  6e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.934726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1874  major facilitator transporter  31.89 
 
 		 524 aa  227  4e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322942  normal  0.129685 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1886  major facilitator transporter  32.19 
 
 		 501 aa  227  4e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.156331  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0975  hypothetical protein  32.15 
 
 		 498 aa  224  2e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.798408  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4087  major facilitator transporter  33.66 
 
 		 514 aa  216  8e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01889  sugar transporter  30.21 
 
 		 493 aa  211  3e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.660327  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0596  major facilitator transporter  32.52 
 
 		 500 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.377823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0893  major facilitator superfamily permease  30 
 
 		 450 aa  186  1.0000000000000001e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2441  transporter, putative  29.12 
 
 		 453 aa  182  1e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0973262  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0041  major facilitator superfamily permease  27.46 
 
 		 471 aa  181  2e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000141077  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0994  major facilitator superfamily permease  30.28 
 
 		 450 aa  181  2e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.211502  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0599  transporter, putative  41.86 
 
 		 501 aa  174  3.9999999999999995e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.870524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1614  major facilitator transporter  27.56 
 
 		 448 aa  172  1e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000115723  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0053  major facilitator transporter  27.54 
 
 		 449 aa  172  1e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000090495  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2187  major facilitator transporter  41.85 
 
 		 502 aa  164  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0087  major facilitator transporter  27.42 
 
 		 457 aa  162  1e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000315537  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05075  putative sugar transporter  42.08 
 
 		 507 aa  161  2e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0544446  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2003  major facilitator transporter  37.66 
 
 		 530 aa  161  2e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1657  major facilitator transporter  40.85 
 
 		 518 aa  161  3e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1403  major facilitator transporter  38.2 
 
 		 505 aa  159  9e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.206645  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1776  major facilitator transporter  39.25 
 
 		 519 aa  155  1e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0516559  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1015  major facilitator transporter  40.8 
 
 		 502 aa  154  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1870  major facilitator transporter  40.8 
 
 		 531 aa  155  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2108  major facilitator transporter  40.8 
 
 		 531 aa  155  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.753085 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2452  major facilitator transporter  40.3 
 
 		 551 aa  154  4e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2202  major facilitator transporter  38.79 
 
 		 551 aa  154  4e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000401875 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2011  major facilitator superfamily MFS_1  40.3 
 
 		 551 aa  154  4e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000990966  hitchhiker  0.000202625 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1925  major facilitator transporter  40.8 
 
 		 531 aa  154  4e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2336  major facilitator transporter  40.3 
 
 		 551 aa  153  5e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2347  major facilitator transporter  40.3 
 
 		 551 aa  153  5e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0084  major facilitator transporter  25.12 
 
 		 461 aa  151  3e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380135  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2458  transporter, putative  38.43 
 
 		 529 aa  150  6e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0898  major facilitator superfamily permease  24.34 
 
 		 454 aa  148  2.0000000000000003e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.880726  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0832  major facilitator superfamily permease  26.12 
 
 		 453 aa  145  2e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000561592  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01510  conserved hypothetical protein  23.99 
 
 		 459 aa  82  0.00000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02289  sucrose transporter, putative (Eurofung)  23.47 
 
 		 635 aa  73.9  0.000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2450  major facilitator superfamily MFS_1  28.5 
 
 		 407 aa  62.8  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.557384  normal  0.479748 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3289  major facilitator superfamily MFS_1  26.99 
 
 		 416 aa  54.7  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3996  major facilitator transporter  32.54 
 
 		 438 aa  51.2  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0892  major facilitator transporter  32.84 
 
 		 424 aa  50.1  0.00009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.805867  normal  0.497197 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02710  Major Facilitator Superfamily transporter  31.13 
 
 		 428 aa  48.9  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3858  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  30.43 
 
 		 469 aa  48.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.784369  normal  0.0678057 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4367  major facilitator transporter  27.6 
 
 		 493 aa  48.1  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0523  major facilitator transporter  29.59 
 
 		 416 aa  47  0.0007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3149  major facilitator superfamily MFS_1  25.58 
 
 		 460 aa  46.6  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1269  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  28.06 
 
 		 465 aa  46.2  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.727469  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01690  conserved hypothetical protein  34.25 
 
 		 674 aa  46.6  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.887535  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1599  major facilitator transporter  29.35 
 
 		 421 aa  45.8  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2955  major facilitator superfamily MFS_1  30.95 
 
 		 405 aa  45.1  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03160  Na+/melibiose symporter-like transporter  35 
 
 		 419 aa  44.7  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0200  major facilitator superfamily MFS_1  27.93 
 
 		 415 aa  44.7  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2378  major facilitator superfamily MFS_1  36 
 
 		 415 aa  44.3  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2464  major facilitator transporter  32.04 
 
 		 417 aa  44.7  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.532974  normal  0.0764442 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2816  major facilitator superfamily protein  35.44 
 
 		 459 aa  44.3  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2885  major facilitator transporter  39.53 
 
 		 432 aa  44.3  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00035649  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1071  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  26.13 
 
 		 445 aa  43.1  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>